| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 4,108,659 | (TATTT)1→2 | intergenic (‑157/‑120) | metJ ← / → metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4108654 | 0 (0.000) | 81 (1.360) +TATTT |
58/130 | 0.0 | 100% | intergenic (‑152/‑125) | metJ/metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase |
| ? | REL606 | 4108655 = | 0 (0.000) | intergenic (‑153/‑124) | metJ/metB | transcriptional repressor protein MetJ/cystathionine gamma‑synthase | |||||
TAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGT > REL606/4108579‑4108728 | tAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGc > 2:78101/1‑76 (MQ=255) aGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCt < 2:1471531‑M1/76‑2 (MQ=255) ttACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatt > 2:1176921‑M1/1‑72 (MQ=255) ttACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatt > 2:1782264‑M1/1‑72 (MQ=255) ttACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatt < 1:133928‑M1/76‑5 (MQ=255) ttACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatt < 1:1136492‑M1/76‑5 (MQ=255) tACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattt < 1:303183‑M1/76‑6 (MQ=255) aCCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatttt < 1:47944‑M1/76‑7 (MQ=255) aCCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatttt > 2:1259683‑M1/1‑70 (MQ=255) aCCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatttt < 2:1497010‑M1/76‑7 (MQ=255) aCCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtatttt < 2:1898029‑M1/76‑7 (MQ=255) gTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATTTAATTTTAACGGCtattttatt > 1:1061154‑M1/1‑67 (MQ=255) tACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttattt < 1:216905‑M1/76‑11 (MQ=255) aCAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttg > 2:33864‑M1/1‑65 (MQ=255) cAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgg > 1:525495‑M1/1‑64 (MQ=255) cAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgg < 1:140879‑M1/76‑13 (MQ=255) aGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttggg < 2:1386013‑M1/76‑14 (MQ=255) gCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggat > 2:1708736‑M1/1‑61 (MQ=255) ttACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttg > 1:717867‑M1/1‑58 (MQ=255) tACAGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgc > 2:319502‑M1/1‑57 (MQ=255) cGTGACATCGTGTAATGCTCCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctca < 2:1069643‑M1/76‑23 (MQ=255) cGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctca < 2:1069641‑M1/76‑23 (MQ=255) gTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttggggtttggtcaa > 1:1290995‑M1/1‑53 (MQ=255) gACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatc > 2:690016‑M1/1‑51 (MQ=255) aCATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatct < 2:1967017‑M1/76‑27 (MQ=255) cATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatcta < 2:201232‑M1/76‑28 (MQ=255) 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tAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaa > 1:1808286‑M1/1‑42 (MQ=255) aTGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaag < 1:963904‑M1/76‑37 (MQ=255) tGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaaga < 1:1524374‑M1/76‑38 (MQ=255) tGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaaga < 2:1240966‑M1/76‑38 (MQ=255) tGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaaga < 1:817438‑M1/76‑38 (MQ=255) gCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaa < 2:401349‑M1/76‑39 (MQ=255) cACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaag < 1:2397‑M1/76‑40 (MQ=255) aCCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagt < 2:966030‑M1/76‑41 (MQ=255) aCCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagt > 2:125637‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagttt < 1:297129‑M1/76‑43 (MQ=255) tGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagttta < 2:1203114‑M1/76‑44 (MQ=255) tGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagttta < 1:1036713‑M1/76‑44 (MQ=255) tGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagttta > 1:215980‑M1/1‑33 (MQ=255) gTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttag > 2:1533439‑M1/1‑32 (MQ=255) ggCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatg < 1:472398‑M1/76‑48 (MQ=255) gCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgt < 2:1144145‑M1/76‑49 (MQ=255) gCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgt > 2:156474‑M1/1‑28 (MQ=255) gCGTGAGAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgt < 2:223204‑M1/76‑49 (MQ=255) 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tAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagat > 1:259044‑M1/1‑22 (MQ=255) tAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagat < 1:604556‑M1/76‑55 (MQ=255) tAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagat > 1:804413‑M1/1‑22 (MQ=255) tAATGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagat < 2:171743‑M1/76‑55 (MQ=255) aaTGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatg < 2:1432886‑M1/76‑56 (MQ=255) tGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgta > 1:1762847‑M1/1‑19 (MQ=255) tGCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgta > 2:655644‑M1/1‑19 (MQ=255) gCATATAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtat > 1:1010408‑M1/1‑18 (MQ=255) atatAATTTTAACGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattg < 2:1517303‑M1/76‑61 (MQ=255) 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aaCGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccatta < 1:1924128‑M1/76‑71 (MQ=255) aaCGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccatta < 1:1536768‑M1/76‑71 (MQ=255) aCGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccattaa < 2:1516308‑M1/76‑72 (MQ=255) aCGGCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccattaa < 2:11653‑M1/76‑72 (MQ=255) ggCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccattaaca < 1:887483‑M1/76‑74 (MQ=255) gCtattttatttgggatttgctcaatctatacgcaaagaagtttagatgtccagatgtattgacgtccattaacac < 1:1935143‑M1/76‑75 (MQ=255) | TAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGT > REL606/4108579‑4108728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |