| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 297897 | 125 (1.930) | 7 (0.120) | 4/136 | 7.5 | 6.2% | coding (117/669 nt) | ykgH | predicted inner membrane protein |
| ? | REL606 | = 298061 | 100 (1.700) | intergenic (‑48/+165) | ykgH/betA | predicted inner membrane protein/choline dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGATATCCTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGAGAG > REL606/297986‑298135 | tatCCTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCt > 1:767112/1‑76 (MQ=255) tatCCTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCt < 1:302437/76‑1 (MQ=255) atCCTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTg < 2:1791302/76‑1 (MQ=255) cTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTAt > 1:1871642/1‑76 (MQ=255) cTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTAt < 1:1366616/76‑1 (MQ=255) tGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATc < 1:1121819/76‑1 (MQ=255) tGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATc > 1:732009/1‑76 (MQ=255) tGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATc > 1:1536068/1‑76 (MQ=255) gTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCa > 1:588800/1‑76 (MQ=255) tttGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAg < 2:1237959/76‑1 (MQ=255) tttGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAg > 1:1527472/1‑76 (MQ=255) tGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGa < 1:231957/76‑1 (MQ=255) tGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGa > 2:635632/1‑76 (MQ=255) tGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGa > 1:1898638/1‑76 (MQ=255) gATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGaa > 2:2011470/1‑76 (MQ=255) aTTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAAt < 1:1748337/76‑1 (MQ=255) tttGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATg < 1:1172936/76‑1 (MQ=255) tttGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATg > 1:1552591/1‑76 (MQ=255) ttGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGt > 1:1621819/1‑76 (MQ=255) tGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGtt > 1:1930510/1‑76 (MQ=255) tGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGtt > 1:1798421/1‑76 (MQ=255) tCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCgg > 1:1155727/1‑76 (MQ=255) gCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTa < 2:1100104/76‑1 (MQ=255) gCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTa < 1:1292134/76‑1 (MQ=255) cATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaa < 2:831659/76‑1 (MQ=255) cATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaa > 1:1973783/1‑76 (MQ=255) cATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaa > 2:363668/1‑76 (MQ=255) ataataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaaa > 1:362387/1‑76 (MQ=255) ataataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaaa < 1:219159/76‑1 (MQ=255) ataataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTaaa < 1:1144296/76‑1 (MQ=255) aataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAata > 1:251648/1‑76 (MQ=255) aataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAata > 2:235018/1‑76 (MQ=255) aataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAata > 1:228809/1‑76 (MQ=255) aataTATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAata > 1:1326905/1‑76 (MQ=255) atatatCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAatat < 1:604049/76‑1 (MQ=255) atatatCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAatat < 2:68969/76‑1 (MQ=255) atatCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCa > 2:1243323/1‑76 (MQ=255) atCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGc < 2:1745595/76‑1 (MQ=255) ccAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCGGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaa < 1:485057/76‑1 (MQ=255) ccAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaa < 1:485078/76‑1 (MQ=255) ccAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaa > 1:1059048/1‑76 (MQ=255) cAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaaa > 1:1453923/1‑76 (MQ=255) agagAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaaaa < 1:1373799/76‑1 (MQ=255) agagAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaaaa > 1:1862744/1‑76 (MQ=255) agagAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaaaa < 1:1764155/76‑1 (MQ=255) agagAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCaaaa < 1:715170/76‑1 (MQ=255) gaATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGc > 1:1918030/1‑76 (MQ=255) gaATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGc < 1:1578590/76‑1 (MQ=255) aTAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGccc < 2:752932/76‑1 (MQ=255) aTAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGccc > 1:1443372/1‑76 (MQ=255) aaaaTCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGc < 1:1728951/76‑1 (MQ=255) aaTCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcat > 1:284050/1‑76 (MQ=255) aaTCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcat > 2:419610/1‑76 (MQ=255) aaTCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcat < 1:1961921/76‑1 (MQ=255) cTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcatcat > 1:1532844/1‑76 (MQ=255) cTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcatcat > 2:185426/1‑76 (MQ=255) cTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGcatcat > 1:1543026/1‑76 (MQ=255) tGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATg < 2:1784019/76‑1 (MQ=255) gTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGa < 2:380828/76‑1 (MQ=255) gTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGa > 1:1420103/1‑76 (MQ=255) tCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCGGCATCATGaa < 2:1441389/76‑1 (MQ=255) tCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGaa > 1:2067273/1‑76 (MQ=255) cAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATAc > 1:1492411/1‑76 (MQ=255) cAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATAc < 2:1460731/76‑1 (MQ=255) cAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATAc < 2:1460741/76‑1 (MQ=255) gATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTg > 2:1505187/1‑76 (MQ=255) gATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTg < 2:1107634/76‑1 (MQ=255) aaGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGat < 1:272713/76‑1 (MQ=255) aaGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGat > 2:1014918/1‑76 (MQ=255) ggTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGatat < 1:961580/76‑1 (MQ=255) ggTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGatat < 1:1217525/76‑1 (MQ=255) ggTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGatat < 1:1217542/76‑1 (MQ=255) ggTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGatat < 1:1232569/76‑1 (MQ=255) gTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGatata < 1:1929621/76‑2 (MQ=255) gTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATg > 1:1446468/1‑76 (MQ=255) gTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATg < 1:866551/76‑1 (MQ=255) gTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATg < 1:1929647/76‑1 (MQ=255) gTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATg < 1:866550/76‑1 (MQ=255) ttGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGa > 2:1741986/1‑76 (MQ=255) tGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGaa > 2:1953694/1‑76 (MQ=255) tGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGaa > 1:821253/1‑76 (MQ=255) gTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAg > 1:1152442/1‑76 (MQ=255) gTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAg < 2:251648/76‑1 (MQ=255) gTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAg < 1:235018/76‑1 (MQ=255) gTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAg > 1:720854/1‑76 (MQ=255) tATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGc < 1:1349312/76‑1 (MQ=255) aTTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCa < 1:2095827/76‑1 (MQ=255) aTTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCa > 1:1507059/1‑76 (MQ=255) aTTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCa < 1:1374055/76‑1 (MQ=255) ttAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCAt > 2:1102582/1‑76 (MQ=255) ttAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCAt < 1:1065502/76‑1 (MQ=255) aaTAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATga > 1:592726/1‑76 (MQ=255) aTAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATgag < 2:310109/76‑1 (MQ=255) aTAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATgag < 1:432944/76‑1 (MQ=255) tAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATgaga < 2:1416520/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCGAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGagag < 2:366942/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGagag < 2:319514/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGagag < 1:2064499/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGagag < 2:751901/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGagag > 2:1314341/1‑76 (MQ=255) | CGATATCCTGTTTGATTTGTTCACGCATAATATATCCAGAGAATAAAATCTGTCGCAGATAAGGTTGTATTAATAGTCTGTATCAGGAATGTTCGGGTTAAATATCAGCAAAAAGCCCGCATCATGAATACTGGATATGAAGCATGAGAG > REL606/297986‑298135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |