| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 41 (1.130) | 33/144 | 0.2 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 44 (1.210) | 33/144 | 0.2 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
CCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACC > REL606/2448423‑2448573 | cccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACANAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:1132589/76‑1 (MQ=255) ccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTc < 2:936770‑M1/76‑2 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTcc < 2:867509‑M1/8‑1 (MQ=255) tGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc > 1:790902‑M1/1‑73 (MQ=255) gtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaggttagcgattatgggATAattcatc < 2:426655‑M1/10‑4 (MQ=255) ggTTAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGGCGGGGATAATTccca < 2:252719‑M1/76‑5 (MQ=255) ggTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccca < 2:843265‑M1/76‑5 (MQ=255) taattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:746433‑M1/66‑76 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccat > 2:1051667‑M1/1‑71 (MQ=255) aattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCgg < 1:594658‑M1/12‑1 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataa < 1:235723‑M1/76‑8 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataa < 2:369087‑M1/76‑8 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccaaaa < 1:235712‑M1/76‑8 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataag > 2:109389‑M1/1‑68 (MQ=255) atcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttt < 2:412487‑M1/17‑1 (MQ=255) gCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgcta < 1:350687‑M1/76‑14 (MQ=255) cggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt > 1:903096‑M1/58‑76 (MQ=255) 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cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaac > 1:1116582‑M1/1‑48 (MQ=255) cagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 1:315506‑M1/1‑46 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccat < 1:627248‑M1/76‑32 (MQ=255) gcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc > 2:62691‑M1/1‑44 (MQ=255) aggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:663426‑M1/38‑1 (MQ=255) ggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAAt > 1:841139‑M1/38‑76 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATg > 2:522154‑M1/37‑76 (MQ=255) cgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg > 2:143416‑M1/36‑76 (MQ=255) cTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga < 1:261902‑M1/76‑36 (MQ=255) 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aaGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgatgaatgcgac > 1:45135‑M1/1‑31 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTTTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAcc > 2:419168‑M1/24‑76 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggATAATTCCTCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCaa > 2:80253‑M1/22‑76 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCaa < 1:357144‑M1/55‑1 (MQ=255) ccctaagtgagcgcttatcggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCaa > 2:49655‑M1/22‑76 (MQ=255) ttaagttagcgcttatggtATCATACCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAACAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATc > 1:1147510‑M1/20‑76 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATAATTCCACGGTTTTTTTACGCCGNTTNATCAGCTAATGGCTNCGGGCGACCAATc < 2:1088958‑M1/57‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCTGGCGACCAATCaa > 1:75845‑M1/18‑76 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaa < 1:810154‑M1/59‑1 (MQ=255) 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aaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgcggcctcggtgcctcgt > 2:237172‑M1/1‑16 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgt > 2:957717‑M1/1‑16 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgt > 2:353865‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtt > 2:412215‑M1/1‑15 (MQ=255) cttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTg < 1:172512‑M1/68‑1 (MQ=255) aGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtta < 1:491685‑M1/76‑63 (MQ=255) aGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtta > 1:945792‑M1/1‑14 (MQ=255) gCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 2:137768‑M1/76‑64 (MQ=255) ccGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaag > 1:786241‑M1/1‑12 (MQ=255) 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aaTTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcc > 1:620363‑M1/1‑4 (MQ=255) aaTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGc > 2:6422/1‑76 (MQ=255) ttcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc < 2:790901‑M1/76‑75 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcg > 1:568149‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACC > REL606/2448423‑2448573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |