| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | = 2220751 | 1285 (1.070) | 15 (0.010) +AAGAAAAA |
12/278 | 27.1 | 1.2% | intergenic (+105/‑796) | ps507/ps506 | hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica |
| ? | AM406671 | 2220770 = | 1282 (1.060) | intergenic (+124/‑777) | ps507/ps506 | hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1313 total aligned reads displayed.
AGATTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTAAAAAAAGA > AM406671/2220603‑2220899 | aGATTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTa > 1:5666431/1‑149 (MQ=255) gATTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTaa < 2:6005256/149‑1 (MQ=255) gATTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTaa < 2:3941232/149‑1 (MQ=255) aTTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAAt < 1:1666618/149‑1 (MQ=255) ttAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATg < 1:3088757/149‑1 (MQ=255) ataaGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATgaga > 1:7650968/1‑149 (MQ=255) ataaGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATgaga > 1:3831131/1‑149 (MQ=255) taaGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaa > 1:5365250/1‑149 (MQ=255) taaGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaa > 1:9019813/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaag > 1:1223373/1‑149 (MQ=255) gTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaa < 2:7191637/149‑1 (MQ=255) tGTTTATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaaga < 2:610548/149‑1 (MQ=255) gTTTATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGaaaaaaaaaaagaa < 2:6547476/149‑1 (MQ=255) gTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaagaa > 1:6975607/1‑149 (MQ=255) ttGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaagaag < 2:9708743/149‑1 (MQ=255) tGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaagaaga > 2:1753159/1‑149 (MQ=255) gATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaagaagaa > 2:1150698/1‑149 (MQ=255) tattTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGagaagaaaaaagaagaaaaa < 1:1403481/149‑1 (MQ=255) tttttATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGCTTGAGTTGGTGGGATATAGTAATGAGaagaaaaaagaagaaaaaag > 2:517167/1‑149 (MQ=255) ttttATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAagaaaaaagaagaaaaaaga > 1:783889/1‑149 (MQ=255) ttttATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTATTAGACTTCTACGGCTAACATAACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAagaaaaaagaagaaaaaaga < 2:8144988/149‑1 (MQ=255) ttATATGCAATTTTAATTAAATGAAAATACTTAGACTTCTAAGGATAACATCACAACGATTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGATGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAAAAAAAAGaagaaaaaagaaa < 2:922597/149‑1 (MQ=17) atatGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAagaaaaaagaaaaa < 1:4471229/149‑1 (MQ=255) tatGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAgaaaaaagaaaaaa < 1:10007817/149‑1 (MQ=255) atGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAAc < 1:10282487/149‑1 (MQ=255) tGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAAcc > 2:3586693/1‑149 (MQ=255) caaTTTTAATTAAATGATACTTCTTAAACTTATAAGGATAAAATAAAAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTAGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAACCAg < 2:4985027/147‑1 (MQ=17) aTTTTAATTAAATGATACTTCTTAGCCTTCTAAAGATATCATAAAAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTTCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTACTGAGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACCAGtt < 2:6999115/149‑1 (MQ=17) aTTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGtt > 2:4143888/1‑149 (MQ=255) ttttAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTa > 1:2092105/1‑149 (MQ=255) ttttAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTa > 2:6846243/1‑149 (MQ=255) ttaattaaATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTaaa > 2:6361548/1‑149 (MQ=255) ttaattaaATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTaaa > 2:3050710/1‑149 (MQ=255) taattaaATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTaaaa > 2:5300240/1‑149 (MQ=255) taattaaATGATACTTCTTAGACTTCTACAGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGATCTGTGCTAGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTaaaa < 2:5647635/149‑1 (MQ=255) attaaATGATACTAATTAGAATTATACGGATATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTAGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAg < 2:886223/149‑1 (MQ=17) ttaaATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGt > 2:3224119/1‑149 (MQ=255) taaATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGtt > 1:4733715/1‑149 (MQ=255) taaATAATAATTATTAGACTTCAAAGGCTATCATCACAAAGCTTATAAAGAGGATCGTGCGTTGCTGTAAGAGCTGTAATGGTATGAATTGATAGAATAAAGTAATAAGAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGtt < 2:3464223/149‑1 (MQ=18) aaaTGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGttt < 2:1454498/149‑1 (MQ=255) aagtaTACTTGTTAAAATACTACAGCTATCATCACAACAATTATGACGAGGATCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACCAGTTAAAAAGTttg < 2:9843551/145‑1 (MQ=17) aaTGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGttcg > 2:4553591/1‑147 (MQ=255) aaTGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTttg > 1:10109821/1‑149 (MQ=255) aTACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTtgttgt > 2:2898152/1‑149 (MQ=255) tACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAACAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGATAAAAAGTTTGTTGTa > 1:294877/1‑149 (MQ=255) cttcttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTAtt < 1:8338554/149‑1 (MQ=255) cttcttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCGCGTGCGTGTCTGTATGAGCTGTGATGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAATAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAAACAGTTAAAAAGATAGTTGTAtt > 2:7587809/1‑149 (MQ=17) ttcttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTa < 1:10462916/149‑1 (MQ=255) tcttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTAc > 1:8540863/1‑149 (MQ=255) ttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACaa > 1:4919514/1‑149 (MQ=255) ttAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACaa < 1:9969194/149‑1 (MQ=255) tAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAg > 1:8929393/1‑149 (MQ=255) aGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGc > 1:3277813/1‑149 (MQ=255) gACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCt < 1:2707330/149‑1 (MQ=255) tCTATGGCTATCATCGCAGCGCTTATGACGAGGATCGGGCGTTGCTGTATGAGCTGAGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAAGGAGAATAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAg < 2:10327127/149‑1 (MQ=18) tACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGga > 1:4592995/1‑149 (MQ=255) aCGGCTATCATCACAACGCTTATGACTAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAATAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGgag < 1:6711592/149‑1 (MQ=255) cGGCTATCATAACAAAGCTTATGAAGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTAAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGgaga < 2:671449/149‑1 (MQ=255) 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cacaACGCATATGACGAGGCTCGGGCGTTGCTGTAGGAGCTGTGCTGGTTAGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTa < 2:9041507/149‑1 (MQ=18) atttATGACGAGGATCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTa < 2:7729903/147‑1 (MQ=255) cTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTaa < 1:5525590/149‑1 (MQ=255) cTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTaa > 2:8298880/1‑149 (MQ=255) ttATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAAt > 1:7355318/1‑149 (MQ=255) tATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATa > 1:5176436/1‑149 (MQ=255) tATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATa < 2:7960672/149‑1 (MQ=255) gAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGtttt < 1:8845657/149‑1 (MQ=255) aGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGttttt > 2:8412177/1‑149 (MQ=255) cTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGATTTTTGaa > 1:2484978/1‑149 (MQ=255) 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tttGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAatat < 1:1892735/149‑1 (MQ=255) ttGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATAtt < 1:3586693/149‑1 (MQ=255) gAGTTGGTGAGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATAtttt < 2:9498770/149‑1 (MQ=255) gATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTa < 1:8042972/149‑1 (MQ=255) gATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTa > 1:4354660/1‑149 (MQ=255) gATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTa < 2:4339662/149‑1 (MQ=255) aTAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTaa > 2:7422471/1‑149 (MQ=255) aGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTaaaaaa < 1:9589794/149‑1 (MQ=255) aGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTaaaaaa > 2:540112/1‑149 (MQ=255) tAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTAAAAAAAg > 2:2502602/1‑149 (MQ=255) tAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTAAAAAAAg > 1:5899599/1‑149 (MQ=255) tAATGAGAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTAAAAAAAg < 2:4822147/149‑1 (MQ=255) | AGATTAATAAGGTCGATGTTGATTATTTTTATATGCCATTTTAATTAAATGATACTTCTTAGACTTCTACGGCTATCATCACAACGCTTATGACGAGGCTCGTGCGTTGCTGTATGAGCTGTGCTGGTTTGAGTTGGTGGGATAAAGTAATGAGAAGAAAAAAGAAGAAAAAAGAAAAAACCAGTTAAAAAGTTTGTTGTATTACAAGCTATAGGAGATATTCTTTTAAGTCTAATAGGTTTTTGAAAAACCAAGGAGATAAAATATGAAAAATATTTTGGATGAATTAAAAAAAGA > AM406671/2220603‑2220899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |