| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2791817 | 99 (1.410) | 7 (0.110) | 4/142 | 7.7 | 7.1% | coding (1422/1479 nt) | ygcE | predicted kinase |
| ? | REL606 | = 2792302 | 89 (1.340) | intergenic (+428/‑207) | ygcE/ECB_02621 | predicted kinase/conserved hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTACGACGCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCCGGGCGG > REL606/2791742‑2791892 | cTACGACGCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATGCTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGaa < 1:1448025/76‑1 (MQ=255) tACGACGCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAg < 1:1198708/76‑1 (MQ=255) acgacgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGt > 2:1013627/1‑76 (MQ=255) cgacgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAGGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTg > 2:802874/1‑76 (MQ=255) cgacgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGAGGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTg < 1:721252/76‑1 (MQ=255) gacgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGa < 2:157039/76‑1 (MQ=255) gacgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGa < 1:1728830/76‑1 (MQ=255) acgCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGAt > 1:1343472/1‑76 (MQ=255) cgcgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATg > 2:2062159/1‑76 (MQ=255) cgcgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATg > 2:1106103/1‑76 (MQ=255) cgcgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATg < 1:1482884/76‑1 (MQ=255) cgcgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATg > 1:125120/1‑76 (MQ=255) cgcgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATg < 2:527938/76‑1 (MQ=255) cgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCa > 2:1636571/1‑76 (MQ=255) cgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCa > 2:291532/1‑76 (MQ=255) cgATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCa > 1:269833/1‑76 (MQ=255) aTGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtg > 2:422227/1‑76 (MQ=255) aTGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtg > 1:2064049/1‑76 (MQ=255) tGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtgg > 1:1610292/1‑76 (MQ=255) aaTAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtgggg > 2:956896/1‑76 (MQ=255) aaTAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtgggg > 1:2029365/1‑76 (MQ=255) tAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaa > 2:1431835/1‑76 (MQ=255) tAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaa > 1:153348/1‑76 (MQ=255) tAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaa > 1:603463/1‑76 (MQ=255) aaaGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaat < 2:486443/76‑1 (MQ=255) aaaGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaat < 1:1860087/76‑1 (MQ=255) aaGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaatt < 2:54885/76‑1 (MQ=255) aaGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaatt > 1:956583/1‑76 (MQ=255) ggCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattgg < 1:247755/76‑1 (MQ=255) gCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattggg > 1:1736479/1‑76 (MQ=255) gCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattggg > 1:1736463/1‑76 (MQ=255) cATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattgggg > 1:1931073/1‑76 (MQ=255) tttCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattggggaat < 2:628458/76‑1 (MQ=255) tttCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCAtggggaattggggaat < 1:123602/76‑1 (MQ=255) tCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAAtgt > 1:2060629/1‑76 (MQ=255) cAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAAtgtg < 1:1283220/76‑1 (MQ=255) cAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAAtgtg > 1:766447/1‑76 (MQ=255) aaaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTgg > 1:98062/1‑76 (MQ=255) aaaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTgg > 1:1637938/1‑76 (MQ=255) aaaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTgg > 1:1424003/1‑76 (MQ=255) aaaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTgg > 2:128475/1‑76 (MQ=255) aaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGa < 1:829332/76‑1 (MQ=255) aaGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGa > 2:1493034/1‑76 (MQ=255) gACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGAtt > 2:1066171/1‑76 (MQ=255) gACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGAtt < 2:2092587/76‑1 (MQ=255) gACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGAtt < 2:1004328/76‑1 (MQ=255) cTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGa < 1:2014166/76‑1 (MQ=255) cTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGa > 1:12023/1‑76 (MQ=255) cTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGa < 1:2014148/76‑1 (MQ=255) tAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGAt > 2:1907389/1‑76 (MQ=255) tAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGAt > 1:84983/1‑76 (MQ=255) tAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGAt > 1:84973/1‑76 (MQ=255) aaCCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATc > 1:300797/1‑76 (MQ=255) cAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCag < 1:1064904/76‑1 (MQ=255) aaaCATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCaga < 2:52189/76‑1 (MQ=255) aTACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTg < 2:1894850/76‑1 (MQ=255) aCTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGt > 1:1771413/1‑76 (MQ=255) cTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGNTc < 2:1580508/76‑1 (MQ=255) cTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTc < 1:1626682/76‑1 (MQ=255) cTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTc < 1:1814706/76‑1 (MQ=255) gATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGa > 1:1459526/1‑76 (MQ=255) gATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGa < 2:1558389/76‑1 (MQ=255) gATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGa > 2:1386156/1‑76 (MQ=255) aTGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGaa < 2:613202/76‑1 (MQ=255) gtgATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATg > 1:267877/1‑76 (MQ=255) tgATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGc > 1:298497/1‑76 (MQ=255) gATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCg > 1:795155/1‑76 (MQ=255) aTCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGt > 1:776379/1‑76 (MQ=255) tCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTa < 2:1837368/76‑1 (MQ=255) ccTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTaa < 1:802289/76‑1 (MQ=255) cTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAg < 1:1331230/76‑1 (MQ=255) tGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGt > 2:1510857/1‑76 (MQ=255) tGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGt > 1:265895/1‑76 (MQ=255) gAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTg > 2:1904085/1‑76 (MQ=255) gAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTg > 1:1339217/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGa > 1:172972/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGa > 1:1667782/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGa > 1:788455/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGa > 1:788440/1‑76 (MQ=255) aaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAgg > 1:288417/1‑76 (MQ=255) aaaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAgg < 2:451273/76‑1 (MQ=255) atntCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGa > 2:1586867/4‑76 (MQ=255) aaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGGTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGa < 1:2206617/76‑1 (MQ=255) aaaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGa > 2:954375/1‑76 (MQ=255) aaTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGaa > 1:888080/1‑76 (MQ=255) aTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAg < 1:46478/76‑1 (MQ=255) aTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAg > 1:1430044/1‑76 (MQ=255) aTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAg > 1:713282/1‑76 (MQ=255) aTCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAg < 2:2129682/76‑1 (MQ=255) tCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAgg < 2:905352/76‑1 (MQ=255) cGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGc > 2:1292511/1‑76 (MQ=255) tATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcg > 2:1019072/1‑76 (MQ=255) tATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcg < 1:2062159/76‑1 (MQ=255) tATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcg > 2:934361/1‑76 (MQ=255) naTGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcg > 1:2238736/2‑76 (MQ=255) gAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcgggc < 2:417190/76‑1 (MQ=255) gAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcgggc < 2:1411739/76‑1 (MQ=255) gAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcgggc > 2:1721679/1‑76 (MQ=255) aaGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcggggg > 2:709373/1‑74 (MQ=255) aGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCcgggcgg > 1:2022360/1‑76 (MQ=255) | CTACGACGCGATGAATAAAGGCATTTTCAAAGACCTAACCAAACATACTGATGTGATCCTGAAAAAATCGTATGAAGTGATGCATGGGGAATTGGGGAATGTGGATTCGATCCAGAGCTGGTCGAATGCGTAAGTGAGGAAGGCCGGGCGG > REL606/2791742‑2791892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |