| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 242742 | 103 (0.440) | 6 (0.030) | 5/136 | 19.4 | 4.1% | intergenic (+360/‑71) | ECB_00212/yhhI | hypothetical protein/predicted transposase |
| ? | REL606 | = 1506442 | 188 (0.890) | coding (65/792 nt) | ydcC | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTG > REL606/242667‑242768 | ggcagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTcc < 2:2697519/76‑1 (MQ=255) gcagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCt < 1:7020113/76‑1 (MQ=255) gcagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCt > 2:2562669/1‑76 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc > 1:3863554/1‑76 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc > 2:7082289/1‑76 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 1:764091/76‑1 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 1:1815673/76‑1 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 1:780882/76‑1 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc > 1:2157910/1‑76 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 2:429607/76‑1 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 2:2164242/76‑1 (MQ=255) cagggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTc < 2:4186874/76‑1 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 2:6203481/1‑76 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 2:4448289/1‑76 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 2:5286520/1‑76 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 2:5355525/1‑76 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 1:5927299/1‑76 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa < 2:3915868/76‑1 (MQ=255) agggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCa > 2:3269676/1‑76 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAt < 1:2931228/76‑1 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAt < 1:5583704/76‑1 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAt < 2:1686100/76‑1 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAt < 1:2356346/76‑1 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAt > 2:1331441/1‑76 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt < 1:1508535/76‑1 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt < 2:1559159/76‑1 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt < 1:7374584/76‑1 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt > 1:1811893/1‑76 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt < 2:6577688/76‑1 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt < 2:6492618/76‑1 (MQ=255) ggAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCAtt > 1:3308387/1‑76 (MQ=255) gAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTa < 1:5442335/76‑1 (MQ=255) gAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTa < 1:2219967/76‑1 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 2:2991648/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 2:5977255/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 2:5701110/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 2:1840393/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 1:4264734/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc > 2:3446935/1‑76 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc < 1:4916786/76‑1 (MQ=255) aaaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAc < 1:5152982/76‑1 (MQ=255) aaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAcc > 2:5008463/1‑76 (MQ=255) aaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAcc > 1:874888/1‑76 (MQ=255) aaGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTAcc > 2:896605/1‑76 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCt < 1:232880/76‑1 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCt < 1:4347009/76‑1 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCt < 1:6043497/76‑1 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCt < 1:5170286/76‑1 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTGATTTTTTGCACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCt < 1:3006273/76‑1 (MQ=255) gATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTg < 1:1509915/76‑1 (MQ=255) gATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTg < 1:965471/76‑1 (MQ=255) gATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTg < 2:1088725/76‑1 (MQ=255) gATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTg < 1:619959/76‑1 (MQ=255) aTCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTGCTCATTACCTGa > 1:3846482/1‑76 (MQ=255) aTCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGa > 1:7240133/1‑76 (MQ=255) aTCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGa > 2:4801300/1‑76 (MQ=255) aTCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGa < 1:6010800/76‑1 (MQ=255) tCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGaa < 1:7066959/76‑1 (MQ=255) tCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGaa < 2:1553441/76‑1 (MQ=255) tCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGaa < 2:63660/76‑1 (MQ=255) cACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAg < 1:1270340/76‑1 (MQ=255) cACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAg > 1:830664/1‑76 (MQ=255) cACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAg > 1:2950567/1‑76 (MQ=255) cACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAg > 1:2677376/1‑76 (MQ=255) cACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAg < 2:3476860/76‑1 (MQ=255) aCGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGc < 1:5939115/76‑1 (MQ=255) cGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCt > 2:3010337/1‑76 (MQ=255) gTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTg > 1:2972033/1‑76 (MQ=255) gTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTg > 2:6088593/1‑76 (MQ=255) tAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGt > 2:501639/1‑76 (MQ=255) tAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGt < 2:6672712/76‑1 (MQ=255) tAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGt > 2:6146395/1‑76 (MQ=255) tAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGt < 1:4737832/76‑1 (MQ=255) aaCGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtt > 1:1870939/1‑76 (MQ=255) aaCGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtt < 2:3700115/76‑1 (MQ=255) aaCGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtt > 2:4471237/1‑76 (MQ=255) aaCGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtt > 2:459181/1‑76 (MQ=255) aCGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGttt > 1:5190510/1‑76 (MQ=255) cGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttt < 2:7236097/76‑1 (MQ=40) cGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttt < 2:3308387/76‑1 (MQ=40) gCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGttttt > 1:7155343/1‑76 (MQ=39) gCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGttttt > 2:2170090/1‑76 (MQ=39) gCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGttttt < 2:2502858/76‑1 (MQ=39) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt < 1:2799585/76‑1 (MQ=38) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt < 1:4117056/76‑1 (MQ=38) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt < 2:3802951/76‑1 (MQ=38) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt < 1:2531710/76‑1 (MQ=38) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt > 1:7246482/1‑76 (MQ=38) cTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGtttttt < 2:2519086/76‑1 (MQ=38) tGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGTTTTTTa < 1:329831/76‑1 (MQ=35) tGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGTTTTTTa < 2:69539/76‑1 (MQ=35) 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GGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTGATTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTCATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTG > REL606/242667‑242768 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |