| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 1333548 = | NA (NA) | 117 (0.120) | 38/270 | 18.7 | 13.3% | intergenic (‑831/+481) | llmg_1358/llmg_1359 | conserved hypothetical protein/conserved hypothetical protein |
| ? | AM406671 | = 1380520 | 839 (0.760) | intergenic (‑457/+79) | llmg_1411/guaC | hypothetical protein/GMP reductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 840 total aligned reads displayed.
GAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCACT > AM406671/1333400‑1333682 | aaGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATtat > 1:6717896/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATtat > 2:4762514/1‑149 (MQ=255) tttttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTc < 1:7527258/149‑1 (MQ=255) ttttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTcc > 2:4192529/1‑149 (MQ=255) ttATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCa > 1:576713/1‑149 (MQ=255) aaTTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGNTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGt > 1:5335664/1‑149 (MQ=255) tCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGtttt > 1:2503735/1‑149 (MQ=255) tCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGtttt > 1:8073630/1‑149 (MQ=255) cAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTtta > 2:8827000/1‑149 (MQ=255) aaCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATATATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAAATTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATCTTCCCACGGTTttatta > 2:448675/1‑149 (MQ=255) aaCGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTttatta > 1:3601503/1‑149 (MQ=255) cGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAAc < 1:4485311/149‑1 (MQ=255) gATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCt < 2:7203130/149‑1 (MQ=255) gATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCt > 2:8330936/1‑149 (MQ=255) aTCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTttat > 2:9265616/1‑142 (MQ=255) aTCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCtg > 2:2742019/1‑149 (MQ=255) cATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGa > 2:5689242/1‑149 (MQ=255) cATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGa > 2:3956010/1‑149 (MQ=255) aTCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGaa < 1:9592001/149‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGaaa > 1:4743661/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAAt > 2:7081324/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACGTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAAt > 2:4911533/1‑149 (MQ=255) aaGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAg < 1:1736251/149‑1 (MQ=255) aGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGt < 1:6872200/149‑1 (MQ=255) gTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTC‑AAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGtat < 2:105015/149‑1 (MQ=255) tttAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGtat < 1:8960497/149‑1 (MQ=255) ggTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATtata > 2:6805039/1‑149 (MQ=255) ggTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATtata < 1:5984828/149‑1 (MQ=255) gTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTatat < 2:7981313/149‑1 (MQ=255) tATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCa < 1:8656480/149‑1 (MQ=255) tATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTAAAAAAAAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCa < 2:3323326/149‑1 (MQ=37) tATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTAATTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCa < 2:3556777/149‑1 (MQ=255) cACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAAtt < 2:1969127/149‑1 (MQ=255) aCTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAAttt < 1:7862267/149‑1 (MQ=255) caccACACCAATGTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAACTTTc < 2:6652680/147‑1 (MQ=255) tCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCa > 2:7468900/1‑149 (MQ=255) ccAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCAt < 1:1014626/149‑1 (MQ=255) ccAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCAt < 1:4902388/149‑1 (MQ=255) aaaCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTTAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGCAATAGTATTATATCAAATTTTCATAg < 2:602932/149‑1 (MQ=255) aCCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGaa > 2:21016/1‑149 (MQ=255) aCCAAATTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGaa < 2:5397846/149‑1 (MQ=255) cAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAAATACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAt < 2:4334258/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAtt < 1:2703078/149‑1 (MQ=255) aTTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAttt > 1:640221/1‑149 (MQ=255) ttGAGAAAGCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCa < 1:5553604/149‑1 (MQ=255) tGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAg > 1:3064443/1‑149 (MQ=255) agaAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGta > 1:3199100/1‑149 (MQ=255) aaaaCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGtaat < 1:9484488/149‑1 (MQ=255) aaaaCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGtaat > 2:6509961/1‑149 (MQ=255) aCGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATaaa > 1:7260059/1‑149 (MQ=255) cGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATaaaa < 2:4657949/149‑1 (MQ=255) tCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATc > 1:6985404/1‑149 (MQ=255) tCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTCCAGTAATAAAATc > 2:6158099/1‑149 (MQ=255) aCTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGaa > 2:1382707/1‑149 (MQ=255) cTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAAc < 1:837869/149‑1 (MQ=255) cTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAAc > 2:3139345/1‑149 (MQ=255) cTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAAc < 1:3395826/149‑1 (MQ=255) aaataaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAt > 2:2605474/1‑149 (MQ=255) aataaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAtt > 1:2253325/1‑149 (MQ=255) aataaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAtt > 1:3886327/1‑149 (MQ=255) taaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTa < 2:8671307/149‑1 (MQ=255) taaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTa > 1:3726987/1‑149 (MQ=255) aaatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTaa > 1:614278/1‑149 (MQ=255) aatTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAg < 1:2926008/149‑1 (MQ=255) tACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATATCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGaaa < 2:5926198/149‑1 (MQ=255) aCTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCAt < 1:6510348/112‑1 (MQ=255) aCTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGaaaa < 2:9002155/149‑1 (MQ=255) cTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGaaaaa < 1:7701738/149‑1 (MQ=255) aaaaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAag < 1:9329163/149‑1 (MQ=255) aaaaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTAAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAag > 2:6550191/1‑149 (MQ=255) aaTGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAagag > 1:4336151/1‑149 (MQ=255) tGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGcc > 1:4187773/1‑149 (MQ=255) tGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGcc > 2:8221881/1‑149 (MQ=255) tGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGcc < 2:5559729/149‑1 (MQ=255) gATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCg > 2:2252869/1‑149 (MQ=255) aTACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGa > 1:5462964/1‑149 (MQ=255) aTACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGa < 1:8207588/149‑1 (MQ=255) tcttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGtt < 1:9094270/149‑1 (MQ=255) tcttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAAATAAAGAAAAAAAGAGCCGAATGtt < 2:9503966/149‑1 (MQ=255) cttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAAGAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTc > 1:5873311/1‑149 (MQ=255) ttGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCg < 1:8826923/149‑1 (MQ=255) aCTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGctc < 2:9105546/149‑1 (MQ=255) cTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGctct < 1:1391150/149‑1 (MQ=255) cTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGctct > 2:2375183/1‑149 (MQ=255) aaaaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATg < 1:1902506/149‑1 (MQ=255) aaaaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAAGAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATg < 2:2944381/149‑1 (MQ=255) aaaaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAAGTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATg < 2:378667/149‑1 (MQ=255) aaaCTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGt > 2:1819776/1‑149 (MQ=255) attaaCTTAATGTACATATTAATAAGATTATATTCCCACGGTTTAATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTAATAGAAATTTCAATAATAAAATAGAAAAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTg < 2:8549254/145‑1 (MQ=11) gACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAACTCTAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCTACTGTTCGGCTCTTCATGTTTGACt < 2:5252822/149‑1 (MQ=255) gACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACt > 1:237858/1‑149 (MQ=40) aCTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACtt < 1:2121042/149‑1 (MQ=39) aCTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACtt > 2:1596294/1‑149 (MQ=39) tAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCGACGGTTGTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTGCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTtata < 1:5151667/149‑1 (MQ=255) tAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTtata > 1:1229971/1‑149 (MQ=37) gTCAATATAAATAAGATTATACTCCCACGGTTTTAATAACCTGTGAAAAAGTATTATAACAAAATTTCATAAAAATTTCAGTAATAAAATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATccc < 2:7617837/149‑1 (MQ=11) tCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATcccc < 2:3888350/149‑1 (MQ=32) aaTATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCAc < 1:3415888/149‑1 (MQ=31) aaTATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCAc < 1:9171358/149‑1 (MQ=31) atatAAATAAGATTATTTTCCTACGTTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTATTAAATTCGAACAATTTAATAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGTCTTATATCCCCACt < 2:3655311/149‑1 (MQ=11) | GAAGCTTTTTATAATTCAAAACGGATCCATCAAAGTTTAGGTTATCTCACTCCAAACCAATTTGAGAAAACGTCTACTTAAATAAATTACTAAAAATGATACTTCTTGAACTCAAAAAACTTGACTTAATGTCAATATAAATAAGATTATATTCCCACGGTTTTATTAACCTGTGAAATAGTATTATATCAAAATTTCATAGAAATTTCAGTAATAAAATCGAACAATTTAAGAAAAAAAGAGCCGAATGTTCGGCTCTTCATGTTTGACTTATATCCCCACT > AM406671/1333400‑1333682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |