| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1405596 = | 236 (0.750) | 13 (0.040) | 6/140 | 21.4 | 5.6% | coding (377/984 nt) | ydaN | zinc transporter |
| ? | REL606 | 2034535 = | NA (NA) | noncoding (559/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CCGATCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTG > REL606/1405521‑1405671 | ccGATCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGgc > 2:2988814/1‑76 (MQ=255)ccGATCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGgc < 1:5597898/76‑1 (MQ=255) aTCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTGGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCt > 2:5282225/1‑76 (MQ=255) aTCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCt < 2:7250414/76‑1 (MQ=255) aTCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCt > 2:6151378/1‑76 (MQ=255) tCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTg < 1:5238897/76‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTgg < 2:6568363/76‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACAGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGAc < 2:1473595/76‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACg > 2:9758423/1‑76 (MQ=255) cTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACg < 1:3791862/76‑1 (MQ=255) tGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAACGTGCTGGCGCTGGGCGa > 1:7143815/1‑76 (MQ=255) gTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtg > 1:3589805/1‑76 (MQ=255) gTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtg < 2:2683816/76‑1 (MQ=255) tCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtgt > 1:5059776/1‑76 (MQ=255) cGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtgtg > 1:8146029/1‑76 (MQ=255) cGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtgtg > 1:4468654/1‑76 (MQ=255) cGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAtgtg < 1:5700274/76‑1 (MQ=255) ccATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATgtggt < 1:7153308/76‑1 (MQ=255) ccATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATgtggt < 1:204186/76‑1 (MQ=255) ccATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATgtggt < 2:7766673/76‑1 (MQ=255) cATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATgtggtg > 2:3912801/1‑76 (MQ=255) cATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATgtggtg > 2:9595835/1‑76 (MQ=255) aTGCGTGTATATATAGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGa > 2:4573352/1‑76 (MQ=255) tGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAg < 1:6938456/76‑1 (MQ=255) gCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGc > 2:6666422/1‑76 (MQ=255) cGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAggg > 1:5268518/1‑74 (MQ=255) cGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCg > 1:6772742/1‑76 (MQ=255) tgtATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGAt < 1:4701249/76‑1 (MQ=255) gtATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATc > 2:2651739/1‑76 (MQ=255) gtATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATc > 1:8983270/1‑76 (MQ=255) tatataTGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCt < 1:10195260/76‑1 (MQ=255) tatataTGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCt > 2:5108617/1‑76 (MQ=255) atatatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTg > 2:62681/1‑76 (MQ=255) atatatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTg > 2:5641357/1‑76 (MQ=255) atatatGAACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAGCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTg < 2:1855272/76‑1 (MQ=255) tatatGGACGTGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTgg < 2:4896257/76‑1 (MQ=255) tatatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTgg > 1:4095041/1‑76 (MQ=255) tatatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTgg > 2:7396568/1‑76 (MQ=255) atatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGa > 1:9001560/1‑76 (MQ=255) tatGGCCGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGaa < 2:6922415/76‑1 (MQ=255) tatGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGGGATCTGGaa > 2:9262570/1‑76 (MQ=255) atGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAag < 1:8263295/76‑1 (MQ=255) tGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAaga < 2:1976630/76‑1 (MQ=255) ggACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAagag < 1:2805195/76‑1 (MQ=255) gACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAgg < 1:4968998/76‑1 (MQ=255) aCGTGCGGTTACTTGTTTCGACCCGACAACGTAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAggg < 1:8828009/76‑1 (MQ=255) aCGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAggg > 2:10346521/1‑76 (MQ=255) cGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGc < 1:1391289/76‑1 (MQ=255) cGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGc < 2:1503333/76‑1 (MQ=255) gggCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCa > 1:5302879/1‑76 (MQ=255) ggCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCAc > 2:2699314/1‑76 (MQ=255) ggCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCAc < 1:4206044/76‑1 (MQ=255) ggCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCAc > 2:9321109/1‑76 (MQ=255) cGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACgg > 1:9307687/1‑76 (MQ=255) cGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACgg < 2:7474190/76‑1 (MQ=255) ggTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACggg > 1:4853719/1‑76 (MQ=255) ttAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTc > 1:7911440/1‑76 (MQ=255) aaTTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccg > 2:8086478/1‑76 (MQ=255) aTTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccga < 1:5548358/76‑1 (MQ=255) ttGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgac > 1:7515873/1‑76 (MQ=255) tGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgacc > 2:10024860/1‑76 (MQ=255) tGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgacc < 2:469662/76‑1 (MQ=255) tGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgacc > 1:7754850/1‑76 (MQ=255) tGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgacc > 2:5680276/1‑76 (MQ=255) gTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgaccg > 2:7274884/1‑76 (MQ=255) tttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTccgaccga < 1:9631892/76‑1 (MQ=255) ttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGAt > 1:3709892/1‑76 (MQ=255) ttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGAt > 2:4450969/1‑76 (MQ=255) tCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGAtt < 2:3642969/76‑1 (MQ=255) cGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTg > 2:8408859/1‑76 (MQ=255) cGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTg < 2:2244489/76‑1 (MQ=255) cGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGAGAGCGATCTGGAAGAGGGCGCGGGTCAGACCGATTg > 1:4994775/1‑76 (MQ=255) gACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGc < 1:8500391/76‑1 (MQ=255) cGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCgggg < 1:6631726/76‑1 (MQ=255) gACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCggggg < 1:6838713/76‑1 (MQ=255) aCAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGa < 2:3735278/76‑1 (MQ=255) aCAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGa > 1:8738158/1‑76 (MQ=255) aCAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGGCCGACCGATTGCGGGGGa > 1:6359843/1‑76 (MQ=255) cAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGAt > 2:232675/1‑76 (MQ=255) aaCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATg > 2:4380718/1‑76 (MQ=255) aaCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATg > 2:8799112/1‑76 (MQ=255) aaCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATg > 2:3264148/1‑76 (MQ=255) aCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATgg > 1:1542866/1‑76 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGCAGAGGGCACGGGCCCGACCGATTGCGGGGGATGGCt > 1:8195321/1‑76 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCt > 1:6514205/1‑76 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCt > 1:8541809/1‑76 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtg > 2:1215456/1‑76 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtg > 1:8662099/1‑76 (MQ=255) aaaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtgg > 2:6392806/1‑76 (MQ=255) aaaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtgg > 2:10132280/1‑76 (MQ=255) aaaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtgg > 1:6163873/1‑76 (MQ=255) gggCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGGCCGACCGATTGCGGGGGATGGCtggtgg < 1:10102468/74‑1 (MQ=255) tGCTGGCTCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGa < 2:4617144/76‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGa > 2:1290929/1‑76 (MQ=255) gCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAt < 2:8248750/76‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAt < 2:8916146/76‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAt < 1:2456840/76‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAtg > 2:2497477/1‑76 (MQ=255) ggCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAtgtg > 1:1157227/1‑76 (MQ=255) cgcTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGAtgtgtg < 2:8701440/76‑1 (MQ=255) | CCGATCAACTGGTCGCCATGCGTGTATATATGGACGGGCGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTG > REL606/1405521‑1405671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |