| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3850562 = | 343 (1.400) | 4 (0.020) | 3/134 | 18.2 | 1.3% | intergenic (+56/‑35) | tnaA/tnaB | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent/tryptophan transporter of low affinity |
| ? | REL606 | 3850779 = | 296 (1.350) | coding (183/1248 nt) | tnaB | tryptophan transporter of low affinity | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
GTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAAC > REL606/3850703‑3850854 | tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGttatta < 2:8165181/76‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGttatta > 1:5115974/1‑76 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGttatta < 1:6122003/76‑1 (MQ=255) gCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAg < 1:136750/76‑1 (MQ=255) gCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAg < 2:7942691/76‑1 (MQ=255) gCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAg < 1:5314174/76‑1 (MQ=255) gcTGGGTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGa < 1:3678536/75‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGa > 2:2773201/1‑76 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGa < 1:6336463/76‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGa < 2:6833965/76‑1 (MQ=255) cTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGaa < 1:8014544/76‑1 (MQ=255) cTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGaa > 1:4561684/1‑76 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGc < 1:6455842/76‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGc < 2:3746903/76‑1 (MQ=255) gTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCa < 2:2834895/76‑1 (MQ=255) gTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCa < 1:5458154/76‑1 (MQ=255) tttttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCaa > 2:1045922/1‑76 (MQ=255) tttttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCaa < 1:7372191/76‑1 (MQ=255) tttttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCaa > 1:2853555/1‑76 (MQ=255) tCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAAttt < 2:1454109/76‑1 (MQ=255) cTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTa > 2:1722283/1‑76 (MQ=255) cTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTa > 2:578766/1‑76 (MQ=255) tGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTaa < 2:1217441/76‑1 (MQ=255) ggggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTaaa > 2:2326124/1‑76 (MQ=255) gggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAAt < 1:1439946/76‑1 (MQ=255) gggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAAt < 1:185041/76‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAAtt < 1:5614084/76‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAAtt < 2:456887/76‑1 (MQ=255) gTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTa < 2:4248207/76‑1 (MQ=255) gTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTa < 1:725995/76‑1 (MQ=255) gTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTa > 2:7440331/1‑76 (MQ=255) tGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTAt < 1:915362/76‑1 (MQ=255) tGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTAt < 2:5928216/76‑1 (MQ=255) ccTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATcc > 1:4727202/1‑76 (MQ=255) ccTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATcc > 1:7934032/1‑76 (MQ=255) cTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCt < 1:2247157/76‑1 (MQ=255) cTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCt > 1:1968549/1‑76 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTg < 2:6658654/76‑1 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTg < 2:3965728/76‑1 (MQ=255) ttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGt > 2:1771368/1‑76 (MQ=255) tATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTc < 1:6726983/76‑1 (MQ=255) aTCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCg > 2:2495641/1‑76 (MQ=255) aTCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCg > 1:7002470/1‑76 (MQ=255) tCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCgg < 1:4616956/76‑1 (MQ=255) ccTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGc > 1:3024368/1‑76 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTcc > 1:5787141/1‑76 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTcc > 1:2412537/1‑76 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTcc < 2:778368/76‑1 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTcc > 2:4777121/1‑76 (MQ=255) cATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGt > 1:6043287/1‑76 (MQ=255) cATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGt > 1:6787253/1‑76 (MQ=255) cATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGt > 1:1066522/1‑76 (MQ=255) aTTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGtt < 2:116019/76‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGtttt > 2:2695985/1‑76 (MQ=255) gCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTa < 2:409131/76‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTaa > 2:7692563/1‑76 (MQ=255) ccTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTaa < 1:5410190/76‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAac > 2:882502/1‑76 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAac < 1:5212645/76‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTCAATTCTACTGTCGGCTCCAGTTTTAacac > 2:3258338/1‑76 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAacac > 2:2145198/1‑76 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAacac > 2:3364091/1‑76 (MQ=255) ttttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCa < 1:4926815/76‑1 (MQ=255) tttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCAt > 2:4304091/1‑76 (MQ=255) tttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCAt > 2:6314706/1‑76 (MQ=255) tCAATTCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCa < 2:5638810/76‑1 (MQ=255) tCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCa < 1:7172272/76‑1 (MQ=255) cAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCAc > 2:5420502/1‑76 (MQ=255) aTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCa > 2:5244034/1‑76 (MQ=255) cTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAg < 1:3434777/76‑1 (MQ=255) ttCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGa > 1:7485843/1‑76 (MQ=255) tCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAt > 2:7503959/1‑76 (MQ=255) cATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAtt < 2:688680/76‑1 (MQ=255) aTTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAttt < 1:1517958/76‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTa < 2:5175588/76‑1 (MQ=255) cGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATc < 1:2141686/76‑1 (MQ=255) cGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATc < 1:7714455/76‑1 (MQ=255) cGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATc > 1:3878640/1‑76 (MQ=255) ggTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCgg > 1:1629509/1‑76 (MQ=255) gttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt > 1:486637/1‑76 (MQ=255) gttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt < 2:6073496/76‑1 (MQ=255) gttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt > 1:4673933/1‑76 (MQ=255) ttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa < 1:2492854/76‑1 (MQ=255) ttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa > 1:4809717/1‑76 (MQ=255) ttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa < 1:2276382/76‑1 (MQ=255) tattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa < 2:3593572/76‑1 (MQ=255) tattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa < 1:4249481/76‑1 (MQ=255) attgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAac < 1:4445176/76‑1 (MQ=255) attgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAac > 1:4156390/1‑76 (MQ=255) ttgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAaca > 2:5563774/1‑76 (MQ=255) ttgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAaca < 1:2744724/76‑1 (MQ=255) ttgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAaca < 2:6454940/76‑1 (MQ=255) tgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAacac > 1:1902636/1‑76 (MQ=255) gttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACAcc > 1:3378804/1‑76 (MQ=255) ttattaGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCt > 1:1721766/1‑76 (MQ=255) attaGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTgg > 2:4900953/1‑76 (MQ=255) ttaGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGa < 1:5933298/76‑1 (MQ=255) taGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGaa > 2:304908/1‑76 (MQ=255) taGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGaa > 1:329676/1‑76 (MQ=255) aGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAAc > 1:2702373/1‑76 (MQ=255) | GTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCTGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAAC > REL606/3850703‑3850854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |