| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 4,108,659 | (TATTT)1→2 | intergenic (‑157/‑120) | metJ ← / → metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4108654 | 0 (0.000) | 81 (1.360) +TATTT |
58/130 | 0.0 | 100% | intergenic (‑152/‑125) | metJ/metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase |
| ? | REL606 | 4108655 = | 0 (0.000) | intergenic (‑153/‑124) | metJ/metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase | |||||
AGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4108580‑4108654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTT > REL606/4108655‑4108729 ||||| AGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCT < 2:1471531/76‑1 TTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATT > 2:1782264/1‑76 TTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATT < 1:1136492/76‑1 TTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATT > 2:1176921/1‑76 TTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATT < 1:133928/76‑1 TACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTT < 1:303183/76‑1 ACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTT < 1:47944/76‑1 ACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTT > 2:1259683/1‑76 ACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTT < 2:1497010/76‑1 ACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTT < 2:1898029/76‑1 GTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATTTAATTTTAACGGCTATTTTATT > 1:1061154/1‑76 TACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTT < 1:216905/76‑1 ACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTG > 2:33864/1‑76 CAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGG > 1:525495/1‑76 CAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGG < 1:140879/76‑1 AGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGG < 2:1386013/76‑1 GCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGAT > 2:1708736/1‑76 TTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTG > 1:717867/1‑76 TACAGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGC > 2:319502/1‑76 CGTGACATCGTGTAATGCTCCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCA < 2:1069643/76‑1 CGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCA < 2:1069641/76‑1 GTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGGTTTGGTCAA > 1:1290995/1‑76 GACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATC > 2:690016/1‑76 ACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCT < 2:1967017/76‑1 CATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTA < 2:201232/76‑1 ATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTAT > 2:1743700/1‑76 CGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATAC < 1:937572/76‑1 GTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACG > 1:1492556/1‑76 GTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACG < 2:729089/76‑1 tgcAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGC > 1:1629219/4‑76 GTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGGTTTGCTCAATCTATACGCA > 1:1696332/1‑76 GTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCA > 2:1361107/1‑76 GTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCA > 2:1108210/1‑76 GTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCA > 1:370662/1‑76 TAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAA > 1:1808286/1‑76 ATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAG < 1:963904/76‑1 TGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGA < 2:1240966/76‑1 TGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGA < 1:1524374/76‑1 TGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGA < 1:817438/76‑1 GCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAA < 2:401349/76‑1 CACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAG < 1:2397/76‑1 ACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGT < 2:966030/76‑1 ACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGT > 2:125637/1‑76 CTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTT < 1:297129/76‑1 TGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTA < 2:1203114/76‑1 TGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTA > 1:215980/1‑76 TGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTA < 1:1036713/76‑1 GTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAG > 2:1533439/1‑76 GGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATG < 1:472398/76‑1 GCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGT > 2:156474/1‑76 GCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGT < 2:1144145/76‑1 GCGTGAGAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGT < 2:223204/76‑1 CGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTC > 2:24382/1‑76 GTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCC < 1:523646/76‑1 GTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCC > 1:1731334/1‑76 TGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCA > 1:1856468/1‑76 TGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCA < 1:1436880/76‑1 GATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAG > 1:95062/1‑76 GATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAG > 1:1365202/1‑76 ATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGA > 1:1823055/1‑76 ATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGA > 2:1397240/1‑76 TAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGAT > 1:259044/1‑76 TAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGAT < 2:171743/76‑1 TAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGAT > 1:804413/1‑76 TAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGAT < 1:604556/76‑1 AATGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATG < 2:1432886/76‑1 TGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTA > 2:655644/1‑76 TGCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTA > 1:1762847/1‑76 GCATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTAT > 1:1010408/1‑76 ATATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTG < 2:1517303/76‑1 TATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTaa < 2:409975/76‑3 ATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGAC > 1:1128003/1‑76 ATAATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGAC > 1:1127991/1‑76 ATTTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTC > 1:1733300/1‑76 TTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCA < 2:880316/76‑1 TTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCA > 1:239310/1‑76 TTTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCA > 1:1112748/1‑76 TTAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCAT < 2:215295/76‑1 TAACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATT < 2:1443238/76‑1 AACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTA < 1:1536768/76‑1 AACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTA < 1:1924128/76‑1 ACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAA < 2:1516308/76‑1 ACGGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAA < 2:11653/76‑1 GGCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACA < 1:887483/76‑1 GCTATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACAC < 1:1935143/76‑1 TATTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAA < 1:1176921/76‑1 TTTTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATG < 1:1493242/76‑1 TTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTT > 1:1524980/1‑76 TTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTT > 1:1690648/1‑76 ||||| AGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4108580‑4108654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTT > REL606/4108655‑4108729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |