| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 669736 = | 1133 (1.060) | 94 (0.110) +GCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATC |
11/232 | 41.4 | 10.4% | coding (10/498 nt) | llmg_0676 | hypothetical acetyltransferase |
| ? | AM406671 | = 699762 | 945 (0.880) | intergenic (‑51/‑32) | llmg_pseudo_20/llmg_0715 | pseudogene/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 945 total aligned reads displayed.
GTTGTCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATCCT > AM406671/699615‑699910 | gTTGTCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGCATGATAGAAGGCt > 2:5529599/1‑149 (MQ=11) ttGTCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTc > 2:2530088/1‑149 (MQ=31) tCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTa < 1:7157999/149‑1 (MQ=33) tttttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGTATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAg < 2:6218255/149‑1 (MQ=25) tttttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAg > 1:1271242/1‑149 (MQ=35) tttttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAg > 2:5253859/1‑149 (MQ=35) ttttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGa > 1:2359603/1‑149 (MQ=35) ttttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGa < 2:8515558/149‑1 (MQ=35) ttAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGaaa < 1:8026724/149‑1 (MQ=38) tAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTTATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAAt > 2:2820807/1‑149 (MQ=38) tAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAAt < 2:4000078/149‑1 (MQ=38) aaTTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAAtt < 2:6535697/149‑1 (MQ=39) aTTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTa > 1:5795123/1‑149 (MQ=40) tCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAAt < 1:2143078/149‑1 (MQ=255) cTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATg < 2:9132611/149‑1 (MQ=255) aGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGcc > 1:507338/1‑149 (MQ=255) aGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGcc > 1:3942594/1‑149 (MQ=255) gAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGccc < 2:15159/149‑1 (MQ=255) gAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGccc < 1:5241252/149‑1 (MQ=255) aaaaTCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGcccc > 2:6068603/1‑149 (MQ=255) aaTCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCtt < 2:5055349/149‑1 (MQ=255) aTCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTg > 1:890458/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTg > 1:3076255/1‑149 (MQ=255) aGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTgggg < 2:4748236/149‑1 (MQ=255) gCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGa > 1:8629923/1‑149 (MQ=255) gCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGAGTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGa < 2:7390134/149‑1 (MQ=255) cTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGAc > 1:5412304/1‑149 (MQ=255) tttAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGGTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGCGTAAGAAATTAATGCCCCTTTGGGACt > 1:4605606/1‑149 (MQ=255) ttAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACtt > 2:5726166/1‑149 (MQ=255) tAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTa < 1:1000927/149‑1 (MQ=255) tAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTa < 1:1639898/149‑1 (MQ=255) aCGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGcc < 2:8747698/149‑1 (MQ=255) ggAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTa < 1:3415577/149‑1 (MQ=255) gAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGGTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTGTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATATAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTAt < 1:3164352/149‑1 (MQ=255) aGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATc > 2:4607645/1‑149 (MQ=255) aGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATc < 2:7614900/149‑1 (MQ=255) gCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCt < 1:732513/149‑1 (MQ=255) cTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCtt > 1:2010909/1‑149 (MQ=255) tCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGaa < 2:8275538/149‑1 (MQ=255) ttAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGaaaaa > 1:6724376/1‑149 (MQ=255) tttAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCaa < 1:6550351/149‑1 (MQ=255) tttAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCaa < 1:4385252/149‑1 (MQ=255) agagtagagGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAAttt < 1:2522056/149‑1 (MQ=255) agGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAAc > 2:3210732/1‑149 (MQ=255) gTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGTGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCACGTAACAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACgg < 2:2424283/149‑1 (MQ=255) gTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACgg < 1:9166425/149‑1 (MQ=255) aTCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAg < 1:490331/149‑1 (MQ=255) ccATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGtt > 2:3873131/1‑149 (MQ=255) ccATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGGAAGtt > 1:8200615/1‑149 (MQ=255) cATTTATAAATTGTTGCAGGTGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGttt < 2:5892036/149‑1 (MQ=255) aTTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGtttt > 2:3757932/1‑149 (MQ=255) aTTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCATAAATTAAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGtttt < 2:6302363/149‑1 (MQ=255) aTTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTCGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAAGTTTAGGAACGGTAAGtttt > 1:4469485/1‑149 (MQ=255) tttATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTg < 2:2010201/149‑1 (MQ=255) attAAAAATTATTGCAGGAGTCAAGACGTATTATTTAGACAGCTGGGTGACGGATTAAACAGAATAATAGAAGGCAAATAAGAAATTAATGTTCTTTGTGGACTTAATGAAAAAAAAAAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTg < 2:944034/148‑1 (MQ=12) ttATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGa > 1:4296836/1‑149 (MQ=255) aaTTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATGCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAg < 2:4336859/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGa > 1:4707031/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGa < 1:3704566/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATGGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGa > 2:1763830/1‑149 (MQ=255) ggaggaGGGGCTACGTCGTATTATTTAGACAGCGGGGGGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGATCCTTGGGGACTTAAGGCATATAGAGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGaaaa < 2:2753460/144‑1 (MQ=25) tgCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGaaaaaa > 1:7022223/1‑149 (MQ=255) gCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAAt > 1:8774219/1‑149 (MQ=255) gggCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATa > 2:3431483/1‑149 (MQ=255) gggCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATa < 1:5597945/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATa > 2:2227989/1‑149 (MQ=255) cgtcgtATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTcc < 1:2853733/149‑1 (MQ=255) tcgtATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTcccc < 2:7967385/149‑1 (MQ=255) cgtATTCTTTAGACAGCTGGGTCTCGGATTGACCAGAATGATAGCAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGAGTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcct > 2:1186864/1‑149 (MQ=255) gtATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctc > 1:268210/1‑149 (MQ=255) tATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcc > 1:8446651/1‑149 (MQ=255) tATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcc > 1:633319/1‑149 (MQ=255) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcct > 2:489918/1‑149 (MQ=255) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcct > 1:8339608/1‑149 (MQ=255) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcct > 1:7575063/1‑149 (MQ=255) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCcctcct > 2:7174241/1‑149 (MQ=255) tCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTa > 1:6203937/1‑149 (MQ=255) ttAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACaa > 1:7769477/1‑149 (MQ=255) tAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAat < 1:5989532/149‑1 (MQ=255) gCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAt < 1:1181287/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAtg > 2:4110701/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATACCCCTTGGGGACTTAATACCTATCTTGAAAAAACCAATATTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAtg > 1:951863/1‑149 (MQ=255) tGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAtgt < 1:144494/149‑1 (MQ=255) tGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAtgt < 1:350628/149‑1 (MQ=255) tGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAg < 1:4187256/149‑1 (MQ=255) cGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCACTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTa < 2:8074252/149‑1 (MQ=255) ggATTGAACAGAATGATAGAAGGCACGTAAGAAATCAATGCCCCTTGGTGACTTAAGGCCAATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTCGACAAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTaa < 2:4519783/149‑1 (MQ=255) aTTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACa > 1:6912191/1‑149 (MQ=255) aTTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACa > 1:184158/1‑149 (MQ=255) ttGACCAAAATGATAGAAGACTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCATATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTATTAAACAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAg < 2:1316217/149‑1 (MQ=255) tGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGa < 2:35688/149‑1 (MQ=255) gACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGaa < 2:7810890/149‑1 (MQ=255) aTGCTAGAAGACTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCATAACTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTg < 2:6761216/149‑1 (MQ=255) gATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGat > 2:7497896/1‑149 (MQ=255) aGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAAt < 1:4795944/149‑1 (MQ=255) ggCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATc < 2:1867110/149‑1 (MQ=255) gCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATcc > 1:7955223/1‑149 (MQ=255) gCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATcc > 2:6920771/1‑149 (MQ=255) acTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGGAAGTTTTTACTAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTAACTGAAGTTAACAGAAAGTACTAATATCAATcc > 2:3025740/2‑149 (MQ=255) cTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCATGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATCCt < 2:8950513/149‑1 (MQ=255) | GTTGTCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCTCGTAAGAAATTAATGCCCCTTGGGGACTTAATGCCTATCTTGAAAAAACCAATTTTAGGAACGGTAAGTTTTGACCAAGAAAAAATGATAAGTTCCCCTCCTTACAATATCTATGTGAAGTTAACAGAAAGTACTGATATCAATCCT > AM406671/699615‑699910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |