| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 281778 = | 71 (1.090) | 5 (0.090) | 4/134 | 7.5 | 6.9% | intergenic (‑261/‑514) | ykgK/ykgL | predicted regulator/hypothetical protein |
| ? | REL606 | 281954 = | 72 (1.240) | intergenic (‑437/‑338) | ykgK/ykgL | predicted regulator/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAA > REL606/281880‑282026 | aaaaaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCa > 2:382831/1‑76 (MQ=255) aaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTa > 1:532589/1‑76 (MQ=255) aaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTa < 1:1779899/76‑1 (MQ=255) aaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTa < 1:1566976/76‑1 (MQ=255) aaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTa < 1:653813/76‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTaa < 2:1171120/76‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTaa > 2:1631944/1‑76 (MQ=255) aaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTaa < 2:649505/76‑1 (MQ=255) aaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAg < 2:1712465/76‑1 (MQ=255) aaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAg < 1:1753248/76‑1 (MQ=255) aaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAg < 1:133959/76‑1 (MQ=255) aGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGatat < 2:1672347/76‑1 (MQ=255) aGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGatat < 1:589213/76‑1 (MQ=255) ttttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATAttt > 1:1711755/1‑76 (MQ=255) ttttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATAttt > 2:347117/1‑76 (MQ=255) ttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTa > 2:1645752/1‑76 (MQ=255) ttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTa > 2:1110445/1‑76 (MQ=255) taagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTaa < 1:902194/76‑1 (MQ=255) taagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTaa < 1:618493/76‑1 (MQ=255) aagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAAt < 1:1611090/76‑1 (MQ=255) agggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATg < 1:1469776/76‑1 (MQ=255) agggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATg < 1:177463/76‑1 (MQ=255) gggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATgg < 1:109919/76‑1 (MQ=255) gggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATgg < 2:731714/76‑1 (MQ=255) ggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGGGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGa < 2:1131000/76‑1 (MQ=255) taagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGAtt > 1:581742/1‑76 (MQ=255) taagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGAtt < 1:1602718/76‑1 (MQ=255) taagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGAtt > 1:1762615/1‑76 (MQ=255) gATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACAt < 2:436155/76‑1 (MQ=255) tAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGc < 1:1703024/76‑1 (MQ=255) aGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGcc > 1:98506/1‑76 (MQ=255) gAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCg < 2:1871369/76‑1 (MQ=255) aaTATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGc > 2:1159093/1‑76 (MQ=255) aaTATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGc > 1:613723/1‑76 (MQ=255) aaTATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGc > 2:306710/1‑76 (MQ=255) atatAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGca > 2:929993/1‑76 (MQ=255) tataAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGcac < 2:1580997/76‑1 (MQ=255) ataAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGcaca > 1:839328/1‑76 (MQ=255) ataAAACTATGATGAGCTGCCATTGAAGATGATTTGCCAATAAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGcaca > 2:1506537/1‑76 (MQ=255) taAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaa > 2:739390/1‑76 (MQ=255) taAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaa > 2:1270610/1‑76 (MQ=255) taAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaa < 2:1290755/76‑1 (MQ=255) aaaaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaaa > 2:11395/1‑76 (MQ=255) aaaaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaaa > 2:1301025/1‑76 (MQ=255) aaaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaaaa > 2:412709/1‑76 (MQ=255) aaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAAt < 2:94973/76‑1 (MQ=255) aaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGAACAAAAt > 2:1906309/1‑76 (MQ=255) aCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATg > 2:1800210/1‑76 (MQ=255) gatgaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTAc > 1:1623045/1‑76 (MQ=255) atgaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACa < 2:1042077/76‑1 (MQ=255) aGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgt > 2:1125842/1‑76 (MQ=255) gCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtg < 2:1028715/76‑1 (MQ=255) cTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtgt > 1:1734811/1‑76 (MQ=255) cTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtgt < 2:1272270/76‑1 (MQ=255) cTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtgt > 2:1194255/1‑76 (MQ=255) 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1:1893059/1‑76 (MQ=255) tGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATg > 2:780849/1‑76 (MQ=255) ccAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGa < 2:1762615/76‑1 (MQ=255) aaTCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGaaa > 2:678893/1‑76 (MQ=255) | AAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAA > REL606/281880‑282026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |