| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1143523 = | 181 (0.920) | 4 (0.020) | 4/136 | 15.9 | 2.3% | coding (1113/1536 nt) | mviN | predicted inner membrane protein |
| ? | REL606 | 1143547 = | 179 (1.010) | coding (1137/1536 nt) | mviN | predicted inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTG > REL606/1143450‑1143598 | cgcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTcc > 2:2004396/1‑76 (MQ=255)cgcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTcc > 1:3631270/1‑76 (MQ=255) gcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCt > 1:5416424/1‑76 (MQ=255) gcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCt > 1:1277397/1‑76 (MQ=255) gcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCt > 1:5700712/1‑76 (MQ=255) cTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTg > 2:1860644/1‑76 (MQ=255) cTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTg > 2:3283150/1‑76 (MQ=255) tgatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCtag > 1:2113909/1‑74 (MQ=255) tgatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTgg < 2:1131403/76‑1 (MQ=255) gatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGc > 1:6205473/1‑76 (MQ=255) gatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGc > 1:539410/1‑76 (MQ=255) gatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGc < 1:4446645/76‑1 (MQ=255) gaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCttt > 1:5611702/1‑76 (MQ=255) gaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCCGGCttt > 1:2714584/1‑76 (MQ=255) aCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCtttt < 1:1907334/76‑1 (MQ=255) aCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCtttt < 2:1190270/76‑1 (MQ=255) cccAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTa < 2:63976/76‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTAt > 1:417730/1‑76 (MQ=255) cAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTAtt < 1:3470360/76‑1 (MQ=255) gCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTtttttttc > 2:5041503/1‑74 (MQ=255) cGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTccc > 1:1506130/1‑76 (MQ=255) gggCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTTTTCCCg > 2:3922010/1‑76 (MQ=255) gTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGcccg > 2:1776236/1‑74 (MQ=255) gTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCCGGCTTTTTTTTCcccccg > 2:5414496/1‑74 (MQ=255) ttAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAgg < 1:1726514/76‑1 (MQ=255) ttAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAgg < 2:2273278/76‑1 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTTTTTCCGCCAGGa > 1:3723373/1‑76 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTTTTCCCGCCAGGa > 1:1098179/1‑76 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGa < 1:2659113/76‑1 (MQ=255) aTTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACa > 1:2255997/1‑76 (MQ=255) ttGCCTACTCGGTCGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACAt > 1:3005697/1‑76 (MQ=255) gCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTTCCGCCAGGACATTa > 1:6150398/1‑76 (MQ=255) gCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTa < 1:3107741/76‑1 (MQ=255) gCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTa < 1:2055904/76‑1 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGTTTTTATTCCCGCCAGGACAttca > 1:2985411/1‑74 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaa > 1:5810837/1‑76 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaa < 2:5471024/76‑1 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaa < 2:5566932/76‑1 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaa > 1:845954/1‑76 (MQ=255) ctgcTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaaa < 2:823613/73‑1 (MQ=255) cTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaaa < 1:3414505/76‑1 (MQ=255) tACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaaaa < 2:6053637/76‑1 (MQ=255) tACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTaaaa < 2:4652515/76‑1 (MQ=255) tACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCCTGCTTTTATTTCCGACCGGACATTaaaa > 1:5053905/1‑76 (MQ=255) aCTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGGCAGGACATTaaaaa > 2:308608/1‑75 (MQ=255) aCTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAAc > 2:2569632/1‑76 (MQ=255) cTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACg > 1:4747027/1‑76 (MQ=255) ggTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCCGGACATTAAAACGCCa > 2:2471589/1‑76 (MQ=255) ggTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCa < 2:2346585/76‑1 (MQ=255) ggTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCa > 2:3483405/1‑76 (MQ=255) tGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGt < 1:4663319/76‑1 (MQ=255) gggTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTTCCGCCAGGACATTAAAAAGCCAggg > 1:1390396/1‑74 (MQ=255) ggTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGa > 1:663788/1‑76 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGaa < 1:1064169/76‑1 (MQ=255) ttGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGaaaa < 1:1550928/76‑1 (MQ=255) tGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAAt > 1:5305266/1‑76 (MQ=255) gATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAAtt > 2:5775458/1‑76 (MQ=255) gATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCCGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAAAGCCAGCGGAAAtt > 2:4298954/1‑76 (MQ=255) ttGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGc < 2:2147645/76‑1 (MQ=255) tGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCGGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGcc < 2:1078710/76‑1 (MQ=255) ccTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATc > 2:4720319/1‑76 (MQ=255) ccTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATc > 2:580340/1‑76 (MQ=255) ccTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATc < 1:5347395/76‑1 (MQ=255) cTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCg > 2:1401399/1‑76 (MQ=255) cTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCg > 2:3195876/1‑76 (MQ=255) tGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGt > 2:2966721/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTTAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt > 2:4052541/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt > 1:5188354/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt > 2:5949001/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt > 2:6010135/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt < 1:2771662/76‑1 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGtt > 2:3083331/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAAAGCCAGTGAAAATTGGCATCGtt > 2:4235011/1‑76 (MQ=255) gATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCCTTTTTTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAATTAAAATTGCCATCGtt > 2:1685678/1‑76 (MQ=255) aTTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGACATCGTTa > 2:4785703/1‑76 (MQ=255) ttGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTAc < 2:2681143/76‑1 (MQ=255) ttGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTAc < 1:4329954/76‑1 (MQ=255) ttGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTAc < 1:1250481/76‑1 (MQ=255) ttGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTAc > 1:2500359/1‑76 (MQ=255) ttGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATCCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTAc < 2:5217264/76‑1 (MQ=255) tGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACg < 1:1469737/76‑1 (MQ=255) gTAGTGAAAGTGTTGGCCCTTGTCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGc < 1:5561341/76‑1 (MQ=255) aGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTg < 2:3583501/76‑1 (MQ=255) aaGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATT‑AAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTa < 2:206163/76‑1 (MQ=255) aaGGGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAtttt < 1:5883065/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTa < 2:4846785/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTa < 1:601690/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTa < 1:4977476/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGAGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAttttt > 2:5584806/1‑75 (MQ=255) gtgtTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTaa > 1:572064/1‑76 (MQ=255) tgtTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAAc > 2:3832401/1‑76 (MQ=255) gtTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACg > 1:4699628/1‑76 (MQ=255) ttGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGc > 1:6265252/1‑76 (MQ=255) ttGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGc > 1:3993546/1‑76 (MQ=255) tGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCa > 2:4482391/1‑76 (MQ=255) tGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCa > 2:5686397/1‑76 (MQ=255) tGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCa > 2:1245067/1‑76 (MQ=255) gCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAGAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAAt > 1:3676721/1‑76 (MQ=255) cTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAAtt > 2:1531667/1‑76 (MQ=255) cTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAAtt < 2:1960623/76‑1 (MQ=255) | CGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTG > REL606/1143450‑1143598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |