| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2039076 = | 44 (0.750) | 11 (0.210) | 7/136 | 4.5 | 16.9% | coding (619/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA |
| ? | REL606 | 2039562 = | 68 (1.280) | coding (133/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGC > REL606/2039487‑2039635 | tttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTg > 1:633970/1‑76 (MQ=255)tttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTg < 2:1272035/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc > 1:908972/1‑76 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc > 1:1304743/1‑76 (MQ=255) aaaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCt < 1:314478/76‑1 (MQ=255) aaaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCt < 1:84264/76‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt < 1:367722/76‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt < 1:266984/76‑1 (MQ=255) gtgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTta < 1:1680723/76‑1 (MQ=255) tgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtan < 1:380862/76‑2 (MQ=255) gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 1:1402546/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat > 2:1072984/1‑76 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt < 1:1667510/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:1526138/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:1526152/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:511479/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:216337/76‑1 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTa < 2:53642/76‑1 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTa > 2:468324/1‑76 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAAT‑AAAGGAAATGCTATTTGGGCTtttttttttg > 2:1033780/1‑74 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:640612/76‑1 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:1489722/76‑1 (MQ=255) taACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAt < 1:208381/76‑1 (MQ=255) taACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAt < 1:1228295/76‑1 (MQ=255) taACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAt < 1:706659/76‑1 (MQ=255) taACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAt < 1:1228293/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 1:1675853/76‑1 (MQ=255) aCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTc < 1:153439/76‑1 (MQ=255) aCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTc < 2:862377/76‑1 (MQ=255) aCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTAAATTTAGATTc < 2:862348/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 2:1199020/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 1:936441/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 1:936439/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt < 2:1628141/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt < 2:1757706/76‑1 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTg > 2:1074615/1‑76 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt < 1:1223113/76‑1 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt < 1:1366301/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 2:553999/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:906636/76‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtata < 2:926795/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 1:1311757/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 1:1771335/76‑1 (MQ=255) cGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAg > 1:27306/1‑76 (MQ=255) aaTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTta < 1:747260/76‑1 (MQ=255) aaTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTta > 2:1671545/1‑76 (MQ=255) tGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTtata > 1:1610238/1‑76 (MQ=255) gATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaa < 1:227145/76‑1 (MQ=255) gATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaa > 2:1790219/1‑76 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa < 2:158824/76‑1 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa < 1:916983/76‑1 (MQ=255) ttcATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa‑a < 2:906405/74‑1 (MQ=255) tacATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa‑a > 2:530483/3‑76 (MQ=255) tCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa‑a < 1:1643033/76‑1 (MQ=255) tCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa‑a < 2:117466/76‑1 (MQ=255) cATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACa < 1:1238323/76‑1 (MQ=255) cATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACa < 1:350007/76‑1 (MQ=255) tCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAAt < 1:1297317/76‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAAtttt > 1:1545768/1‑76 (MQ=255) aaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAAtaaa > 1:935971/1‑73 (MQ=255) aaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGT‑TTTATAAATCTTATAAATACAAtaaa > 2:935971/1‑73 (MQ=18) aaaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGa < 2:1858961/76‑1 (MQ=255) agcaaaTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTa > 1:1118003/4‑76 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTaa > 1:1598007/1‑76 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTaa > 1:194437/1‑76 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTaa > 1:261618/1‑76 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTaa > 1:477057/1‑76 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTaaa > 2:1150975/1‑76 (MQ=255) gCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACt < 2:1225215/76‑1 (MQ=255) cTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACTc > 2:1886481/1‑76 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg < 2:661529/76‑1 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc > 2:1026746/1‑76 (MQ=255) | TTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAA‑ACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGC > REL606/2039487‑2039635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |