| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2038724 = | 74 (1.190) | 7 (0.130) | 4/134 | 6.6 | 9.9% | coding (225/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB |
| ? | REL606 | 2039214 = | 62 (1.120) | coding (481/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCT > REL606/2038649‑2038797 | tGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTAtcttct > 2:481884/1‑76 (MQ=255) gCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTa > 1:1589851/1‑76 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa > 1:730229/1‑76 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa < 2:1359186/76‑1 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa < 2:1359204/76‑1 (MQ=255) aTTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaa < 1:337519/76‑1 (MQ=255) tATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaaa < 1:741650/76‑1 (MQ=255) tATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaaa > 1:1636537/1‑76 (MQ=255) aTGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaaaa > 1:1083110/1‑76 (MQ=255) tGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTATTAATGAGCTATCTTCTAAAAAAt > 2:693449/1‑76 (MQ=255) gTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATc > 2:615125/1‑76 (MQ=255) ttCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTa > 1:231533/1‑76 (MQ=255) ttCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTa > 2:446125/1‑76 (MQ=255) ttCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTa > 2:57579/1‑76 (MQ=255) ttCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCCTCTAAAAAATCTa > 1:1196401/1‑76 (MQ=255) tCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAt > 2:378728/1‑76 (MQ=255) tCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAt > 2:795343/1‑76 (MQ=255) cAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGTATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAtt > 1:1890299/1‑76 (MQ=255) cAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAtt > 1:1381471/1‑76 (MQ=255) cAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAtt < 1:1871247/76‑1 (MQ=255) cAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAtt > 1:413709/1‑76 (MQ=255) aaGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttc > 1:1507837/1‑76 (MQ=255) aGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttcc < 2:457901/76‑1 (MQ=255) aaCAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttcctt < 1:1301726/76‑1 (MQ=255) aaCAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttcctt > 2:1139765/1‑76 (MQ=255) aCAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttccttc < 1:1893017/76‑1 (MQ=255) aCAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttccttc > 2:432198/1‑76 (MQ=255) aTGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTccttcctt < 2:1802983/76‑1 (MQ=255) tGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTta < 1:871603/76‑1 (MQ=255) tGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTta < 1:871628/76‑1 (MQ=255) gTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtat < 2:1311699/76‑1 (MQ=255) gTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtat < 2:520522/76‑1 (MQ=255) tATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAACAATCTATTCCTTCCTtata > 1:687275/1‑76 (MQ=255) tATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtata < 2:445558/76‑1 (MQ=255) aTCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAACACTATTCCTTCCTTATAg > 1:29820/1‑76 (MQ=255) aTCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAg > 1:564061/1‑76 (MQ=255) aTCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAg > 1:564070/1‑76 (MQ=255) aTCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAg > 1:29839/1‑76 (MQ=255) ttCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAg < 2:1948619/76‑1 (MQ=255) aaaaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaaa > 1:1212647/1‑76 (MQ=255) aaaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaaaa > 2:1219317/1‑76 (MQ=255) tGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTc > 2:1841154/1‑76 (MQ=255) tgaATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaa > 2:222821/2‑76 (MQ=255) agaATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaa < 2:1438620/76‑1 (MQ=255) agaATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaa < 2:659548/76‑1 (MQ=255) agaATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaa > 2:1915215/1‑76 (MQ=255) agaATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaa < 2:1753284/76‑1 (MQ=255) ttGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTAACTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAag > 1:332453/1‑76 (MQ=255) tACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGaa > 2:539347/1‑76 (MQ=255) aCTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAt > 2:365173/1‑76 (MQ=255) cTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAtt > 2:1380056/1‑76 (MQ=255) tCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAttt < 2:1091977/76‑1 (MQ=255) cTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGt > 2:1209940/1‑76 (MQ=255) cTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGt > 2:1537344/1‑76 (MQ=255) gATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTcc > 1:1770019/1‑76 (MQ=255) aTGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTccc > 1:1673569/1‑76 (MQ=255) aTGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTccc > 2:417777/1‑76 (MQ=255) tGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCg > 2:1592868/1‑76 (MQ=255) aataatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGtttt > 1:1470511/1‑76 (MQ=255) aataatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGtttt < 2:1915388/76‑1 (MQ=255) ataatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTc > 1:453181/1‑76 (MQ=255) ataatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTc < 1:1005372/76‑1 (MQ=255) taatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCg > 2:439985/1‑76 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGata < 1:176218/76‑1 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa < 1:1892239/76‑1 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATTaa > 1:1127085/1‑76 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaa < 1:198633/76‑1 (MQ=255) tATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaaa < 2:267195/76‑1 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCTGTTTTCGATATGAAAt < 2:1514106/76‑1 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAAt > 1:1287339/1‑76 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAAt > 2:795263/1‑76 (MQ=255) cttctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATcc > 2:17038/1‑76 (MQ=255) tctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCt > 2:351829/1‑76 (MQ=255) tctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCt > 2:1710235/1‑76 (MQ=255) | TGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCT > REL606/2038649‑2038797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |