| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1170 (0.970) | 30 (0.030) | 26/270 | 21.8 | 2.9% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | = 820924 | 940 (0.850) | intergenic (+251/‑254) | ps358/llmg_0854 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1066 total aligned reads displayed.
TGTGCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAATGTTG > AM406671/820776‑821072 | gtgCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTAcc > 1:4180345/1‑149 (MQ=255) tgctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCATTTGGTAGCTAACCTTTCGGTCGCTGGTTCTAGTCTAGCAAGAACTATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACct < 2:647042/149‑1 (MQ=25) ctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACctct > 1:2462651/1‑149 (MQ=255) tgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTg < 1:9782436/149‑1 (MQ=255) gcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGt > 1:748721/1‑149 (MQ=255) gcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCNCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGt > 1:5842692/1‑149 (MQ=255) gATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCGTAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGc < 1:6617269/149‑1 (MQ=255) gATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGc < 1:3558315/149‑1 (MQ=255) ttGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTa < 1:6066393/149‑1 (MQ=255) tGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAg > 1:7877707/1‑149 (MQ=255) gTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAgg < 2:925749/149‑1 (MQ=255) tCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGa < 2:9504801/149‑1 (MQ=255) tCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGa < 1:4851979/149‑1 (MQ=255) cATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGAt < 2:9819451/149‑1 (MQ=255) atatTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATa < 1:5503479/149‑1 (MQ=255) tatTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATag < 1:9479408/149‑1 (MQ=255) atTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATaga < 1:1733356/149‑1 (MQ=255) tttGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGt < 1:8474679/149‑1 (MQ=255) tCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTta > 1:8836032/1‑149 (MQ=255) ttAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTatat < 1:8284405/149‑1 (MQ=255) cAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaaa > 2:1689898/1‑149 (MQ=255) aGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaaaa < 2:8728285/149‑1 (MQ=255) aGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAg < 2:1254247/149‑1 (MQ=255) cTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCt > 2:6340236/1‑149 (MQ=255) aCCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGAt < 1:2873662/149‑1 (MQ=255) aCCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGAt > 2:4032130/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACa < 2:10342990/149‑1 (MQ=255) ttCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAg > 2:2664082/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAg < 1:195291/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGgta > 1:10417707/1‑149 (MQ=255) ggTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGgta < 1:4063142/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGgtag < 1:10096392/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGACCCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGgtagt < 2:594643/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTAc < 1:6299780/149‑1 (MQ=255) ggTTCGAGTACAGTAAGAGCCCTAATGCACCTTTGTAGCCCCTTTGTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGc < 2:8895531/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCa > 1:6423534/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCa < 2:3336370/149‑1 (MQ=255) ttCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTGAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCAt > 2:10163620/1‑149 (MQ=255) tCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATa < 2:4313249/149‑1 (MQ=255) tCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATa < 1:6195393/149‑1 (MQ=255) cAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATAtt > 2:2277877/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATAtt > 2:7476099/1‑149 (MQ=255) aGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTc > 1:1342659/1‑149 (MQ=255) aGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACaa < 1:9087212/149‑1 (MQ=255) aGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCACTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTATATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACaa < 2:2971713/149‑1 (MQ=255) aaCCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAta > 1:2276315/1‑149 (MQ=255) aTGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAtaaattaaa < 1:3234177/149‑1 (MQ=255) aTGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAtaaattaaa > 1:8926221/1‑149 (MQ=255) ccccTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAatat > 1:5265932/1‑149 (MQ=255) cccTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATAtt > 2:5051065/1‑149 (MQ=255) cccTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATAtt > 1:10304880/1‑149 (MQ=255) ccTTTGTAGCAACTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATAttt < 2:1550623/149‑1 (MQ=255) tttGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAg > 2:313104/1‑149 (MQ=255) ttGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAgg < 1:6744513/149‑1 (MQ=255) ttttgCCCTTTTTTATAAAATTGCTCTTTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATCTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGTTACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGa < 2:9668449/145‑1 (MQ=255) gTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATaaa < 1:3730981/120‑1 (MQ=255) aGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCa > 2:3785185/1‑149 (MQ=255) ccccTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGa > 1:9968653/1‑149 (MQ=255) ccccTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGa > 1:9335700/1‑149 (MQ=255) ccccTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGa > 2:3553118/1‑149 (MQ=255) ccTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAAt < 1:8638744/149‑1 (MQ=255) tttATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTATTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAAt < 1:1190448/149‑1 (MQ=255) tttATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAAt < 1:4703907/149‑1 (MQ=255) 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cATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGta > 2:1054021/1‑149 (MQ=255) tttAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGtata > 1:6968109/1‑149 (MQ=255) tttAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGtata > 2:2115619/1‑149 (MQ=255) tttAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGtata > 2:6807219/1‑149 (MQ=255) ttAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCACTAGAGGCTATGGGTATaa > 2:6093176/1‑149 (MQ=255) ttAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATaa < 1:1504864/149‑1 (MQ=255) aTGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATaaaaaa > 1:7716757/1‑149 (MQ=255) tGTTAGTTTTAAAGTAGTGACCTCTGTCGCTAGTATAGATTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAAt < 2:5477071/149‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTAATTTATATTAAAAAAGTAAAAGCTGATAAAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATAATTAAGAGCAGAATAAATAGAAGATATGGGTAAAAAAAATTa > 2:8076084/1‑149 (MQ=255) gTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACAt < 1:2547926/149‑1 (MQ=255) gTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACAt < 2:7921898/149‑1 (MQ=255) gTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACAt > 2:9025410/1‑149 (MQ=255) ttttAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATc < 1:7313342/149‑1 (MQ=255) tttAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCa < 1:4449623/149‑1 (MQ=255) ttAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCaa > 1:8081480/1‑149 (MQ=255) aaaGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAACTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAAtt < 2:4803572/149‑1 (MQ=255) aaGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAAttt > 1:10017964/1‑149 (MQ=255) ttATTTTCCCCGGCCGCTAGGATAGAGTGTTTTATTTTGAGCAAGTACAAGCGGATACAGGTAGGACGGCATAATATATGCTGAATAGATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTtat < 2:4647923/148‑1 (MQ=255) gTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTATAAGCTGATAGAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTtat < 2:19557/149‑1 (MQ=255) gTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTtat > 1:7090384/1‑149 (MQ=255) tATTTACCTCTTTCGCTAAGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGCATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTtata < 2:5318962/149‑1 (MQ=255) aCCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAtgtt > 2:573399/1‑149 (MQ=255) | TGTGCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAATGTTG > AM406671/820776‑821072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |