Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 2031858–2031887 | 2054816–2054779 | 22893–22959 | 17 [16] | [16] 17 | [manB]–[cpsG] | [manB],manC,insB‑14,insA‑14,wbbD,wbbC,wzy,wbbB,wbbA,vioB,vioA,wzx,rmlC,rfbA,rfbD,rfbB,galF,wcaM,wcaL,wcaK,wzxC,wcaJ,[cpsG] |
CCATCAGCGGCACATCACCGCGCGATTCCACATTCAGGCGCACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGCCA > REL606/2054767‑2054892 | ccATCAGCGGCACATCACCGCGCGATTCCACATTCAGGCGCACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTaaa < 2:616212/76‑1 (MQ=255) aaccgcACCACCGGNTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCCTGCTGATGCCATCAg < 1:1514354/73‑1 (MQ=255) accgcACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAgc > 2:429301/3‑75 (MQ=255) ccgcACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTg < 1:607563/75‑1 (MQ=255) gcACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCg > 2:1109052/1‑76 (MQ=255) caccacCGGTNCGCTATTGGANGTGCGCAGGTTACAGCGCCAGTCGGCAACGGTCATGCTGATGCCATCATTGCgt > 2:1739788/1‑75 (MQ=14) ccaccGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATc < 2:43378/76‑1 (MQ=255) caccGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATcc > 1:720073/1‑76 (MQ=255) accGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCa < 1:449589/76‑1 (MQ=255) ccGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCAc < 2:154743/76‑1 (MQ=255) cGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCAcc > 2:1347018/1‑76 (MQ=255) cGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCAcc > 1:970158/1‑76 (MQ=255) ggTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCg > 1:72671/1‑76 (MQ=255) gTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGc > 2:1532701/1‑76 (MQ=255) gTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGc > 2:940258/1‑76 (MQ=255) ttCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGcc < 2:1118292/76‑1 (MQ=255) ttCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGcc > 2:638254/1‑76 (MQ=255) tCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGCCa > 1:1361704/1‑76 (MQ=255) | CCATCAGCGGCACATCACCGCGCGATTCCACATTCAGGCGCACCACCGGTTCGGTATTGGAGGTGCGCAGGTTAAAGCGCCAGTCGGCAAAGGTCATGCTGATGCCATCAGTGCGATCCACCGCCA > REL606/2054767‑2054892 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |