| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3021002 | 120 (2.020) | 13 (0.240) | 9/136 | 4.6 | 12.5% | coding (482/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3021158 | 73 (1.360) | coding (326/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AAGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATAT > REL606/3020927‑3021077 | aaGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAg < 1:1475456/76‑1 (MQ=255) gTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCa < 1:79432/76‑1 (MQ=255) gTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCa > 1:851677/1‑76 (MQ=255) ttAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCAt > 2:1658939/1‑76 (MQ=255) ttAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCAt < 1:270318/76‑1 (MQ=255) ttAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCAt < 1:270313/76‑1 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc > 1:954592/1‑76 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc < 1:1565168/76‑1 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc < 1:1445489/76‑1 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc > 2:688548/1‑76 (MQ=255) aCTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTa < 2:263849/76‑1 (MQ=255) aCTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTa < 2:1558752/76‑1 (MQ=255) aCTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTa < 2:769928/76‑1 (MQ=255) cttcttCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTaa < 1:1732117/76‑1 (MQ=255) cttcttCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTaa < 1:1678273/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTGCTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:1813258/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 2:432440/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:25850/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:289799/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:358492/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:1813236/76‑1 (MQ=255) ttcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAg < 1:358497/76‑1 (MQ=255) tcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAgg < 1:1588303/76‑1 (MQ=255) tcttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAgg < 1:1588324/76‑1 (MQ=255) ttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGtt < 2:87338/76‑1 (MQ=255) cACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGTATCTAAGGTTaa < 1:1896017/76‑1 (MQ=255) cACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaa < 1:660195/76‑1 (MQ=255) cACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaa < 1:882316/76‑1 (MQ=255) aCTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaa > 2:1073415/1‑76 (MQ=255) aCTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaa < 1:74739/76‑1 (MQ=255) aCTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACCTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaa > 1:1827448/1‑76 (MQ=255) cTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaaa < 2:1416071/76‑1 (MQ=255) cTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaaa < 1:1180107/76‑1 (MQ=255) tattatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAAc < 2:1684740/76‑1 (MQ=255) ttatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAg < 1:1294966/76‑1 (MQ=255) ataGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGc > 2:688997/1‑76 (MQ=255) taGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCa > 1:605909/1‑76 (MQ=255) aGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCAt > 2:1500142/1‑76 (MQ=255) gACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCAtt > 2:1051912/1‑76 (MQ=255) ctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTAc > 2:1653099/1‑76 (MQ=255) ctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTAc > 1:1051521/1‑76 (MQ=255) ctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTAc > 2:114383/1‑76 (MQ=255) ctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTATAc < 1:885688/76‑1 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 1:605543/1‑76 (MQ=255) ataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAac > 1:1130078/1‑76 (MQ=255) taaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAaca < 1:1492731/76‑1 (MQ=255) taaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAaca < 1:692139/76‑1 (MQ=255) aaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAacac < 2:956593/76‑1 (MQ=255) aaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAacac < 2:956607/76‑1 (MQ=255) aGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACg < 1:299597/76‑1 (MQ=255) tctcTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAg < 1:1793092/76‑1 (MQ=255) tctcTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAg < 1:1793069/76‑1 (MQ=255) ctctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGt > 2:96108/1‑76 (MQ=255) ctctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGt > 1:583230/1‑76 (MQ=255) ctctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGt > 1:507614/1‑76 (MQ=255) ctctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGt < 1:1360156/76‑1 (MQ=255) tctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGta < 2:1680411/76‑1 (MQ=255) ctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtat < 1:857390/76‑1 (MQ=255) ctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtat > 2:1804349/1‑76 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 1:1269700/1‑76 (MQ=255) ccATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtattat < 1:1597229/76‑1 (MQ=255) aTTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTatat < 1:161984/76‑1 (MQ=255) tCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATgg < 1:849930/76‑1 (MQ=255) cgacttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGGATTGTACTAACACGAGGATTATATGGt > 1:1522954/3‑76 (MQ=255) cAACTTTCTTCTTACGATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGt < 1:270682/76‑1 (MQ=255) cAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGt < 1:65705/76‑1 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt > 1:1763986/1‑76 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt > 1:1698445/1‑76 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt < 1:1429100/76‑1 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt > 1:1365001/1‑76 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt > 2:1129490/1‑76 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt < 2:1175731/76‑1 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt > 1:1025818/1‑76 (MQ=255) cttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTa < 2:97670/76‑1 (MQ=255) ttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTAt > 1:788248/1‑76 (MQ=255) acttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCg < 2:551802/76‑1 (MQ=255) acttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCg < 2:1823915/76‑1 (MQ=255) cttcttAGTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGa > 1:1119034/1‑76 (MQ=255) ttcttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGat < 2:542808/76‑2 (MQ=255) ttcttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGaa > 2:1500259/1‑76 (MQ=255) tcttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAAt < 1:1552299/76‑1 (MQ=255) cttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATa > 2:1461768/1‑76 (MQ=255) cttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATa < 1:1073415/76‑1 (MQ=255) ttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATAc > 1:409474/1‑76 (MQ=255) aCTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtt > 1:1176145/1‑76 (MQ=255) tATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtttt > 1:169294/1‑76 (MQ=255) tttAAATATTTAGCCTCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTCTCGCATCCTTTTg > 1:843254/2‑76 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACGCGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg < 2:394250/76‑1 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg < 2:394233/76‑1 (MQ=255) ttAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGt > 2:1096318/1‑76 (MQ=255) aaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaaa < 2:1888650/76‑1 (MQ=255) aaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaaa > 1:1471624/1‑76 (MQ=255) tatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAtt > 1:1377142/1‑76 (MQ=255) atTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAttt > 1:1667109/1‑76 (MQ=255) atTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAttt < 1:1647645/76‑1 (MQ=255) atTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAttt < 1:1647664/76‑1 (MQ=255) tttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtc > 1:330278/1‑76 (MQ=255) tttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtc < 1:880572/76‑1 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat < 1:236887/76‑1 (MQ=255) gCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatat > 2:14510/1‑76 (MQ=255) | AAGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATAT > REL606/3020927‑3021077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |