| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 135986 | 231 (0.950) | 3 (0.010) | 3/134 | 17.0 | 1.4% | coding (1568/2598 nt) | acnB | aconitate hydratase |
| ? | REL606 | = 3060774 | 210 (0.960) | coding (409/1173 nt) | ECB_02854 | conserved hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCCATACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTGCGCGA > REL606/135911‑136061 | cccATACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGt > 2:2413052/1‑76 (MQ=255) ccttACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTa < 1:6762518/73‑1 (MQ=255) ccATCCCCTTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTa < 2:4680079/76‑1 (MQ=255) cATACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTaa > 2:3048968/1‑76 (MQ=255) cATACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑GTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACCGGCGTaa > 1:4169496/1‑76 (MQ=255) cATACCCGTTTCCCGATCGCTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTaa > 1:6749768/1‑76 (MQ=255) aTACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCCACTGGCGtgac > 1:1803771/1‑73 (MQ=255) tccccGTTTCCCGATCGGTACCTCTTCCCCGGCGGG‑TCCTGGTCTGGGGGCG‑TTTCCTGCCGCAACTGGCGTAATg < 2:700352/74‑1 (MQ=255) tACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGGCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCCACTGGCGTaaag > 2:4047485/1‑74 (MQ=255) aCCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCCGCCGCAACTGGCGTAATGc > 1:7087163/1‑76 (MQ=255) cccGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGcc < 2:1892119/76‑1 (MQ=255) ccGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTTGTCTTGTGGCG‑TTTGCTGCCCCAACTTGCGTAAAGcgg > 1:5046356/1‑74 (MQ=255) ccGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCg < 1:2875745/76‑1 (MQ=255) ccGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCg < 1:6232144/76‑1 (MQ=255) ccGTTCCCCGATCGGTATCTCTTGCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCg < 1:4743299/76‑1 (MQ=255) cGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGc > 2:3810770/1‑76 (MQ=255) gTTTCCCGAGCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCt < 1:4634050/76‑1 (MQ=255) tttCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTTTTGCCTGGGGGGG‑TTTGCTGCCGCCACCGGCGTAAAGCCGCTg > 1:3015931/1‑76 (MQ=255) tttCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTg < 1:1508773/76‑1 (MQ=255) tttCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAAATGGCGTAATGCCGCTg > 2:4793646/1‑76 (MQ=255) tttCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑GTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTg > 1:4312614/1‑76 (MQ=255) tttCCCGATCGGTATCTCTTCCCCGGCGGG‑TTCTGGTGTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTg < 2:6190847/76‑1 (MQ=255) ttCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCTGCAAATGGCGTAATGCCGCTgg > 1:7827628/1‑76 (MQ=255) tCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGa > 2:3652555/1‑76 (MQ=255) tCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGa > 2:6388645/1‑76 (MQ=255) tCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAAATGGCGGAAAGCCGCTggg > 2:4264642/1‑75 (MQ=255) cccGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGat < 1:2615074/76‑1 (MQ=255) cccGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGat > 2:3107921/1‑76 (MQ=255) cGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGatat < 1:6020418/76‑1 (MQ=255) gATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATg < 2:6473870/76‑1 (MQ=255) gATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATg < 2:5293931/76‑1 (MQ=255) aTCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCGGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCCGGGTATGc > 2:5038736/1‑76 (MQ=255) tCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGcc < 1:5983819/76‑1 (MQ=255) tCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGcc < 1:2481916/76‑1 (MQ=255) cGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCTTAATGCCGCTGGGTATGCCg > 1:2317660/1‑76 (MQ=255) cGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCg > 1:7005174/1‑76 (MQ=255) ggTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCgg > 2:3825185/1‑76 (MQ=255) gTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCGACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCCGa > 2:711282/1‑76 (MQ=255) gTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGa > 1:1400632/1‑76 (MQ=255) tATCTCTTTCCCGGCGGG‑GTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGGCGCTGGGTATGCCGGaa > 2:6653692/1‑76 (MQ=255) aTCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAAt > 2:3366046/1‑76 (MQ=255) aTCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAAt > 2:1755372/1‑76 (MQ=255) aTCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGGGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAAt > 1:7244289/1‑76 (MQ=255) tctTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCg > 1:7147540/1‑76 (MQ=255) tctTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCg < 1:366079/76‑1 (MQ=255) ttttCCCGGCGGG‑TTCTGGTCGGGGGGCT‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGt < 2:7549296/75‑1 (MQ=255) ctTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGGGTAATGCCGCTGGTTATGCCGGAATCCGt > 2:2817320/1‑76 (MQ=255) ttccccGGCGTG‑TTCTGGTCGGGTCGGT‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGtt < 2:6958442/73‑1 (MQ=255) tCCGGGGGGG‑TTGTTGTCT‑GTGGCGTTTTCCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATTTGCCGGAATCCGTTCt < 2:27612/76‑1 (MQ=255) ccGGGGGGTTTCTGGTCTGGTGGCG‑TTGGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTg < 2:2506289/76‑1 (MQ=255) gcggG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTgc > 2:7293797/1‑76 (MQ=255) gg‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCt > 2:7349656/1‑76 (MQ=255) g‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCtt > 1:6648881/1‑76 (MQ=255) ttCTGTGCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTc < 1:6351949/76‑1 (MQ=255) ttCTGGTCTGGTGGCT‑TTTCCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTc < 2:2887314/76‑1 (MQ=255) ttCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTc > 2:2882633/1‑76 (MQ=255) tctggtctggTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCa > 1:2119342/1‑76 (MQ=255) tctggtctggTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCa > 2:4529508/1‑76 (MQ=255) tctggtctggTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCa > 2:673354/1‑76 (MQ=255) ctggtctggtGGGT‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa < 1:7599639/76‑1 (MQ=255) ctggtctggtGGCT‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa < 2:1609722/76‑1 (MQ=255) ctggtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa < 2:5181710/76‑1 (MQ=255) ctggtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa > 2:7610309/1‑76 (MQ=255) ctggtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa > 1:160081/1‑76 (MQ=255) ctggtcgggtGCCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaa < 2:783243/76‑1 (MQ=255) tggtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCaaa > 1:1007562/1‑76 (MQ=255) ggtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAg > 1:7252366/1‑76 (MQ=255) gtctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAgg > 1:2808432/1‑76 (MQ=255) gtctggtGGCG‑TTGCCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAgg < 2:2789830/76‑1 (MQ=255) tctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGc > 2:3191440/1‑76 (MQ=255) ctggtGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCa > 1:6153054/1‑76 (MQ=255) tggtggCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaa > 2:1472802/1‑76 (MQ=255) ggtggCT‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaaa < 1:90070/76‑1 (MQ=255) ggtggCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaaa > 1:2255983/1‑76 (MQ=255) ggtggCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaaa > 1:5525451/1‑76 (MQ=255) ggtggCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaaa > 2:6307307/1‑76 (MQ=255) ggtggCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCaaa > 1:7686147/1‑76 (MQ=255) ggtg‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATg < 1:1095241/73‑1 (MQ=255) gCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGc < 1:529876/76‑1 (MQ=255) gCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGc < 2:568953/76‑1 (MQ=255) gCG‑TTTCCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGc < 1:3511803/76‑1 (MQ=255) gttttGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCa < 1:4856513/74‑1 (MQ=255) g‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAg > 1:95528/1‑76 (MQ=255) g‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAg > 1:5813598/1‑76 (MQ=255) ttGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGcc > 1:5437826/1‑76 (MQ=255) tgctgcCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCg > 2:7468890/1‑76 (MQ=255) tgcCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGc < 2:1309986/76‑1 (MQ=255) tgcCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGc > 1:3731832/1‑76 (MQ=255) gcCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCa > 2:4436969/1‑76 (MQ=255) cAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCAc > 2:5756442/1‑76 (MQ=255) accTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCAcc < 1:384853/74‑1 (MQ=255) cTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCt < 2:852118/76‑1 (MQ=255) cTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCt > 2:5581702/1‑76 (MQ=255) cTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCt > 2:4619416/1‑76 (MQ=255) cTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCt < 2:4312614/76‑1 (MQ=255) tGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTg > 1:3405522/1‑76 (MQ=255) tGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTg > 1:1463903/1‑76 (MQ=255) tGGCGCAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTg > 2:6433945/1‑76 (MQ=255) tAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTGCGCGa > 2:2621586/1‑76 (MQ=255) tAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTGCGCGa > 1:1042962/1‑76 (MQ=255) | CCCATACCCGTTTCCCGATCGGTATCTCTTTCCCGGCGGG‑TTCTGGTCTGGTGGCG‑TTTGCTGCCGCAACTGGCGTAATGCCGCTGGATATGCCGGAATCCGTTCTGGTGCGCTTCAAAGGCAAAATGCAGCCGGGCATCACCCTGCGCGA > REL606/135911‑136061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |