| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AM406671 | = 544201 | 1032 (0.930) | 10 (0.020) +AGGGAAAGAGTGTTGGACTCTGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAA |
10/176 | 23.5 | 1.6% | coding (1760/2328 nt) | ctpE | cation‑transporting ATPase, E1‑E2 family |
| ? | AM406671 | 544262 = | 1067 (0.960) | coding (1821/2328 nt) | ctpE | cation‑transporting ATPase, E1‑E2 family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1039 total aligned reads displayed.
GGCGTTAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCAATCATTTTAGCGATTATCTCAGCAATCTTTGTCTTCACTTATCCCTTACAAGCCTCACAACTTTCACTCATTAGTTTATTCACCATTGGGATT > AM406671/544053‑544349 | gTTAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGt < 2:8442328/149‑1 (MQ=255) ttAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTc < 1:8199704/149‑1 (MQ=255) ttAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTc > 2:5209771/1‑149 (MQ=255) ttAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGCTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTc > 2:9108133/1‑149 (MQ=255) aatgATCTTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCaa < 2:6284803/146‑1 (MQ=255) aaCGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCaa > 2:3634293/1‑149 (MQ=255) tatTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATg > 2:1249219/1‑149 (MQ=255) atTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGt > 2:1139300/1‑149 (MQ=255) ttttAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGtt > 2:4131997/1‑149 (MQ=255) ttttAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGtt < 2:230957/149‑1 (MQ=255) ttttAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGtt < 1:1008772/149‑1 (MQ=255) tGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCa > 1:9460690/1‑149 (MQ=255) gAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACCCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAg < 1:5867738/149‑1 (MQ=255) aaGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGc < 1:1600248/149‑1 (MQ=255) aaGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGc > 1:3200477/1‑149 (MQ=255) agagTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGcc > 1:6733684/1‑149 (MQ=255) agagTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGcc > 1:5606082/1‑149 (MQ=255) agTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCAt > 2:8823026/1‑149 (MQ=255) 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tagtaTCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACGCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTg > 1:1201483/1‑149 (MQ=255) tagtaTCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTg < 1:4927732/149‑1 (MQ=255) taTCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑Taa < 1:1380991/149‑1 (MQ=255) aTCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑Taaa > 1:46981/1‑149 (MQ=255) cGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑Taaaaa < 1:768640/149‑1 (MQ=255) cGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGA‑TTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑Taaaaaa > 2:7121875/1‑149 (MQ=255) cTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAAt > 1:6362915/1‑149 (MQ=255) tGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCtt < 1:3490110/149‑1 (MQ=255) ggCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCttt < 1:3398240/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCtttt < 2:8629395/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTACTTG‑TAAAAAATCtttt < 2:3416428/149‑1 (MQ=255) ttCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCtttttt < 1:5737312/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTCTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCa > 2:7496489/1‑149 (MQ=255) aGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCaa < 1:5044710/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCAAt < 1:1723511/149‑1 (MQ=255) 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gtgGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCAATCATTTTAGCGATTATCTCAGCAATCTTTGTCTTCACTTATCCCTTACAAGCCTCACAACTTTCACTCATTAGTTTATTCACCATTGGGAt < 1:4495440/149‑1 (MQ=255) gtgGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCAATCATTTTAGCGATTATCTCAGCAATCTTTGTCTTCACTTATCCCTTACAAGCCTCACAACTTTCACTCATTAGTTTATTCACCATTGGGAt > 2:9436805/1‑149 (MQ=255) | GGCGTTAACGATATTTTAGCTATGAAGAGTGCCGATTGTAGTATCGCTATGGCTTCAGGAAGTGATGCTGCGACCCAAGTTGCACAAGTGGTTTTACTCGATTCAGATTTTGGTCACATGACCCAAGTTGTCACTGAAGGGCGTCGTGTGGTCAATAATGTTCAGCGCTCAGCCATCCTTTTCCTTG‑TAAAAAATCTTTTTTCAATCATTTTAGCGATTATCTCAGCAATCTTTGTCTTCACTTATCCCTTACAAGCCTCACAACTTTCACTCATTAGTTTATTCACCATTGGGATT > AM406671/544053‑544349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |