New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2036748 = | 93 (1.330) | 4 (0.060) | 4/140 | 7.7 | 4.0% | coding (211/1113 nt) | wbbC | putative glycosyltransferase WbbC |
? | REL606 | 2036931 = | 105 (1.610) | coding (28/1113 nt) | wbbC | putative glycosyltransferase WbbC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTATGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTG > REL606/2036673‑2036823 | ttATGTTATAGTTATGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGcc > 2:2168381/1‑76 (MQ=255) ttATGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGcc > 1:2144933/1‑76 (MQ=255) tATGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCt > 1:80184/1‑76 (MQ=255) tATGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCt > 1:1827451/1‑76 (MQ=255) aTGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtt < 2:178535/76‑1 (MQ=255) aTGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtt < 2:2109250/76‑1 (MQ=255) aTGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtt < 2:1468688/76‑1 (MQ=255) aTGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtt < 2:795300/76‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCttt < 1:2026673/76‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCttt < 2:554506/76‑1 (MQ=255) gTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtttt < 1:838769/76‑1 (MQ=255) gTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCtttt < 1:1413114/76‑1 (MQ=255) ttATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCttttn < 1:4839/76‑2 (MQ=255) ttATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTa > 1:1986625/1‑76 (MQ=255) ttATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTa < 1:171685/76‑1 (MQ=255) ataGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACa > 1:241993/1‑76 (MQ=255) taGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAg > 1:10479/1‑76 (MQ=255) taGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAg < 1:1245432/76‑1 (MQ=255) aGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAgg < 1:2116329/76‑1 (MQ=255) gTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGa > 1:319408/1‑76 (MQ=255) ttACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGAt > 2:1566722/1‑76 (MQ=255) tACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGAtt > 1:2032469/1‑76 (MQ=255) aCGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATta < 2:2178653/76‑1 (MQ=255) cGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATtat < 2:1629952/76‑1 (MQ=255) gAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATtata < 2:583709/76‑1 (MQ=255) gAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATtata > 2:1187545/1‑76 (MQ=255) aaaTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAg < 2:1555513/76‑1 (MQ=255) aaTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAgg < 2:2183839/76‑1 (MQ=255) aaTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAgg > 2:1133868/1‑76 (MQ=255) ttAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTaa > 2:2250420/1‑76 (MQ=255) ttAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTaa < 1:2164125/76‑1 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 2:324730/1‑76 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 2:656380/1‑76 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 2:1349177/1‑76 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 2:1349170/1‑76 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 2:1349150/1‑76 (MQ=255) aaTCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAata > 1:1792414/1‑76 (MQ=255) cGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAAtatta < 1:39206/76‑1 (MQ=255) cGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTCTACAGGATTATAGGTAAtatta < 1:605442/76‑1 (MQ=255) gCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATattatt > 2:459732/1‑76 (MQ=255) gCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATattatt < 1:1295497/76‑1 (MQ=255) aTAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGt > 2:2097069/1‑76 (MQ=255) tAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGtt > 2:537835/1‑76 (MQ=255) atatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTc > 2:213712/1‑76 (MQ=255) tatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCt > 1:21384/1‑76 (MQ=255) atCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTg > 2:729717/1‑76 (MQ=255) atCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTg > 2:896576/1‑76 (MQ=255) tCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTgg < 2:1931592/76‑1 (MQ=255) tCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTgg < 2:241727/76‑1 (MQ=255) tGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGaa > 1:516924/1‑76 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt > 1:1211433/1‑76 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt > 1:1211415/1‑76 (MQ=255) gTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTg < 1:2233260/76‑1 (MQ=255) tAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGa > 1:349374/1‑76 (MQ=255) tAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGa > 2:1745448/1‑76 (MQ=255) tAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGa > 2:868631/1‑76 (MQ=255) tAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGa > 1:349376/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa > 2:136634/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa > 1:1548692/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa > 2:1761246/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa > 2:1897480/1‑76 (MQ=255) aaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAAc > 1:706297/1‑76 (MQ=255) aaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAAc > 2:436860/1‑76 (MQ=255) aTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACa < 1:428915/76‑1 (MQ=255) aTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACa < 2:2215033/76‑1 (MQ=255) aTAACACGCGAAAATTTACCATGAATGCCTTTTAAAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTATGGAAAATTGAACa < 2:2215062/76‑1 (MQ=255) aaCACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAAt < 1:1082163/76‑1 (MQ=255) aaCACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATAGTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAAt < 1:1082184/76‑1 (MQ=255) acacGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAAtt < 1:1307661/76‑1 (MQ=255) cgcgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCtt > 2:2022830/1‑76 (MQ=255) cgcgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTAAACAATTCtt < 2:469080/76‑1 (MQ=255) gcgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCttt > 1:1177694/1‑76 (MQ=255) gcgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCttt < 1:1292178/76‑1 (MQ=255) cgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTa > 2:961777/1‑76 (MQ=255) cgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTa < 1:1297585/76‑1 (MQ=255) gAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTaa < 2:1924058/76‑1 (MQ=255) aaaaTTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAAc < 2:943004/76‑1 (MQ=255) aaTTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAg < 1:484994/76‑1 (MQ=255) tttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAggg > 1:1781129/1‑76 (MQ=255) tttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAggg < 2:1672758/76‑1 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa < 1:709738/76‑1 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa < 1:1265544/76‑1 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa < 1:1167420/76‑1 (MQ=255) tCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGat < 2:1726532/76‑1 (MQ=255) cccATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGata < 2:2222974/76‑1 (MQ=255) cccATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGata < 1:571693/76‑1 (MQ=255) ccATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGatat < 1:2080308/76‑1 (MQ=255) ttAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAg > 1:1976208/1‑76 (MQ=255) ttAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAg > 1:1723801/1‑76 (MQ=255) ttAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAg > 1:577373/1‑76 (MQ=255) aaTGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAgac > 1:1431538/1‑74 (MQ=255) aaTGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAAAAAATCTTTAACAGGGATATTAGcc > 1:943863/1‑76 (MQ=255) aTGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCt < 1:1987346/76‑1 (MQ=255) cTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTg > 1:2225186/1‑76 (MQ=255) | TTATGTTATAGTTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTG > REL606/2036673‑2036823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |