| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 715842 | 249 (0.920) | 8 (0.030) | 7/134 | 18.2 | 3.7% | coding (449/570 nt) | ybfC | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 715985 | 189 (0.780) | intergenic (+22/‑174) | ybfC/ECB_00662 | hypothetical protein/conserved hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGAAT > REL606/715767‑715916 | gagCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTaa < 2:6429636/76‑1 (MQ=255)gagCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTaa < 2:2367730/76‑1 (MQ=255)gagCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTaa < 2:6094432/76‑1 (MQ=255) agCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTaaa < 2:1196746/76‑1 (MQ=255) cGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAata < 2:3883992/76‑1 (MQ=255) cGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAata > 1:937308/1‑76 (MQ=255) gggTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAatat > 1:5852157/1‑76 (MQ=255) gggTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAatat < 2:5248118/76‑1 (MQ=255) gggTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAatat < 1:6289676/76‑1 (MQ=255) ggTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATAtt < 2:4942579/76‑1 (MQ=255) ggTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATAtt > 2:5405855/1‑76 (MQ=255) atctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTa < 1:8859145/76‑1 (MQ=255) tctatcAAAAAACGAGCAGTGAGCAAGCTCCGTTGTTGGCACTCCTTGCTAATTCACTACTGGGCAAATAtcttca > 2:7215452/1‑74 (MQ=255) tctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTaa < 2:941089/76‑1 (MQ=255) tctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTaa < 2:3386476/76‑1 (MQ=255) tctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTaa > 1:3416368/1‑76 (MQ=255) ctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTaaa > 1:7196518/1‑76 (MQ=255) ctatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTaaa < 1:5943616/76‑1 (MQ=255) tatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaag < 1:755984/76‑1 (MQ=255) tatcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaag > 2:7395732/1‑76 (MQ=255) atcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaaga > 2:8130524/1‑76 (MQ=255) atcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaaga < 2:855749/76‑1 (MQ=255) tcAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaagaa > 2:910233/1‑76 (MQ=255) cAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaagaag < 2:2585353/76‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaagaag < 2:253829/76‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAaagaag > 1:2800591/1‑76 (MQ=255) aaaaaGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAagaagaga > 2:2115098/1‑76 (MQ=255) aaaaGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAagaagagaa < 1:4831954/76‑1 (MQ=255) aaaaGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAagaagagaa < 1:1660373/76‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAagaagagaag < 1:3063869/76‑1 (MQ=255) gagCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCa > 2:2509814/1‑76 (MQ=255) agCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCaa > 1:2902057/1‑76 (MQ=255) agCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCaa > 2:6124539/1‑76 (MQ=255) gCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAAc < 2:3829306/76‑1 (MQ=255) cAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACt > 1:3214343/1‑76 (MQ=255) gTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTa < 2:395311/76‑1 (MQ=255) tGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTAt < 1:1132665/76‑1 (MQ=255) tGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTAt < 2:4284264/76‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATg > 1:7778054/1‑76 (MQ=255) gATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATg < 1:6084843/76‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATg > 2:7604315/1‑76 (MQ=255) ccAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTc < 2:1960709/76‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGa > 1:2338863/1‑76 (MQ=255) gCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGaa > 2:1676706/1‑76 (MQ=255) cTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAAt > 2:5976383/1‑76 (MQ=255) cTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAAt < 2:3648971/76‑1 (MQ=255) cAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGa > 2:3865917/1‑76 (MQ=255) aGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGAc > 2:5915042/1‑76 (MQ=255) ttgttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAg < 2:6376660/76‑1 (MQ=255) tgttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGc < 1:2152064/76‑1 (MQ=255) gttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGca > 2:1371870/1‑76 (MQ=255) gttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGca < 1:7658096/76‑1 (MQ=255) gttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCAAATGACAGca < 2:1423850/76‑1 (MQ=255) ttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGcac < 2:5519383/76‑1 (MQ=255) ttgGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGcac > 1:691116/1‑76 (MQ=255) gCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACAtc < 1:6644587/76‑1 (MQ=255) cAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACAtct > 2:5343627/1‑76 (MQ=255) aGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACAtctc > 2:5142999/1‑76 (MQ=255) ccTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAGTGACAGCACCTCTCCCg > 1:3984799/1‑76 (MQ=255) ccTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCg < 1:4402069/76‑1 (MQ=255) ccTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCg > 1:8564008/1‑76 (MQ=255) ccTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCg > 1:8282224/1‑76 (MQ=255) ccTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCg < 1:786874/76‑1 (MQ=255) cTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGa > 2:4610720/1‑76 (MQ=255) cTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGa > 2:8872371/1‑76 (MQ=255) ttGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGaa < 1:5582409/76‑1 (MQ=255) ttGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGaa > 1:1382587/1‑76 (MQ=255) tGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAAc > 1:7905454/1‑76 (MQ=255) gATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACa > 1:1453145/1‑76 (MQ=255) aTAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACaa > 1:228116/1‑76 (MQ=255) aTAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACaa < 2:1019612/76‑1 (MQ=255) tAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACaag > 2:7681723/1‑75 (MQ=255) 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< 1:4252821/76‑1 (MQ=255) tCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATg < 2:8051172/76‑1 (MQ=255) tCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATg < 1:4012148/76‑1 (MQ=255) tCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATg > 2:3423736/1‑76 (MQ=255) tCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATg < 1:3594818/76‑1 (MQ=255) tCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATg < 2:3002283/76‑1 (MQ=255) cAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGa < 2:1577861/76‑1 (MQ=255) aaTCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAg > 1:2383761/1‑76 (MQ=255) aTCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGt < 2:7914457/76‑1 (MQ=255) aTGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCtt < 1:495890/76‑1 (MQ=255) aTGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGAAAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCtt < 1:1193276/76‑1 (MQ=255) tGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTa > 2:7129969/1‑76 (MQ=255) gTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACg > 1:4126556/1‑76 (MQ=255) ttAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGa > 1:4642097/1‑76 (MQ=255) ttAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGa > 1:8259423/1‑76 (MQ=255) tAAATATTTTAAAGAAGAGATGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGaa < 2:4765716/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGAAt > 1:1951527/1‑76 (MQ=255) aaaTATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGAAt < 1:5142999/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGAAt > 1:7256906/1‑76 (MQ=255) | GAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGCTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTTAAATATTTTAAAGAAGAGAAGCCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAGATGAGTCTTACGAAT > REL606/715767‑715916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |