| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 1333548 = | NA (NA) | 144 (0.130) | 61/270 | 14.5 | 15.8% | intergenic (‑831/+481) | llmg_1358/llmg_1359 | conserved hypothetical protein/conserved hypothetical protein |
| ? | AM406671 | = 1380520 | 841 (0.700) | intergenic (‑457/+79) | llmg_1411/guaC | hypothetical protein/GMP reductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 880 total aligned reads displayed.
GAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCACT > AM406671/1333400‑1333682 | gAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATta > 2:8005559/1‑149 (MQ=255)gAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATta < 2:5516425/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTTTATAATTCAAAACGAATACAACAAAGTTTAGGTTAAAACACCCCAAGCCAATATTCGAAAACCTCAAAAAAAAAAAATTACTAAAAATGATACTAAAAAAAAAAAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATtat < 2:1997759/149‑1 (MQ=255) ttttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTcc < 1:5034018/149‑1 (MQ=255) ttttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTcc > 2:8106339/1‑149 (MQ=255) tttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTccc > 2:4066895/1‑149 (MQ=255) ttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCa > 1:2035860/1‑149 (MQ=255) tataATTCAAAACGGATCCATCCAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGAGACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCAc > 1:557484/1‑149 (MQ=255) tataATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCAc > 2:6387928/1‑149 (MQ=255) tataATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCAc > 2:349817/1‑149 (MQ=255) ataATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACg < 1:3362221/149‑1 (MQ=255) taATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACgg > 2:1044502/1‑149 (MQ=255) ttCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGtct > 2:3831681/1‑147 (MQ=255) cAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTtta > 1:8290896/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTCttat > 2:7396187/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGATCCATCAAAGTTTAGCTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGATCTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTttat < 1:5937753/149‑1 (MQ=255) aaaCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTttatt < 1:8093226/149‑1 (MQ=255) aCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTaa > 1:2909324/1‑149 (MQ=255) aCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTaa > 2:7489112/1‑149 (MQ=255) cGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAAc > 1:9799044/1‑149 (MQ=255) aTCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCtg > 1:3440393/1‑149 (MQ=255) aTCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCtg > 1:1632500/1‑149 (MQ=255) aTCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCtg > 1:6456875/1‑149 (MQ=255) ccATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCtgtg < 1:6833801/149‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAAt > 1:409903/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAAt < 2:9592613/149‑1 (MQ=255) aaaGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTTAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATa > 1:5729915/1‑149 (MQ=255) aaGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAg > 2:8864056/1‑149 (MQ=255) aGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAATCGTCAACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGt > 2:7023763/1‑149 (MQ=255) aGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGt > 2:6692370/1‑149 (MQ=255) aGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGt < 1:4763391/149‑1 (MQ=255) tAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGtatta < 1:3521768/149‑1 (MQ=255) gTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTatat > 2:2550051/1‑149 (MQ=255) ctcACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCaaaa > 1:1259044/1‑149 (MQ=255) ctcACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCaaaa > 1:6320900/1‑149 (MQ=255) tcACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAAt > 2:3332652/1‑149 (MQ=255) ccAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCAt > 1:8435563/1‑149 (MQ=255) aaaaCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTAGACTTAATGTAAATATAAATAATATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATa < 2:1190856/148‑1 (MQ=255) aaaCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAg < 1:9653930/149‑1 (MQ=255) aaaCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAg < 1:903776/149‑1 (MQ=255) aaCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGa < 2:10261749/149‑1 (MQ=255) ccAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGaaa > 1:7917755/1‑149 (MQ=255) cAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAt < 2:8587074/149‑1 (MQ=255) cAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAt > 1:8685838/1‑149 (MQ=255) aTTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAttt < 2:2382290/149‑1 (MQ=255) tttGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTc < 1:10088624/149‑1 (MQ=255) tGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATTATACTTCTTAAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAg < 2:6125261/149‑1 (MQ=255) tGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCACAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTGAg > 2:5870802/1‑149 (MQ=255) tGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAg < 2:9181489/149‑1 (MQ=255) gagaAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGt < 1:7408905/149‑1 (MQ=255) agaATACTTCTACTTAAATAAATTACCAAAAATAATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTATTATCAATATAAATAAGATTATCTTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAATTTTCATAGAAATTTCAGta < 2:659098/149‑1 (MQ=21) agaAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGta > 1:3060169/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCTTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGta < 2:10175258/147‑1 (MQ=255) aaaCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAACTGATACTTCTGGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGtaata < 1:7550137/149‑1 (MQ=255) aaaCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGtaata > 2:1549703/1‑149 (MQ=255) aCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATaaa < 1:5326586/149‑1 (MQ=255) cGTCTACTTAAATAAATTACTAAAACTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACGTGAGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATaaaa > 2:5737637/1‑149 (MQ=255) cGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTTTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATaaaa < 2:1759384/149‑1 (MQ=255) gTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAAt < 1:1049615/149‑1 (MQ=255) tCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATc > 2:2731637/1‑149 (MQ=255) cTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCg < 2:186075/149‑1 (MQ=255) cTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAAc > 2:7227590/1‑149 (MQ=255) ttAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACa > 2:8450860/1‑149 (MQ=255) ttAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACa > 1:2339761/1‑149 (MQ=255) ttAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACa > 2:9040909/1‑149 (MQ=255) aaataaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAt < 1:518841/149‑1 (MQ=255) aataaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAtt < 1:2816211/149‑1 (MQ=255) taaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTa > 2:3609501/1‑149 (MQ=255) taaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTa > 1:7753067/1‑149 (MQ=255) aatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAg < 2:7781109/149‑1 (MQ=255) tACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGaaa > 2:6879425/1‑149 (MQ=255) cTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGaaaaa < 1:1787811/149‑1 (MQ=255) aaaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAaga > 2:9484894/1‑149 (MQ=255) aaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAagag > 2:504038/1‑149 (MQ=255) aaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAagag > 1:8558379/1‑149 (MQ=255) tGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGcc < 1:2421756/149‑1 (MQ=255) aTACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGa < 1:9258081/149‑1 (MQ=255) aTACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGa > 2:2167149/1‑149 (MQ=255) aCTTCTTGAACTCAAACAACTTGACTTAATGCCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCAGAGCAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTCAGAAAAAAAGAGCCGAAt > 2:563615/1‑149 (MQ=17) aCTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATCAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAAt > 2:5308929/1‑149 (MQ=255) aCTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAAt > 2:9825016/1‑149 (MQ=255) tcttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGtt > 2:7113796/1‑149 (MQ=255) tcttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGtt < 2:4298574/149‑1 (MQ=255) tGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCgg > 1:9488019/1‑149 (MQ=255) tGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCgg > 1:2532472/1‑149 (MQ=255) aCTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGctc < 2:225662/149‑1 (MQ=255) aaaaaaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCa > 1:10016583/1‑149 (MQ=255) aaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGtt < 1:380144/149‑1 (MQ=255) tGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGAc > 2:4624206/1‑149 (MQ=40) tGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGAc < 2:4890062/149‑1 (MQ=40) aCTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACtt < 1:10278993/149‑1 (MQ=39) aCTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCAAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACtt < 1:6656383/149‑1 (MQ=255) cTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTta < 1:1461951/149‑1 (MQ=38) cTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTta < 1:7006878/149‑1 (MQ=38) ttAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTtat > 2:3119559/1‑149 (MQ=38) tAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTtata > 2:10031594/1‑149 (MQ=37) aaTGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTatat > 1:8886662/1‑149 (MQ=35) aaTGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTatat > 2:2922418/1‑149 (MQ=35) aaTGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTatat < 1:4534818/149‑1 (MQ=35) gTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATccc > 1:6155943/1‑149 (MQ=33) | GAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCACT > AM406671/1333400‑1333682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |