| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2039076 = | 44 (0.750) | 11 (0.210) | 7/136 | 4.5 | 16.9% | coding (619/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA |
| ? | REL606 | 2039562 = | 68 (1.280) | coding (133/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGAAAGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAATATATGTTGCACATGTACTTG > REL606/2039002‑2039150 | tGAAAGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTaa < 2:1400548/76‑1 (MQ=255)tGAAAGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTaa > 1:380636/1‑76 (MQ=255) aaaGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAAt < 1:133935/76‑1 (MQ=255) aaaGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAAt > 2:1438452/1‑76 (MQ=255) agagCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAg > 2:848638/1‑76 (MQ=255) aGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGa > 2:1082075/1‑76 (MQ=255) ggTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGaa < 2:995487/76‑1 (MQ=255) tGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAatt > 1:205659/1‑76 (MQ=255) gAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAatta > 2:367025/1‑76 (MQ=255) gAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAatta > 1:327444/1‑76 (MQ=255) gAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAatta > 2:367027/1‑76 (MQ=255) aagaagTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAattatt < 2:325546/76‑1 (MQ=255) aagaagTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAattatt > 2:133694/1‑76 (MQ=255) aagaagTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAattatt > 2:635386/1‑76 (MQ=255) aagaagTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAattatt > 2:1049337/1‑76 (MQ=255) gaagTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTAtttt > 1:684629/1‑76 (MQ=255) tCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTc > 1:1461808/1‑76 (MQ=255) cTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTcc > 2:1057071/1‑76 (MQ=255) cTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTcc > 2:1057091/1‑76 (MQ=255) aTTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTAt > 1:1844077/1‑76 (MQ=255) aTTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTAt < 1:693094/76‑1 (MQ=255) ttCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATc > 1:890199/1‑76 (MQ=255) ttCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATc < 1:402196/76‑1 (MQ=255) tAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCaaa > 1:801361/1‑76 (MQ=255) tAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCaaa > 1:1248439/1‑76 (MQ=255) tAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCaaa > 1:124413/1‑76 (MQ=255) aaaTATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCaaaa > 2:1566983/1‑76 (MQ=255) aaTATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCaaaaa < 1:1380706/76‑1 (MQ=255) agtaagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCt > 2:1052261/1‑76 (MQ=255) agtaagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCt > 1:264530/1‑76 (MQ=255) gtaagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCtt < 2:1262143/76‑1 (MQ=255) taagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCttt < 2:11080/76‑1 (MQ=255) taagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCttt > 1:54671/1‑76 (MQ=255) aagtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTc < 2:765248/76‑1 (MQ=255) agtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCa < 1:1366068/76‑1 (MQ=255) agtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCa < 2:762358/76‑1 (MQ=255) agtaTCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCa < 2:762359/76‑1 (MQ=255) cAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCataata < 1:1540943/76‑1 (MQ=255) cAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCataata > 2:1084231/1‑76 (MQ=255) aaaaTAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAatata < 2:1819415/76‑1 (MQ=255) aaaTAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAatatat > 2:1831314/1‑76 (MQ=255) ttGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAATATATGTTGcac > 1:1321893/1‑76 (MQ=255) aaTCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAATATATGTTGCACATGt < 2:202374/76‑1 (MQ=255) tAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAATATATGTTGCACATGTACTTg > 1:632529/1‑76 (MQ=255) | TGAAAGAGCGGGGATAGGTGAAAGAAGTCTAATTCTAAATATTTTAGTAAGTATCAAAAATAATTTGTAATCGTAAATAGCTAATTTTAGAATTATTTTTGTCCTATCAAAAACCCTGGCTTTCATAATATATGTTGCACATGTACTTG > REL606/2039002‑2039150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |