New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3011924 = | 57 (1.920) | 3 (0.110) | 3/142 | 3.8 | 5.4% | intergenic (‑364/‑210) | ECB_02812/ECB_02813 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein |
? | REL606 | 3012055 = | 51 (1.820) | intergenic (‑495/‑79) | ECB_02812/ECB_02813 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTCAATAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGTTCT > REL606/3011849‑3011999 | ttCAATAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCa < 1:242857/76‑1 (MQ=255) tCAATAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCAc > 1:933997/1‑76 (MQ=255) aaTAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACtt > 1:922363/1‑76 (MQ=255) aaTAGTCACCGCTAAAATNTTATTATTTTCCTCATCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACtt < 1:756377/76‑1 (MQ=255) aTAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTa < 2:922362/76‑1 (MQ=255) aGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTNTCAACCNGTTTATTATGCCGCACTTaan > 1:811340/1‑75 (MQ=255) aGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGCAAATTNTCAACCNGTTTATTATGCCGCACTTaan > 1:811347/1‑75 (MQ=255) gTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAAt < 1:916563/76‑1 (MQ=255) tCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTNTTATGCCGCACTTAAATa > 1:760053/1‑76 (MQ=255) ccGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGtt > 1:627000/1‑76 (MQ=255) ccGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGtt < 1:613327/76‑1 (MQ=255) ccGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGtt > 1:307482/1‑76 (MQ=255) cTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTACTTAGAGGGAAATTGTCGACCTGTTTACCATGCCGTACTTACATACTTacc > 1:883016/1‑74 (MQ=255) aaTTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATcaca < 2:215491/76‑1 (MQ=255) aaTTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATcaca > 1:590044/1‑76 (MQ=255) aaTTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATcaca < 2:335328/76‑1 (MQ=255) aTTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACaa < 2:234403/76‑1 (MQ=255) ttttATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACaaa < 2:760053/76‑1 (MQ=255) tttATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACaaaa < 1:466777/76‑1 (MQ=255) tttATTATTTTACTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTNAAATAGTTAATCACaaaa > 1:759065/1‑76 (MQ=255) attattTTCCTCTTCTTTNCATGGAAATTGTCAGCCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAaacaa < 1:754494/76‑1 (MQ=255) ntantNGCCTCTGCNGTACAGGTGAATGGTCANCCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATACTTAATCACAAaacaac < 1:814707/75‑1 (MQ=255) tattTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAacaaca > 1:524959/1‑76 (MQ=255) ttttCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATc < 2:239985/76‑1 (MQ=255) tttCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCa < 2:651603/76‑1 (MQ=255) tCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCAcc > 1:674589/1‑76 (MQ=255) ctctTCTTTACATGGAAATTGTCAATCTGTTTATNATGCCGCACTTAAATANTGCATCACAAAACAACNTCACCat > 2:855934/1‑76 (MQ=255) ctctTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCat > 2:899848/1‑76 (MQ=255) ttcttTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCatgat > 1:465122/1‑76 (MQ=255) tcttTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCattatt < 2:152020/76‑1 (MQ=255) ttACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCattatt < 2:553658/73‑1 (MQ=255) ttACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCattatt > 1:553658/1‑73 (MQ=255) naTGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCgtg > 1:14615/2‑76 (MQ=255) cATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCgtg > 1:439068/1‑76 (MQ=255) cATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCgtg > 2:760960/1‑76 (MQ=255) tGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCGCTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGtt < 2:452041/76‑1 (MQ=255) tGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGtt > 1:325836/1‑76 (MQ=255) tGGAAATCGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTACTCACAAAACAACATCAACATTATTTGCGTGtt > 1:866334/1‑76 (MQ=255) gTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTttatttat < 2:588838/76‑1 (MQ=255) cAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATttatta > 1:50087/1‑76 (MQ=255) cAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATttatta < 2:389378/76‑1 (MQ=255) aCCTGTTTATTATGCCGCNCTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATtaat < 1:760960/76‑1 (MQ=255) ccTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTGTTTGCGTGTTTTATTTATtaata < 1:741882/76‑1 (MQ=255) tGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAAc > 2:771379/1‑76 (MQ=255) tGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAAc > 2:254663/1‑76 (MQ=255) tttATTCTGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACAt > 1:144217/1‑76 (MQ=255) ttattaTGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATa < 1:419416/76‑1 (MQ=255) ttattaTGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATa > 1:194511/1‑76 (MQ=255) tatGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCa < 1:561891/76‑1 (MQ=255) tatGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCa > 2:354089/1‑76 (MQ=255) atGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACNTCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCAt < 1:776875/76‑1 (MQ=255) atGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCCTGTTTTATTTATTAATAACATAGTTAt > 1:460812/1‑76 (MQ=255) atGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCATGTTTTATTTATTAATAACATAGTAAt > 1:460803/1‑76 (MQ=255) tGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATa < 2:460744/76‑1 (MQ=255) cGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGt < 1:960385/76‑1 (MQ=255) gCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGtt < 2:670520/76‑1 (MQ=255) cACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGTTc > 2:546740/1‑76 (MQ=255) aCTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGTTCt > 1:264942/1‑76 (MQ=255) | TTCAATAGTCACCGCTAAAATTTTATTATTTTCCTCTTCTTTACATGGAAATTGTCAACCTGTTTATTATGCCGCACTTAAATAGTTAATCACAAAACAACATCACCATTATTTGCGTGTTTTATTTATTAATAACATAGTCATACGTTCT > REL606/3011849‑3011999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |