| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2680076 = | 230 (1.170) | 8 (0.040) | 5/148 | 15.9 | 3.6% | coding (1148/1557 nt) | ECB_02510 | Recombinase |
| ? | REL606 | 2680568 = | 202 (1.040) | coding (94/897 nt) | ECB_02511 | ParB family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TTGGTGGTCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCATATAGA > REL606/2680001‑2680151 | ttGGTGGTCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGa < 2:702247/76‑1 (MQ=255)ttGGTGGTCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGa < 2:66838/76‑1 (MQ=255)ttGGTGGTCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGa > 1:1358868/1‑76 (MQ=255) gtggtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGc < 1:3492806/76‑1 (MQ=255) gtggtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGc > 2:6229750/1‑76 (MQ=255) gtggtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGc > 1:1862789/1‑76 (MQ=255) tggtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCa < 2:4381756/76‑1 (MQ=255) ggtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCAc > 1:2561901/1‑76 (MQ=255) gtCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACt < 2:3036682/76‑1 (MQ=255) tCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTa < 1:5280162/76‑1 (MQ=255) tCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTa < 1:2838876/76‑1 (MQ=255) tCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTa < 1:3051686/76‑1 (MQ=255) cTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTaa > 1:5123174/1‑76 (MQ=255) ttttAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAg < 2:6067888/76‑1 (MQ=255) ttttAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAg < 2:1833642/76‑1 (MQ=255) ttttAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAg < 2:2151927/76‑1 (MQ=255) ttttAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAg > 2:2926692/1‑76 (MQ=255) tAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATc > 2:2286984/1‑76 (MQ=255) aaGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCa < 1:4688906/76‑1 (MQ=255) agagCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCAt < 1:4084320/76‑1 (MQ=255) gagCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCAtt < 2:2591753/76‑1 (MQ=255) gCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCAtttt < 1:719918/76‑1 (MQ=255) cATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTa < 1:6196934/76‑1 (MQ=255) atatACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTAc > 1:166582/1‑76 (MQ=255) tataCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACt > 2:4831241/1‑76 (MQ=255) taCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCa > 2:603024/1‑76 (MQ=255) taCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCa > 1:4362145/1‑76 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag < 2:4860490/76‑1 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag > 2:1546301/1‑76 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag < 2:5188432/76‑1 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag < 2:2457299/76‑1 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag < 1:1806220/76‑1 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag > 2:4808673/1‑76 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag > 2:3870655/1‑76 (MQ=255) aCTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCag < 2:4487154/76‑1 (MQ=255) cTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCaga < 2:5754310/76‑1 (MQ=255) tttGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCagag < 1:1447572/76‑1 (MQ=255) tttGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCagag > 1:6324912/1‑76 (MQ=255) ttGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAgaga < 1:4955003/76‑1 (MQ=255) tGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGAt > 1:521577/1‑76 (MQ=255) gATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATa < 2:517544/76‑1 (MQ=255) gATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATa < 2:3845957/76‑1 (MQ=255) gATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATa < 2:1158796/76‑1 (MQ=255) aTTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATaa < 2:2826174/76‑1 (MQ=255) aTTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATaa > 1:1130182/1‑76 (MQ=255) aTTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATaa > 1:3107381/1‑76 (MQ=255) tGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAAtt < 1:4987576/76‑1 (MQ=255) ggTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTg < 2:2244364/76‑1 (MQ=255) gTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAAtgaa < 2:102614/76‑4 (MQ=255) ttATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAg > 2:1915383/1‑76 (MQ=255) tataAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAgg < 1:713738/76‑1 (MQ=255) aaGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATACATGAAGCACTAAGATCATTGTACTCAGAGCTAATTGAGGAtt > 2:2525970/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGAtt > 2:5801996/1‑76 (MQ=255) ccAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTa > 1:1630157/1‑76 (MQ=255) aGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAg > 1:6154858/1‑76 (MQ=255) aGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAg < 2:2663388/76‑1 (MQ=255) aGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAg > 1:2528209/1‑76 (MQ=255) aaCATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAggg < 2:5567044/76‑1 (MQ=255) aCATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGt < 1:4875934/76‑1 (MQ=255) cATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTg > 2:2029793/1‑76 (MQ=255) aTGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGa > 1:4425/1‑76 (MQ=255) aTGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGa < 1:4852555/76‑1 (MQ=255) gATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGaaa < 2:4748605/76‑1 (MQ=255) gATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGaaa < 1:1022856/76‑1 (MQ=255) tACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAAttt > 1:5826689/1‑76 (MQ=255) aCAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAAtttt < 2:4241202/76‑1 (MQ=255) cAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTa > 1:5149708/1‑76 (MQ=255) cAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTa > 2:630410/1‑76 (MQ=255) aGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTaa < 2:4055432/76‑1 (MQ=255) aGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTaa > 1:4224533/1‑76 (MQ=255) aGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTaa > 1:2201552/1‑76 (MQ=255) gCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTaaa < 1:5907986/76‑1 (MQ=255) gCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTaaa < 1:3594674/76‑1 (MQ=255) aTCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAg > 1:418706/1‑76 (MQ=255) aTCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAg > 1:2762912/1‑76 (MQ=255) aTCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAg > 2:1759926/1‑76 (MQ=255) aTCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAg > 1:5432903/1‑76 (MQ=255) ctcAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCa > 1:1175002/1‑76 (MQ=255) tcAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCaa < 1:5862747/76‑1 (MQ=255) tcAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCaa < 1:388399/76‑1 (MQ=255) cAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGGTAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAAc > 1:3980999/1‑76 (MQ=255) cAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAAc < 1:672510/76‑1 (MQ=255) cAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAAc > 1:2360103/1‑76 (MQ=255) aaaaTAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACt < 1:3239191/76‑1 (MQ=255) taaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCa > 1:3689381/1‑76 (MQ=255) taaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCa > 2:2135307/1‑76 (MQ=255) taaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCa < 1:4602660/76‑1 (MQ=255) aaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCat > 1:932225/1‑76 (MQ=255) aaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCat < 1:558003/76‑1 (MQ=255) aaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCat < 2:3132188/76‑1 (MQ=255) aaatGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCat > 2:2346470/1‑76 (MQ=255) atGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCatat < 1:1812686/76‑1 (MQ=255) tGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCAtata < 2:5062860/76‑1 (MQ=255) tGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCAtata > 2:3633937/1‑76 (MQ=255) tGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCAtata > 2:356997/1‑76 (MQ=255) tGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCAtata > 2:3242227/1‑76 (MQ=255) tGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCAtata > 1:2153012/1‑76 (MQ=255) gAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCATATAg < 1:3756042/76‑1 (MQ=255) aaGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCATATAGa > 2:341965/1‑76 (MQ=255) aaGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCATATAGa > 2:127243/1‑76 (MQ=255) | TTGGTGGTCTTTTAAGAGCATATACTTTGATTGGTTATAAGCCAGAACATGATTACAGCTATCTCAAAATAAATGAAGCACTAAGATCATTTTACTCAGAGATAATTGAGGATTTTAAGGGTGAAATTTTAAAAAGCAACTGTCATATAGA > REL606/2680001‑2680151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |