| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3021053 | 89 (1.450) | 11 (0.200) | 8/132 | 4.8 | 12.8% | coding (431/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3021314 | 71 (1.320) | coding (170/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATCCCT > REL606/3020978‑3021128 | ttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTAt > 2:1568108/1‑76 (MQ=255)ttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTAt > 2:1853492/1‑76 (MQ=255) ttcttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGaa > 2:246513/1‑76 (MQ=255) tcttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAAt > 2:1005800/1‑76 (MQ=255) tACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACt > 1:1293819/1‑76 (MQ=255) aCTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtt > 2:1384030/1‑76 (MQ=255) aCTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtt > 2:1936932/1‑76 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg > 1:1716067/1‑76 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg < 2:1157660/76‑1 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg > 1:1918349/1‑76 (MQ=255) tAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTa < 1:1818662/76‑1 (MQ=255) tAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTa < 1:146459/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaa > 2:855895/1‑76 (MQ=255) aaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaaa > 2:1566723/1‑76 (MQ=255) atatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAt < 1:1153020/76‑1 (MQ=255) tatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAtt > 2:1884183/1‑76 (MQ=255) tatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAtt < 2:211060/76‑1 (MQ=255) tttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtc < 2:1059345/76‑1 (MQ=255) ttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtca > 1:356941/1‑76 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat < 1:1670971/76‑1 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat < 1:1670975/76‑1 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat > 1:1774492/1‑76 (MQ=255) cATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatatc > 2:917739/1‑76 (MQ=255) cATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatatc < 1:1735837/76‑1 (MQ=255) cATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGCATTATATGGTCTATCGAATACTTTCGTAAATTtcatatc < 2:1590300/76‑1 (MQ=255) cTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatatcata < 1:1309329/76‑1 (MQ=255) cTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatatcata < 1:1309318/76‑1 (MQ=255) tAAGGTTAAAACAGGCCTTGTACTAACAAGAGTATTATATGGTCTATCGAATAATTTTGTAAATTTCATATCATAc > 2:890188/1‑76 (MQ=255) aaGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACg < 1:1863185/76‑1 (MQ=255) aaGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACg < 2:1763526/76‑1 (MQ=255) aaGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACg > 1:587148/1‑76 (MQ=255) aGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACgg < 2:1079838/76‑1 (MQ=255) ggTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGa < 1:1470887/76‑1 (MQ=255) ttAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGaaa < 1:1719996/76‑1 (MQ=255) tAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAAc > 2:1812452/1‑76 (MQ=255) aaaaCAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACg < 1:1201442/76‑1 (MQ=255) aaaCAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGt > 1:1663237/1‑76 (MQ=255) aaCAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTATAAATTTCATATCATACGGAAACGtt < 1:780058/76‑1 (MQ=255) aCAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGttt > 2:1194447/1‑76 (MQ=255) aCAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGttt > 1:609020/1‑76 (MQ=255) cAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTtg > 2:630654/1‑76 (MQ=255) ggCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTtgct < 2:920990/76‑1 (MQ=255) gCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTGTCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTtgctg < 2:1948667/76‑1 (MQ=255) gCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGCAAACGTTtgctt > 1:1571014/1‑75 (MQ=255) tGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGa > 1:1327791/1‑76 (MQ=255) gTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGat > 1:1805384/1‑76 (MQ=255) tACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGata < 1:1783083/76‑1 (MQ=255) tACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACAGAAACGTTTGCTGCTGata > 1:1359813/1‑76 (MQ=255) aCTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGatat > 1:35660/1‑76 (MQ=255) tAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATAttt > 1:435912/1‑76 (MQ=255) tAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATAttt > 2:1496643/1‑76 (MQ=255) aaCACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTa < 2:1737850/76‑1 (MQ=255) aaCACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTa > 1:837004/1‑76 (MQ=255) aaCACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTa > 2:82481/1‑76 (MQ=255) acacGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTaa > 2:859372/1‑76 (MQ=255) acGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAg < 1:1872802/76‑1 (MQ=255) gAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTg < 2:947342/76‑1 (MQ=255) aGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGc > 1:1813371/1‑76 (MQ=255) gTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCg > 1:649915/1‑76 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt < 1:1724650/76‑1 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt > 1:1733207/1‑76 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt > 1:655259/1‑76 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt > 1:961756/1‑76 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt > 1:893830/1‑76 (MQ=255) tattatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGt > 1:843275/1‑76 (MQ=255) attatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTg < 2:46530/76‑1 (MQ=255) attatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTg > 1:708298/1‑76 (MQ=255) attatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTg < 2:1786579/76‑1 (MQ=255) attatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTg < 2:1786589/76‑1 (MQ=255) ttatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAAGGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGa > 1:238257/1‑76 (MQ=255) ttatATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGa > 2:1153940/1‑76 (MQ=255) tataTGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGAt > 2:1253467/1‑76 (MQ=255) ctgatGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGAt > 2:1595789/4‑76 (MQ=255) ctgatGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGAt > 2:670741/4‑76 (MQ=255) ctgatGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGAt > 2:1107571/4‑76 (MQ=255) ctgatGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGAt > 2:670755/4‑76 (MQ=255) atGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATaaa < 1:1384030/76‑1 (MQ=255) atGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATaaa < 1:1591838/76‑1 (MQ=255) atGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATaaa > 2:1001026/1‑76 (MQ=255) tGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAAc < 1:81689/76‑1 (MQ=255) tGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAAc < 2:62164/76‑1 (MQ=255) tGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAAc < 2:62150/76‑1 (MQ=255) tGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAAc < 1:319253/76‑1 (MQ=255) gTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCa < 1:509346/76‑1 (MQ=255) tCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCAt > 1:829569/1‑76 (MQ=255) tCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCAt > 1:1783758/1‑76 (MQ=255) cTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATc > 1:2336/1‑76 (MQ=255) cTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATc < 1:1677528/76‑1 (MQ=255) cTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATc > 1:1379571/1‑76 (MQ=255) cTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATc > 1:1166646/1‑76 (MQ=255) tCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATCCCt < 2:1225937/76‑1 (MQ=255) | TTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATATCATACGGAAACGTTTGCTGCTGATATTTAAAGTGCGTGATAAACCATCCCT > REL606/3020978‑3021128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |