| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022554 = | 41 (0.820) | 3 (0.070) | 3/136 | 5.8 | 7.4% | coding (131/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022717 = | 37 (0.810) | intergenic (‑33/+541) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTTTTTTAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATA > REL606/3022482‑3022619 | ttttttttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTataa > 1:699427/1‑75 (MQ=255)ttttttttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTataa > 1:699422/1‑75 (MQ=255)ttttttttAATAAACTTAAACGTGATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTataa > 1:699406/1‑75 (MQ=255) tttttttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTataat < 1:414523/75‑1 (MQ=255) ttttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATAtt > 2:198661/1‑75 (MQ=255) tttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATAttt < 1:1251011/75‑1 (MQ=255) ttAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTa < 2:1602905/75‑1 (MQ=255) taataaACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTAc < 1:583718/75‑1 (MQ=255) aaCTTCAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACaaaaa > 2:1172632/1‑75 (MQ=255) cTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAac < 1:1521968/75‑1 (MQ=255) tAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAacac > 1:317172/1‑75 (MQ=255) aaaCGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACt > 1:757648/1‑75 (MQ=255) aaCGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTa < 2:202104/75‑1 (MQ=255) cGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAAt < 1:338068/75‑1 (MQ=255) ttATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATAc > 2:232750/1‑75 (MQ=255) tataTTGTGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACa < 1:190757/75‑1 (MQ=255) tataTTGTGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACa < 1:190745/75‑1 (MQ=255) atatTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACaa > 1:1132186/1‑75 (MQ=255) ttatGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATcc < 1:852466/75‑1 (MQ=255) tatGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCt < 2:1529692/75‑1 (MQ=255) ttattaAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGtta > 1:395082/1‑75 (MQ=255) tattaAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGttat < 1:345355/75‑1 (MQ=255) tattaAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGttat > 2:1547333/1‑75 (MQ=255) attaAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGttatt > 1:737748/1‑75 (MQ=255) ttaAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGttatta > 2:722764/1‑75 (MQ=255) aaaTACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTaaa > 1:92129/1‑75 (MQ=255) tACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATAc > 2:1282788/1‑75 (MQ=255) aCCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACt > 2:1590120/1‑75 (MQ=255) tctaCAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTtgt < 2:1101671/72‑1 (MQ=255) gACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGa < 1:52551/75‑1 (MQ=255) cAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGAtt > 2:353100/1‑75 (MQ=255) tAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGaaa > 2:632687/1‑75 (MQ=255) aaTGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGt > 2:1135371/1‑75 (MQ=255) aaTGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGt < 1:1337692/75‑1 (MQ=255) tGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTaa < 2:1588101/75‑1 (MQ=255) gTTCTATTTCCTTATAATATTTGAAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAAc < 1:433887/75‑1 (MQ=255) ttCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACg > 1:744365/1‑75 (MQ=255) ttCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACg > 1:1476212/1‑75 (MQ=255) ttCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACg > 1:744367/1‑75 (MQ=255) tATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAAt > 1:282077/1‑75 (MQ=255) aTTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATa > 1:1562955/1‑75 (MQ=255) | TTTTTTTTAATAAACTTAAACGTTATATTATGTTTATTAAATACCTCGACAGCTAAATGTTCTATTTCCTTATAATATTTACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATA > REL606/3022482‑3022619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |