| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3021237 = | 175 (0.890) | 5 (0.030) | 3/142 | 17.0 | 2.2% | coding (247/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3021461 = | 278 (1.500) | coding (23/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
AGCTTTATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTGACAACA > REL606/3021386‑3021536 | gCTTTATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTaaa > 1:1463144/1‑76 (MQ=255) cTTTATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTaaaa > 2:29751/1‑76 (MQ=255) tttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAac < 1:5933427/76‑1 (MQ=255) tttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAac > 1:2180682/1‑76 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca < 2:5107524/76‑1 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca < 2:4847022/76‑1 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca < 1:5801768/76‑1 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca > 2:3020481/1‑76 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca > 1:6016908/1‑76 (MQ=255) ttATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAaca > 1:2257549/1‑76 (MQ=255) tATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAacac < 1:5238803/76‑1 (MQ=255) tATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAacac < 1:830726/76‑1 (MQ=255) aTTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAAcaca < 1:3847487/76‑1 (MQ=255) tttttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaa < 1:557216/76‑1 (MQ=255) ttttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaac < 1:3712347/76‑1 (MQ=255) ttttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaac < 1:4605593/76‑1 (MQ=255) ttttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaac < 2:1661624/76‑1 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca > 1:2545149/1‑76 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca < 2:2618017/76‑1 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca > 1:5724107/1‑76 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca > 1:2983389/1‑76 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca < 2:5392893/76‑1 (MQ=255) tttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACacaaca > 2:6102631/1‑76 (MQ=255) ttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACAcaacaa < 1:425131/76‑1 (MQ=255) ttttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACAcaacaa > 1:1033534/1‑76 (MQ=255) tttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAAt < 2:4464319/76‑1 (MQ=255) tttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAAt < 1:1268078/76‑1 (MQ=255) ttAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATa > 1:696474/1‑76 (MQ=255) tAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaa > 1:1064455/1‑76 (MQ=255) tAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaa < 1:1659546/76‑1 (MQ=255) aaaTATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaac < 2:867084/76‑1 (MQ=255) atatatAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaacaa > 2:5319101/1‑76 (MQ=255) atataATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaacaaca > 2:3592209/1‑76 (MQ=255) ataATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaacaacaac > 1:5124248/1‑76 (MQ=255) ataATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATaacaacaac > 1:2351276/1‑76 (MQ=255) taATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAacaacaaca < 1:2725449/76‑1 (MQ=255) taATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAacaacaaca < 2:3131804/76‑1 (MQ=255) aaTTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAAcaacaacaa > 2:3419141/1‑76 (MQ=255) aTTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAag < 2:4745701/76‑1 (MQ=255) ttATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAaga > 2:2477261/1‑76 (MQ=255) ttATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAaga < 1:3152215/76‑1 (MQ=255) ttATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAaga < 1:4297511/76‑1 (MQ=255) tgatcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAaga < 1:4324137/74‑1 (MQ=255) tATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAagag < 1:3808422/76‑1 (MQ=255) atcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAgaga < 2:5931224/76‑1 (MQ=255) atcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAgaga > 1:5470278/1‑76 (MQ=255) atcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAgaga > 1:1141886/1‑76 (MQ=255) atcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAgaga < 1:4848284/76‑1 (MQ=255) atcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAgaga < 1:861070/76‑1 (MQ=255) tcatcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGat < 1:3206159/76‑1 (MQ=255) catcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGata > 1:618884/1‑76 (MQ=255) catcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGata < 1:3043833/76‑1 (MQ=255) catcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGata < 1:3513800/76‑1 (MQ=255) catcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGata > 1:1382376/1‑76 (MQ=255) atcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGatat < 2:64760/76‑1 (MQ=255) tcTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGAtata > 2:6264055/1‑76 (MQ=255) cTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaa > 2:4262552/1‑76 (MQ=255) cTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaa > 1:4774490/1‑76 (MQ=255) cTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaa > 1:4935499/1‑76 (MQ=255) cTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaa > 1:1867139/1‑76 (MQ=255) cTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaa > 2:1301600/1‑76 (MQ=255) tataATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATaaa < 2:280369/76‑1 (MQ=255) ataataACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAAt < 1:4014144/76‑1 (MQ=255) taataaCATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAAtt < 1:2842175/76‑1 (MQ=255) aataaCATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTc > 2:1823206/1‑76 (MQ=255) ataaCATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCt > 1:1809466/1‑76 (MQ=255) ataaCATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCt > 1:5770919/1‑76 (MQ=255) aCATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTaa > 1:1948444/1‑76 (MQ=255) cATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAAt > 2:6172033/1‑76 (MQ=255) cATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAAt > 1:5207029/1‑76 (MQ=255) tCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCg < 2:4610702/76‑1 (MQ=255) cTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGc > 1:4078615/1‑76 (MQ=255) 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cTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatc < 2:2082137/76‑1 (MQ=255) ttGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatca > 1:2490834/1‑76 (MQ=255) ccTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatcatca < 1:3553310/76‑1 (MQ=255) cTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatcatcat > 1:2061096/1‑76 (MQ=255) ttAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatcatcatc > 2:5689196/1‑76 (MQ=255) ttAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAatcatcatc > 1:4203871/1‑76 (MQ=255) aCATAAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTg < 2:116307/76‑1 (MQ=255) ttAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTGaca < 1:974781/76‑1 (MQ=255) aaaCACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTGacaaca < 2:1497955/76‑1 (MQ=255) aaaCACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTGacaaca < 1:3313768/76‑1 (MQ=255) | AGCTTTATTTTTTTAAATATATAATTATCATCTATAATAACATCTTTATCAGAAGTGATGCTTGCCTTAACATTAAAACACAACAATAACAACAACAAGAGATATAAATTCTTAATCGCATTCATAAAAAATAATCATCATCCTGACAACA > REL606/3021386‑3021536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |