| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 1396823 | 344 (1.800) | 3 (0.020) | 3/144 | 19.5 | 1.2% | intergenic (‑127/+68) | fnr/ogt | DNA‑binding transcriptional dual regulator, global regulator of anaerobic growth/O‑6‑alkylguanine‑DNA:cysteine‑protein methyltransferase |
| ? | REL606 | = 1397014 | 177 (0.970) | coding (393/516 nt) | ogt | O‑6‑alkylguanine‑DNA:cysteine‑protein methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
GAGCAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCA > REL606/1396748‑1396898 | aGCAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGaaa < 1:1006212/76‑1 (MQ=255) aGCAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGaaa < 2:2417790/76‑1 (MQ=255) cAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAc < 2:3662137/76‑1 (MQ=255) aagtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAcc > 2:3148773/1‑76 (MQ=255) aagtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAcc > 1:2122791/1‑76 (MQ=255) aagtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAcc > 2:1625584/1‑76 (MQ=255) aagtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAcc > 1:4784443/1‑76 (MQ=255) aagtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAAcc > 1:5012073/1‑76 (MQ=255) agtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCa < 1:3819607/76‑1 (MQ=255) gtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCAt > 1:5292458/1‑76 (MQ=255) gtaagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCAt > 1:5698493/1‑76 (MQ=255) taagtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCAtt < 1:2629729/76‑1 (MQ=255) agtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTaa > 1:3955829/1‑76 (MQ=255) agtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTaa > 1:1963224/1‑76 (MQ=255) tAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAgttg < 2:2125457/76‑1 (MQ=255) tAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAgttg < 2:596032/76‑1 (MQ=255) gCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTa < 1:3509657/76‑1 (MQ=255) aaaCCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAg > 1:2074967/1‑76 (MQ=255) aaaCCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAg < 2:5561882/76‑1 (MQ=255) aaaCCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAg > 1:2916690/1‑76 (MQ=255) aCCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAggg < 1:6050778/76‑1 (MQ=255) cTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTa < 1:5521495/76‑1 (MQ=255) cTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTa > 1:4736273/1‑76 (MQ=255) ttAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTaa > 1:1690072/1‑76 (MQ=255) tAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAAc < 2:6178315/76‑1 (MQ=255) aaCAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACt > 1:1446528/1‑76 (MQ=255) aaCAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACt > 2:2589647/1‑76 (MQ=255) aCAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACtt < 2:6015674/76‑1 (MQ=255) cagcagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACttt < 1:1490418/76‑1 (MQ=255) agcagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTa > 1:4909367/1‑76 (MQ=255) agcagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTa < 2:1165139/76‑1 (MQ=255) agcagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTa < 1:2978897/76‑1 (MQ=255) gcagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTAc < 2:2983819/76‑1 (MQ=255) cagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACa > 1:4219344/1‑76 (MQ=255) cagAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACa < 1:5097807/76‑1 (MQ=255) agagAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACAt > 1:5766926/1‑76 (MQ=255) agagAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACAt < 2:6241454/76‑1 (MQ=255) gagaATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATa < 1:1121835/76‑1 (MQ=255) agaATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaa < 2:5763758/76‑1 (MQ=255) agaATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaa > 1:3123244/1‑76 (MQ=255) gaATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaaa < 2:3369540/76‑1 (MQ=255) aaTTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaaaa < 2:1048613/76‑1 (MQ=255) aaTTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaaaa > 1:4168459/1‑76 (MQ=255) aaTTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaaaa > 1:3930057/1‑76 (MQ=255) aaTTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATaaaa > 1:6207171/1‑76 (MQ=255) aTTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAg > 1:947546/1‑76 (MQ=255) tCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAgtg > 1:1218754/1‑76 (MQ=255) ccGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAgtgt > 1:2195341/1‑76 (MQ=255) ccGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAgtgt < 2:4066034/76‑1 (MQ=255) ccGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAgtgt > 1:3051142/1‑76 (MQ=255) cGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGtgtg > 1:4293072/1‑76 (MQ=255) cGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGtgtg < 1:5170773/76‑1 (MQ=255) atatTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGaa > 2:5043287/1‑76 (MQ=255) atatTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGaa < 2:5500237/76‑1 (MQ=255) tatTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAAc > 1:5442571/1‑76 (MQ=255) atTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACa > 2:4246814/1‑76 (MQ=255) atTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACa > 1:1949239/1‑76 (MQ=255) aGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGc > 1:5485145/1‑76 (MQ=255) aGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGc > 1:2393936/1‑76 (MQ=255) gATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCt > 1:5386570/1‑76 (MQ=255) gATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCt > 2:1437575/1‑76 (MQ=255) gATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCt > 1:3326504/1‑76 (MQ=255) 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> 1:6115213/1‑76 (MQ=255) aaaTATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGcac > 1:1649852/1‑76 (MQ=255) aaaTATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGcac > 1:3292135/1‑76 (MQ=255) aaTATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGcaca > 2:5923281/1‑76 (MQ=255) atatGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAAt > 1:3708658/1‑76 (MQ=255) tatGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAAtt > 1:6005625/1‑76 (MQ=255) tatGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAAtt > 2:6138090/1‑76 (MQ=255) atGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTg > 1:4683158/1‑76 (MQ=255) tGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGt < 2:1798333/76‑1 (MQ=255) tctatctaTTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGttt > 1:2149078/1‑76 (MQ=255) 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> 1:3983290/1‑76 (MQ=255) tctatTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATg > 1:4074502/1‑76 (MQ=255) ctatTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGt > 1:137149/1‑76 (MQ=255) atTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGttt > 1:2315182/1‑76 (MQ=255) atTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTCTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGttt > 1:1535240/1‑76 (MQ=255) ttGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTAc > 1:1872918/1‑76 (MQ=255) ttGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTAc > 1:4513950/1‑76 (MQ=255) aaaaCCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGc > 1:4619416/1‑76 (MQ=255) aaaaCCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGc > 1:4951777/1‑76 (MQ=255) aaaaCCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGc < 2:3978000/76‑1 (MQ=255) | GAGCAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCA > REL606/1396748‑1396898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |