| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 796784 | 208 (0.650) | 5 (0.020) | 5/138 | 20.4 | 2.7% | coding (30/1338 nt) | ECB_00738 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 797024 | 164 (0.560) | coding (270/1338 nt) | ECB_00738 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CAGTTGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACGAAAAT > REL606/796709‑796859 | gTTGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTc < 1:9679729/76‑1 (MQ=255) ttGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCa < 1:905712/76‑1 (MQ=255) tGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCaa < 1:8475444/76‑1 (MQ=255) tGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCaa > 1:3862255/1‑76 (MQ=255) gaaaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCaaa > 1:7790959/4‑76 (MQ=255) agaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTACTTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAAt < 2:9423399/76‑1 (MQ=255) agaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAAt < 2:6074887/76‑1 (MQ=255) agaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAAt > 1:7787607/1‑76 (MQ=255) gaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATa > 2:5304954/1‑76 (MQ=255) gaTTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAAGTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATa < 2:8007873/76‑1 (MQ=255) tttttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAg > 1:199328/1‑76 (MQ=255) tttttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAg < 1:2760289/76‑1 (MQ=255) tttttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAg < 1:74710/76‑1 (MQ=255) ttttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAgg < 1:7417061/76‑1 (MQ=255) ttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAgggg < 2:6323273/76‑1 (MQ=255) ttttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAgggg > 2:7265375/1‑76 (MQ=255) tttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAggggg < 2:4527630/76‑1 (MQ=255) tttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAggggg < 2:9689866/76‑1 (MQ=255) tttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAggggg < 1:1197390/76‑1 (MQ=255) tttCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAggggg > 1:7843293/1‑76 (MQ=255) tCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCg > 2:3551541/1‑76 (MQ=255) tCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCg > 2:230128/1‑76 (MQ=255) tCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCg < 2:7120522/76‑1 (MQ=255) ttATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACa < 1:3646438/76‑1 (MQ=255) tATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaa > 1:6814986/1‑76 (MQ=255) aTGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaat > 1:8191845/1‑76 (MQ=255) aTGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaat > 1:7350439/1‑76 (MQ=255) ggAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaatta < 2:623491/76‑1 (MQ=255) ggAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaatta > 2:3949190/1‑76 (MQ=255) agagTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACaattaat < 1:431817/76‑1 (MQ=255) agTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAattaatta < 2:4826325/76‑1 (MQ=255) tATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAattatt > 1:6766932/1‑76 (MQ=255) aTCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTc < 2:936533/76‑1 (MQ=255) aTCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTc > 1:4502135/1‑76 (MQ=255) aTCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTc > 1:4464781/1‑76 (MQ=255) ctgataaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAg > 1:7291427/4‑76 (MQ=255) aataaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAggg > 1:860726/1‑76 (MQ=255) aataaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAggg < 1:6258697/76‑1 (MQ=255) aataaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAggg > 2:3289276/1‑76 (MQ=255) taaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAg < 1:5799769/76‑1 (MQ=255) aaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGt < 1:5371757/76‑1 (MQ=255) aaGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGt < 1:2562243/76‑1 (MQ=255) aGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTg < 1:1617837/76‑1 (MQ=255) aGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTg < 1:1268075/76‑1 (MQ=255) gTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGa < 1:6604234/76‑1 (MQ=255) tAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGaa > 2:545983/1‑76 (MQ=255) aTTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAAtt > 1:1138840/1‑76 (MQ=255) ttCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAAttt < 2:4344259/76‑1 (MQ=255) ttCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAAttt > 1:3989000/1‑76 (MQ=255) ttCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAAttt > 1:4437924/1‑76 (MQ=255) cTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGc > 1:407347/1‑76 (MQ=255) cTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGc > 2:6496465/1‑76 (MQ=255) tttGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCt > 2:5149164/1‑76 (MQ=255) gAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCtatta > 2:3054606/1‑76 (MQ=255) aGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCtattat > 1:2915845/1‑76 (MQ=255) aGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCtattat > 2:757434/1‑76 (MQ=255) gTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATtata < 2:816807/76‑1 (MQ=255) gTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATtata < 2:8375737/76‑1 (MQ=255) tttATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTatat > 1:1014797/1‑76 (MQ=255) tttATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTatat > 1:2750484/1‑76 (MQ=255) ttATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATAtt < 1:4749255/76‑1 (MQ=255) tataAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTg > 2:421082/1‑76 (MQ=255) ataAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTgg < 2:199328/76‑1 (MQ=255) taAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTggg > 2:10034139/1‑76 (MQ=255) taAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTggg < 2:5010862/76‑1 (MQ=255) taAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTggg > 1:9155465/1‑76 (MQ=255) taAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTggg > 1:1347348/1‑76 (MQ=255) aaGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGt < 2:5425961/76‑1 (MQ=255) aaGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGt > 1:5912662/1‑76 (MQ=255) aaGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGt < 2:9541549/76‑1 (MQ=255) aaGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGt < 1:3719302/76‑1 (MQ=255) aaGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATCGGGt < 2:5654795/76‑1 (MQ=255) aGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGtg > 1:3890687/1‑76 (MQ=255) ccTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGtgatg > 2:1449139/1‑76 (MQ=255) ccTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGtgatg < 1:9709892/76‑1 (MQ=255) cTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGtgatga > 2:839491/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 2:5816005/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 2:9969182/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 2:5555114/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 1:942775/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 2:1307292/1‑76 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat < 1:3464283/76‑1 (MQ=255) tGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTgatgat > 1:322260/1‑76 (MQ=255) gTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGAtt > 2:7683665/1‑76 (MQ=255) tAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTc > 1:5548298/1‑76 (MQ=255) tAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTc < 1:4998832/76‑1 (MQ=255) tAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTc > 2:8807002/1‑76 (MQ=255) aaCTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCt > 1:611573/1‑76 (MQ=255) aCTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTg < 2:3537069/76‑1 (MQ=255) cTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGa > 2:6588123/1‑76 (MQ=255) tatataTTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGAc > 2:1689957/1‑76 (MQ=255) tatataTTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGAc > 2:1162940/1‑76 (MQ=255) tatataTTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGAc > 1:689790/1‑76 (MQ=255) atatatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACg < 1:1234125/76‑1 (MQ=255) atatatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACg < 1:10033953/76‑1 (MQ=255) atatatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACg > 2:3452244/1‑76 (MQ=255) atatatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACg > 2:3853311/1‑76 (MQ=255) atatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACGaa > 2:2639690/1‑76 (MQ=255) tatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACGaaa < 1:5073720/76‑1 (MQ=255) tatTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACGaaa < 2:1628054/76‑1 (MQ=255) | CAGTTGAGATTTTTTTCCTTATGGAGAGTATCTAATAAGTAATTCTTTGGAGTTTATAAGACCTGTAACTATATATTCAAATAAGGGGGCGACAATTAATTATTCAGGGAGTGAATTTGCTATTATATTGGGTGATGATTCTGACGAAAAT > REL606/796709‑796859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |