| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 796784 | 208 (0.650) | 5 (0.020) | 5/138 | 20.4 | 2.7% | coding (30/1338 nt) | ECB_00738 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 797024 | 164 (0.560) | coding (270/1338 nt) | ECB_00738 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GATAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGCT > REL606/796949‑797099 | gATAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGat < 1:3591845/76‑1 (MQ=255) aTAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGata > 2:7052544/1‑76 (MQ=255) tAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatat < 1:498194/76‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatat < 2:8571828/76‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatat < 1:9725210/76‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatat > 2:3661090/1‑76 (MQ=255) aaaaaGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatata > 2:6229599/1‑76 (MQ=255) aaaaGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatatat < 1:5149164/76‑1 (MQ=255) aaaGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatatata < 2:1753215/76‑1 (MQ=255) aaGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatatatat < 1:7444468/76‑1 (MQ=255) aaGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGatatatat < 1:1222462/76‑1 (MQ=255) aGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATg < 1:7335196/76‑1 (MQ=255) aGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATg < 2:7378058/76‑1 (MQ=255) gTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGc < 1:3289276/76‑1 (MQ=255) gCCGTTTATACGCCGATAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTc < 2:2591783/76‑1 (MQ=255) gCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTc > 2:8165192/1‑76 (MQ=255) ccGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCa > 2:2393317/1‑76 (MQ=255) ccGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCa < 1:9580728/76‑1 (MQ=255) cGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAg < 1:526143/76‑1 (MQ=255) cGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTAAg < 2:7612493/76‑1 (MQ=255) gTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGt > 1:101533/1‑76 (MQ=255) tttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGtt > 1:4003595/1‑76 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt < 1:5086056/76‑1 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt < 2:4444993/76‑1 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt > 2:7351790/1‑76 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt > 2:7133102/1‑76 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt > 2:6516727/1‑76 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt > 2:5786767/1‑76 (MQ=255) ttATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGttt > 1:3987944/1‑76 (MQ=255) tataCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTg < 1:8477647/76‑1 (MQ=255) tataCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTg < 1:9955631/76‑1 (MQ=255) ataCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGa < 2:3989000/76‑1 (MQ=255) ataCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGa > 1:7762809/1‑76 (MQ=255) taCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGaa > 1:452156/1‑76 (MQ=255) aCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGaaa < 2:10161639/76‑1 (MQ=255) aCGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGaaa < 2:407347/76‑1 (MQ=255) cGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGaaaa < 2:1179584/76‑1 (MQ=255) ccGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACt > 1:482655/1‑76 (MQ=255) aaaTAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGa > 2:3234083/1‑76 (MQ=255) aaTAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGat < 1:1689957/76‑1 (MQ=255) tAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGatat < 2:3751049/76‑1 (MQ=255) tAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGatat > 1:5558075/1‑76 (MQ=255) tAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGatat > 1:2883743/1‑76 (MQ=255) aaGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATAtt > 1:9642110/1‑76 (MQ=255) atatTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTa > 2:6667984/1‑76 (MQ=255) atatTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTa < 2:4502135/76‑1 (MQ=255) atatTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTa < 2:2344873/76‑1 (MQ=255) ttGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAAtt > 1:355992/1‑76 (MQ=255) tgtgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTg < 2:364555/76‑1 (MQ=255) tgtgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTg < 1:8261688/76‑1 (MQ=255) tgtgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTg < 2:2175265/76‑1 (MQ=255) tgtgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTg > 1:6803985/1‑76 (MQ=255) gtgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGa < 1:3164117/76‑1 (MQ=255) tgATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAg > 1:642315/1‑76 (MQ=255) gATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAgg > 1:6247477/1‑76 (MQ=255) gATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAgg > 1:3526412/1‑76 (MQ=255) aTTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAggg < 2:10142517/76‑1 (MQ=255) aTTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAggg < 1:6470211/76‑1 (MQ=255) cATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGgtgt > 1:2429618/1‑76 (MQ=255) tAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTta > 2:3201452/1‑76 (MQ=255) aGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtat < 2:5359012/76‑1 (MQ=255) aGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtat < 1:3790283/76‑1 (MQ=255) aGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtat < 2:9192483/76‑1 (MQ=255) gATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtata < 1:4385791/76‑1 (MQ=255) gATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtata < 1:6144835/76‑1 (MQ=255) gATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTtata < 1:1525957/76‑1 (MQ=255) aTTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaa < 2:3151633/76‑1 (MQ=255) aTTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaa < 2:158107/76‑1 (MQ=255) ttATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaa > 1:2223918/1‑76 (MQ=255) ttATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaa > 1:9039595/1‑76 (MQ=255) ttATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaa > 2:164412/1‑76 (MQ=255) ttATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaa > 2:1980373/1‑76 (MQ=255) tATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaaa < 2:3864142/76‑1 (MQ=255) tATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaaa > 2:4287579/1‑76 (MQ=255) tATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaaa < 1:7683665/76‑1 (MQ=255) gggAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaaaaaa > 1:5463008/1‑76 (MQ=255) gggAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATaaaaaaa > 2:4860478/1‑76 (MQ=255) aaTGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACtt > 2:1256687/1‑76 (MQ=255) tGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACtttt > 1:8035159/1‑76 (MQ=255) gCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACttttt > 1:8655354/1‑76 (MQ=255) ccAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTta < 1:5786767/76‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTta > 1:7921348/1‑76 (MQ=255) cAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTtat > 1:8770003/1‑76 (MQ=255) cAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTtat > 2:8309238/1‑76 (MQ=255) cAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGCGTTATAAAAAAACTTTTtat > 1:6535285/1‑76 (MQ=255) aGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTtata < 2:2915845/76‑1 (MQ=255) aGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTtata < 1:2298849/76‑1 (MQ=255) gCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAg < 1:2095280/76‑1 (MQ=255) tctTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTc > 1:3174480/1‑76 (MQ=255) ctTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCg < 2:634786/76‑1 (MQ=255) ctTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCg < 2:2483555/76‑1 (MQ=255) ctTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCg > 1:656955/1‑76 (MQ=255) ttATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGa > 2:6911213/1‑76 (MQ=255) tATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAg > 1:603418/1‑76 (MQ=255) tGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGtt < 1:8569480/76‑1 (MQ=255) gATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTg > 2:333420/1‑76 (MQ=255) atatatatGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGc < 2:5715007/76‑1 (MQ=255) atatatatGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGc > 2:8972116/1‑76 (MQ=255) tatatatGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGCt < 1:10034139/76‑1 (MQ=255) tatatatGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGCt > 2:4640299/1‑76 (MQ=255) | GATAAAAAGTGCCGTTTATACGCCGAAAATAAGATATTGTGATTTCATAGATTATGGGAATGCCAGCTCTTATGATATATATGCTCAGTTTGAAAACTGGGATATTTTAATTGAGGGGTGTTATAAAAAAACTTTTTATAGTCGAGTTGCT > REL606/796949‑797099 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |