| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2039188 = | 95 (1.360) | 9 (0.140) | 4/140 | 7.7 | 8.0% | coding (507/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA |
| ? | REL606 | 2039561 = | 119 (1.820) | coding (134/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGC > REL606/2039486‑2039635 | ttttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAttt < 2:1565641/76‑1 (MQ=255)ttttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAttt < 2:373585/76‑1 (MQ=255)gtttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAttt < 1:685275/75‑1 (MQ=255) tttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTg < 2:833171/76‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTgg < 2:381085/76‑1 (MQ=255) taaaaGTGTTGATAAAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGt < 1:1342666/74‑1 (MQ=255) tCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGt < 1:791312/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc > 2:117197/1‑76 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc < 1:919172/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc < 1:764485/76‑1 (MQ=255) aaaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCt > 2:2095828/1‑76 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt < 1:1295035/76‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt > 2:1953177/1‑76 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt < 2:1090773/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCttt > 1:1503586/1‑76 (MQ=255) aGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCttt < 1:420623/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCttc < 1:844350/76‑2 (MQ=255) tgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtat > 1:2209965/1‑76 (MQ=255) tgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTcat > 1:2209950/1‑76 (MQ=255) gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata > 1:605690/1‑76 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat > 1:1696147/1‑76 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 2:1994265/76‑1 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTa < 1:795387/76‑1 (MQ=255) tataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAg > 1:997834/1‑76 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa > 1:743555/1‑76 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa > 1:740199/1‑76 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:548479/76‑1 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:548450/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt > 2:1214085/1‑76 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 2:1224766/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 2:1527747/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt > 2:1575359/1‑76 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt > 2:336928/1‑76 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt < 1:223867/76‑1 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt < 1:1372927/76‑1 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt > 2:336911/1‑76 (MQ=255) ggATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtt > 1:2039457/1‑76 (MQ=255) ggATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtt < 2:1670627/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 2:597725/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt > 1:181115/1‑76 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 1:2131090/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt < 1:339243/76‑1 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt < 1:638019/76‑1 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt < 1:638046/76‑1 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt > 2:33543/1‑76 (MQ=255) tAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAtt < 1:791297/76‑1 (MQ=255) tAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAtt > 1:1932561/1‑76 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTg > 2:1057158/1‑76 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTCATTg > 2:1689879/1‑76 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt > 2:2048528/1‑76 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt < 1:1931584/76‑1 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt < 1:1931608/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 1:971820/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 1:991153/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 2:1945588/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 2:1765115/76‑1 (MQ=255) gCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTta < 2:1290757/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:1581715/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:1627869/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:345002/76‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtata < 1:130416/76‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtata < 1:62944/76‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtata < 1:62941/76‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtata < 1:62927/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 1:715746/76‑1 (MQ=255) cGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGCTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAg < 2:607586/76‑1 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt > 1:1403355/1‑76 (MQ=255) tAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAttt < 1:2150534/76‑1 (MQ=255) tGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTtata > 2:910771/1‑76 (MQ=255) tCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaaa > 2:1961237/1‑76 (MQ=255) ccATCAAAACTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAAc > 2:1147011/1‑76 (MQ=255) ccATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAAc > 2:220668/1‑76 (MQ=255) ccATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAAc > 2:1411385/1‑76 (MQ=255) ccATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAAc > 2:1147038/1‑76 (MQ=255) cATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACa < 2:1835694/76‑1 (MQ=255) cATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACa < 1:1404833/76‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAtttt > 2:1138504/1‑76 (MQ=255) taaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTc > 2:1955010/2‑76 (MQ=255) aaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTc > 2:413257/1‑76 (MQ=255) aaaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGa > 1:1579324/1‑76 (MQ=255) aaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGAc > 1:852090/1‑76 (MQ=255) aaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACt < 1:1916909/76‑1 (MQ=255) aGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTa < 1:1081212/76‑1 (MQ=255) aGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTa > 2:2249225/1‑76 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaaa > 1:1354040/1‑76 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaaa > 1:1537554/1‑76 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaaa > 2:706037/1‑76 (MQ=255) aaaTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAAc > 1:1705873/1‑76 (MQ=255) aTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCa < 2:1932090/76‑1 (MQ=255) tGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCAc < 2:1757628/76‑1 (MQ=255) tGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCAc < 1:1305812/76‑1 (MQ=255) cTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTc > 2:1594926/1‑76 (MQ=255) cTATTTGGTCTTTATATTTACATTCTTTTATTGTATTTATAGGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTc > 2:1594936/1‑76 (MQ=255) tATTTGGTCTTTATA‑TTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg < 2:1267910/76‑1 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg > 1:41764/1‑76 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg > 1:1127715/1‑76 (MQ=255) tttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAgg > 2:540681/1‑76 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc > 2:56000/1‑76 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc < 1:1122075/76‑1 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc < 1:1122066/76‑1 (MQ=255) | TTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGC > REL606/2039486‑2039635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |