| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 799331 | 396 (1.620) | 4 (0.020) | 3/140 | 17.4 | 1.2% | intergenic (‑56/+728) | ECB_00739/ybhB | hypothetical protein/predicted kinase inhibitor |
| ? | REL606 | = 799578 | 285 (1.250) | intergenic (‑303/+481) | ECB_00739/ybhB | hypothetical protein/predicted kinase inhibitor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/799252‑799331‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcatCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA < REL606/799578‑799504 AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA < 2:6716683/76‑1AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA < 2:4499526/76‑1AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA < 2:4349522/76‑1AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA > 2:1735257/1‑76AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA > 1:3401575/1‑76AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA > 1:7448314/1‑76AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAA > 1:5144721/1‑76 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT > 1:1551788/1‑76 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT < 2:876884/76‑1 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT < 2:6003727/76‑1 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT < 2:5985561/76‑1 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT < 2:1000843/76‑1 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT > 1:6951133/1‑76 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT < 1:3941204/76‑1 ATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAAT > 1:3006435/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC > 1:1978492/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC > 1:5562841/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC > 1:2839110/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC > 2:4044762/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC > 2:3052398/1‑76 TATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATC < 1:3614566/76‑1 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:1845907/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 2:1048411/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:775869/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:5422983/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:3495487/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:6583217/1‑76 ATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCA > 1:5607919/1‑76 TATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAT > 2:5589438/1‑76 TATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAT > 1:1793420/1‑76 TTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATT > 2:5265665/1‑76 GCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTTGTATCT > 2:5082788/1‑76 GCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCT > 2:2577766/1‑76 TGAACTATTTAAATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCAT > 2:4506427/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC > 1:7671092/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC > 1:2411028/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC > 2:4405058/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC > 1:2851571/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC > 1:5022138/1‑76 ATCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATC < 1:975777/76‑1 TCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCG > 2:7589664/1‑76 TCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCG > 2:1186258/1‑76 TCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCG > 1:6737152/1‑76 TCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCG > 2:6383984/1‑76 TCATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCG < 2:5929057/76‑1 CATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGC > 1:5789543/1‑76 CATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGC > 2:238410/1‑76 CATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGC > 2:588812/1‑76 CATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGC < 1:7689141/76‑1 ATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCC < 1:5945244/76‑1 ATCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCC > 2:5221955/1‑76 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA < 1:1271790/76‑1 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA < 2:6461248/76‑1 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA < 2:5865900/76‑1 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA > 2:3820273/1‑76 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA > 2:3401575/1‑76 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA > 2:2822854/1‑76 TCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA > 2:103110/1‑76 AATATATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/799252‑799331‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcatCAATTCAGAATACAAAGTCACATGCTAATGTTCTGCATTGGTATCTTTTGCTTATCCATGTCTACATTATCGCCA < REL606/799578‑799504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |