| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2791817 | 99 (1.410) | 7 (0.110) | 4/142 | 7.7 | 7.1% | coding (1422/1479 nt) | ygcE | predicted kinase |
| ? | REL606 | = 2792302 | 89 (1.340) | intergenic (+428/‑207) | ygcE/ECB_02621 | predicted kinase/conserved hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATT > REL606/2792228‑2792377 | aTTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAt < 2:1155577/76‑1 (MQ=255) tttATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAtt < 2:251202/76‑1 (MQ=255) ttattaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTc > 1:1099118/1‑76 (MQ=255) ttattaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTc < 2:2202020/76‑1 (MQ=255) attaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAttnta < 2:1589848/76‑4 (MQ=255) taCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAata < 2:4406/76‑1 (MQ=255) aCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat < 1:877174/76‑1 (MQ=255) aCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat < 1:671436/76‑1 (MQ=255) aCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat > 1:429609/1‑76 (MQ=255) cTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 2:1655924/76‑1 (MQ=255) cTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 2:1655949/76‑1 (MQ=255) cTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 1:1286476/76‑1 (MQ=255) ttAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTa < 2:776179/76‑1 (MQ=255) tAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaa > 2:915938/1‑76 (MQ=255) aCCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaa < 2:1190802/76‑1 (MQ=255) aCCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaa < 2:1190822/76‑1 (MQ=255) ccAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaa < 1:193343/76‑1 (MQ=255) cAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaaa < 2:1011118/76‑1 (MQ=255) cAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaaa < 1:705973/76‑1 (MQ=255) aaTGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaaaa > 1:194913/1‑76 (MQ=255) aTGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAACAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaat > 2:335543/1‑76 (MQ=255) tGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaata > 2:507641/1‑76 (MQ=255) aTAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAataata < 2:157809/76‑1 (MQ=255) tAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAg > 1:1059763/1‑76 (MQ=255) aaCAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGa < 1:446451/76‑1 (MQ=255) aaCAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGa < 1:2165795/76‑1 (MQ=255) cAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAtt < 1:1306177/76‑1 (MQ=255) aaGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTa > 2:1845148/1‑76 (MQ=255) aaGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTa < 2:1041915/76‑1 (MQ=255) aGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaa < 2:1151992/76‑1 (MQ=255) aGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaa < 2:1798877/76‑1 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaaaa > 1:20462/1‑76 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaaaa > 1:197598/1‑76 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaaaa > 1:1551537/1‑76 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAAtt > 1:710137/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAAttt < 2:653688/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTc > 1:1184245/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTc < 2:1253223/76‑1 (MQ=255) aaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCt < 2:1666525/76‑1 (MQ=255) aaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCt > 1:1145101/1‑76 (MQ=255) aaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt > 1:545647/1‑76 (MQ=255) aaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCAGTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt < 1:331485/76‑1 (MQ=255) aaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTa > 1:1586870/1‑76 (MQ=255) atatACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTaa < 2:1121364/76‑1 (MQ=255) atatACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTaa < 2:1121343/76‑1 (MQ=255) atatACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTaa < 1:851447/76‑1 (MQ=255) tGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGAttt < 1:37541/76‑1 (MQ=255) gTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTa < 2:464169/76‑1 (MQ=255) ttATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTaa > 1:385131/1‑76 (MQ=255) ttATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTaa < 1:110595/76‑1 (MQ=255) tATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAg > 1:739255/1‑76 (MQ=255) aTTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGa < 1:1574497/76‑1 (MQ=255) tCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAAt > 1:1004642/1‑76 (MQ=255) cTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATc > 1:1972966/1‑76 (MQ=255) tAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCa < 1:68378/76‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCAt > 2:1743135/1‑76 (MQ=255) aGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATAc > 2:716891/1‑76 (MQ=255) gAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACa > 1:1583014/1‑76 (MQ=255) aaaaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACaa > 1:424163/1‑76 (MQ=255) aaaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACaaa < 1:1468731/76‑1 (MQ=255) aaaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACaaa < 1:2144022/76‑1 (MQ=255) aaaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACaaa < 1:2165679/76‑1 (MQ=255) aaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAAt < 1:1517869/76‑1 (MQ=255) aaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATa < 2:415645/76‑1 (MQ=255) aaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATa < 2:123045/76‑1 (MQ=255) aaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATaa < 2:132493/76‑1 (MQ=255) aaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATaa < 1:1801860/76‑1 (MQ=255) aTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAac > 1:1042311/1‑76 (MQ=255) ttAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAaca < 2:1974014/76‑1 (MQ=255) tAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAacac > 1:1128062/1‑76 (MQ=255) tAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAacac < 1:885968/76‑1 (MQ=255) tAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAacac > 2:569703/1‑76 (MQ=255) aCAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt > 1:621894/1‑76 (MQ=255) aCAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt < 1:1985926/76‑1 (MQ=255) aCAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt < 2:2114261/76‑1 (MQ=255) cAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 2:391173/76‑1 (MQ=255) cAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 2:391140/76‑1 (MQ=255) cAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 2:1749646/76‑1 (MQ=255) cAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 1:765246/76‑1 (MQ=255) aGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTg < 2:213818/76‑1 (MQ=255) aGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTg < 1:776237/76‑1 (MQ=255) ggCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGa < 2:1287692/76‑1 (MQ=255) gCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGAt < 2:2143521/76‑1 (MQ=255) gCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGAt < 2:1210083/76‑1 (MQ=255) cATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGAtt > 2:1816321/1‑76 (MQ=255) ttAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaa > 2:2196640/1‑76 (MQ=255) ttAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaa < 1:1162227/76‑1 (MQ=255) ttAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaa > 2:592193/1‑76 (MQ=255) ttAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaa > 2:1091473/1‑76 (MQ=255) tAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaaa < 1:1458183/76‑1 (MQ=255) tAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTaaa > 1:214458/1‑76 (MQ=255) aaTTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaat < 2:939190/76‑1 (MQ=255) aaTTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaat > 1:1027346/1‑76 (MQ=255) aTTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaatt < 1:1121175/76‑1 (MQ=255) | ATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATT > REL606/2792228‑2792377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |