| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2038943 = | 57 (0.970) | 30 (0.540) | 12/142 | 4.0 | 30.3% | coding (6/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB |
| ? | REL606 | 2039511 = | 84 (1.520) | coding (184/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GCTGATCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAT > REL606/2039436‑2039586 | gcTGATCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATc > 1:732142/1‑76 (MQ=255) cTGATCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCt < 1:276155/76‑1 (MQ=255) aTCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAg > 2:1466965/1‑76 (MQ=255) aTCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAg > 1:1798173/1‑76 (MQ=255) aTCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAg < 2:759608/76‑1 (MQ=255) tctcCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAgg < 1:540882/76‑1 (MQ=255) tctcCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAgg < 1:1138716/76‑1 (MQ=255) ctcctcCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGa < 1:1679149/76‑1 (MQ=255) ctcctcCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGa < 1:449313/76‑1 (MQ=255) ctcctcCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGa < 1:1320840/76‑1 (MQ=255) ctcctcCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGa < 1:1361080/76‑1 (MQ=255) ctcctcCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGa < 1:1361082/76‑1 (MQ=255) tcctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGaa < 1:441332/76‑1 (MQ=255) tcctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGaa < 1:22180/76‑1 (MQ=255) tcctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGaa < 1:1097814/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:1423842/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:239767/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:239787/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:1238342/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:332276/76‑1 (MQ=255) cctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAg < 1:16144/76‑1 (MQ=255) ctccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGc > 1:287794/1‑76 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCa < 1:570268/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCa < 1:570251/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCa < 1:1257737/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCa < 1:1257747/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCa < 1:1466965/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATA‑TTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCaa < 1:283430/76‑1 (MQ=255) tccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATA‑TTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCaa < 1:283408/76‑1 (MQ=255) ccATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCaa < 1:1388169/76‑1 (MQ=255) cATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAAc < 1:583604/76‑1 (MQ=255) cATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGACCTAAGGAAGCAAc < 1:657051/76‑1 (MQ=255) ttGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGt < 1:1694363/76‑1 (MQ=255) ttGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGt < 1:1694395/76‑1 (MQ=255) ttGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGt < 1:1694398/76‑1 (MQ=255) ttGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGt > 1:826844/1‑76 (MQ=255) gATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGttt < 1:370456/76‑1 (MQ=255) aTTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTa < 1:754700/76‑1 (MQ=255) ttATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTaa < 1:1792665/76‑1 (MQ=255) ttATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTaa < 1:1727575/76‑1 (MQ=255) ttATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTaa < 1:6906/76‑1 (MQ=255) ttATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTaa < 1:1727558/76‑1 (MQ=255) tGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGa < 1:650715/76‑1 (MQ=255) tGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGa > 1:1593283/1‑76 (MQ=255) tGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGa < 1:650739/76‑1 (MQ=255) gAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGAt < 2:1752809/76‑1 (MQ=255) ctatatCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGAt > 2:87271/3‑76 (MQ=255) atatCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATcc < 2:1739751/76‑1 (MQ=255) tatCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCa > 2:1178178/1‑76 (MQ=255) tCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATc > 1:345303/1‑76 (MQ=255) tCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATc > 1:345274/1‑76 (MQ=255) tCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATc > 1:345269/1‑76 (MQ=255) cTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCa > 1:731711/1‑76 (MQ=255) cTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCa < 1:1668453/76‑1 (MQ=255) ttttATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCaaa > 1:1301812/1‑76 (MQ=255) attattCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATa < 1:1084688/76‑1 (MQ=255) tattCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATaaa < 1:439014/76‑1 (MQ=255) tattCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATaaa > 1:1111257/1‑76 (MQ=255) tattCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATaaa > 1:1111236/1‑76 (MQ=255) attCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATaaaa > 1:1088067/1‑76 (MQ=255) attCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATaaaa < 1:478788/76‑1 (MQ=255) cATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTa > 2:145037/1‑76 (MQ=255) atatCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTaa < 2:754188/76‑1 (MQ=255) tatCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTaaa > 1:599997/1‑76 (MQ=255) tatCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTaaa > 1:600015/1‑76 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt > 1:613538/1‑76 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt < 1:1512852/76‑1 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt > 1:54537/1‑76 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt > 1:1476057/1‑76 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt > 1:1854640/1‑76 (MQ=255) tCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGt < 1:1494615/76‑1 (MQ=255) aaaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCt < 1:247366/76‑1 (MQ=255) gtgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTta < 1:261207/76‑1 (MQ=255) gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 1:80582/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat < 2:1284952/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat < 1:54489/76‑1 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAGTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt > 1:241850/1‑76 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 2:822669/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:295298/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 1:570365/76‑1 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:1499170/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt > 2:9358/1‑76 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 2:832998/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt > 2:75191/1‑76 (MQ=255) ggATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtt > 2:1170351/1‑76 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 1:646103/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt < 1:1430/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt < 1:558139/76‑1 (MQ=255) tCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTa < 1:1752640/76‑1 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt > 1:807830/1‑76 (MQ=255) | GCTGATCTCCTCCATTGATTATGAATATCTTTTTATTATTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAT > REL606/2039436‑2039586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |