Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 41 (1.130) | 33/144 | 0.2 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 44 (1.210) | 33/144 | 0.2 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
CAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448560‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA > REL606/2772854‑2772930 CAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG < 1:172512/76‑1 GTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:1056843/1‑76 GTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 2:602357/1‑76 TATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:1010417/76‑1 ATTTCACTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGTCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC > 1:69454/1‑76 TTGATTGGTCGCCCGCAGNCATTAGCTGATTAACAGGCGAAAAAAAGCCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:1158402/1‑76 TTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT < 1:810154/76‑1 TTGATTGGTCGCCAGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:75845/1‑76 GATTGGTCGCCCGNAGCCATTAGCTGATNAANCGGCGTAAAAAAACCGTGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA < 2:1088958/76‑1 GATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGTTTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGTATGATACCATAAGCGCTAACTTAA > 1:1147510/1‑76 TTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCGATAAGCGCTCACTTAGGG > 2:49655/1‑76 TTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:357144/76‑1 TTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGAGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 2:80253/1‑76 GGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAAAAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT > 2:419168/1‑76 TCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 2:386543/76‑1 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:396008/76‑1 CAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:237875/76‑1 CAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:274891/76‑1 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA > 1:578361/1‑76 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:641104/1‑76 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG > 2:143416/1‑76 CATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 2:522154/1‑76 ATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC > 1:841139/1‑76 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 1:663426/76‑1 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTTAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT < 1:1109425/76‑1 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 2:974730/76‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTG > 2:310367/1‑76 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC > 2:990345/1‑76 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:984115/76‑1 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:903096/1‑76 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAT < 2:412487/76‑1 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATT < 1:594658/76‑1 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA > 1:746433/1‑76 gatGAATTATCCCATAATCGCTAACCTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC < 2:426655/73‑1 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 2:867509/76‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCA < 1:886558/76‑1 TTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC > 1:549264/1‑76 TATCCCATAAGCGCTAAGTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACATGCCGACGAATTACTCTCACG > 2:184514/1‑76 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA > 1:204807/1‑76 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA > 1:477706/1‑76 aCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT < 2:367275/75‑1 aCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT < 1:888664/75‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT > 2:253125/1‑76 CCCATAAGCGCTAGCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA > 1:77045/1‑76 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:704657/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 2:413895/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:134441/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:724028/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:518120/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 2:1120773/76‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA < 2:650889/76‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA > 1:394065/1‑76 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGACGAATTACTCTCACGATca > 2:523349/1‑74 CAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448560‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA > REL606/2772854‑2772930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |