| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3582336 | 76 (1.240) | 14 (0.250) | 9/140 | 4.8 | 16.7% | coding (356/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3582485 | 69 (1.210) | coding (505/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAAT > REL606/3582261‑3582411 | ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 2:33704/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:800548/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:7438/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:412206/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa > 1:1525276/1‑76 (MQ=255) tattaCCAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAAc < 2:804185/76‑1 (MQ=255) attaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACa > 1:414553/1‑76 (MQ=255) attaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACa < 1:1844160/76‑1 (MQ=255) ttaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAt > 2:76453/1‑76 (MQ=255) taCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAtt < 2:923231/76‑1 (MQ=255) cTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAg < 1:204459/76‑1 (MQ=255) tAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGa > 1:1131390/1‑76 (MQ=255) tAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGa > 1:406100/1‑76 (MQ=255) tAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGa < 1:396949/76‑1 (MQ=255) aaCATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGat > 1:598565/1‑76 (MQ=255) aCATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGata < 1:1154809/76‑1 (MQ=255) aCATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGata < 1:1954897/76‑1 (MQ=255) cATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGatat < 1:349176/76‑1 (MQ=255) aTTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATg < 2:1364844/76‑1 (MQ=255) aaaCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaa < 1:52607/76‑1 (MQ=255) aCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaaaa < 2:1049972/76‑1 (MQ=255) aCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaaaa < 2:434768/76‑1 (MQ=255) gATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAAc > 1:1538365/1‑76 (MQ=255) aGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACaaaa < 1:364571/76‑1 (MQ=255) aGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAAGCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACaaaa < 1:364567/76‑1 (MQ=255) cGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGc > 1:745644/1‑76 (MQ=255) cGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGc > 2:1098927/1‑76 (MQ=255) cGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGc > 2:685743/1‑76 (MQ=255) caACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAAt < 1:1912371/76‑1 (MQ=255) aCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGt > 1:1424375/1‑76 (MQ=255) cTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTc > 2:1325987/1‑76 (MQ=255) cTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTc > 1:1608124/1‑76 (MQ=255) ttACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCg > 1:938707/1‑76 (MQ=255) aCGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGaa < 2:1112809/76‑1 (MQ=255) aCGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGaa < 1:274779/76‑1 (MQ=255) aCAGACACGATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCAtt < 2:510110/76‑1 (MQ=255) aCAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCAtt > 2:727824/1‑76 (MQ=255) cAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTg < 2:1018767/76‑1 (MQ=255) gACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGtt < 2:1651880/76‑1 (MQ=255) cacaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTAt > 1:175950/1‑76 (MQ=255) cacaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTAt > 1:175958/1‑76 (MQ=255) cacaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTAt > 1:683782/1‑76 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc < 1:225241/76‑1 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc < 1:566039/76‑1 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc > 1:1739105/1‑76 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc < 1:353098/76‑1 (MQ=255) natcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGc > 1:881088/2‑76 (MQ=255) aatcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGc > 1:200574/1‑76 (MQ=255) aatcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGc > 1:881109/1‑76 (MQ=255) aatcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGc > 1:1303821/1‑76 (MQ=255) atcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCt > 1:653866/1‑76 (MQ=255) atcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCt < 1:970523/76‑1 (MQ=255) caatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTaa < 1:1805816/76‑1 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTaaat < 2:1427166/76‑3 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 2:1307599/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc < 2:825893/76‑1 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:1236281/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:250071/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:1762156/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:1745848/1‑76 (MQ=255) tACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATcc < 1:186856/76‑1 (MQ=255) aCTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCt < 2:28743/76‑1 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa < 1:71106/76‑1 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa > 1:1254162/1‑76 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa > 1:259159/1‑76 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa > 1:1810614/1‑76 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa < 2:663528/76‑1 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa > 1:1632323/1‑76 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa < 1:1463919/76‑1 (MQ=255) tAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTaaa > 1:1033371/1‑76 (MQ=255) tAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTaaa > 2:1537140/1‑76 (MQ=255) cAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCg < 1:1492857/76‑1 (MQ=255) aGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGa > 2:786877/1‑76 (MQ=255) aTTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACa > 1:1244498/1‑76 (MQ=255) ttAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACaa > 1:1504758/1‑76 (MQ=255) taataaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAg < 1:499595/76‑1 (MQ=255) ataaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGc < 1:1147686/76‑1 (MQ=255) taaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCa < 2:683476/76‑1 (MQ=255) taaCATCAGATACGACCCAAACAAAAGTGCTCAATGCCGAATCATCGCTATCGCTAATCCTAAACCCGCCAACGcc > 2:1800622/1‑75 (MQ=255) aaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCaa > 2:1680803/1‑76 (MQ=255) aCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAAt > 2:1199066/1‑76 (MQ=255) | TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAAT > REL606/3582261‑3582411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |