| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3582336 | 92 (1.550) | 16 (0.290) | 12/140 | 3.9 | 16.3% | coding (356/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3582485 | 78 (1.410) | coding (505/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGC > REL606/3582261‑3582408 | ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:556150/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:1783740/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:1348313/76‑1 (MQ=255)ttattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATtaataa < 1:1348328/76‑1 (MQ=255) tattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAAc > 2:970137/1‑76 (MQ=255) tattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAAc > 2:1359541/1‑76 (MQ=255) tattaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAAc < 2:1480989/76‑1 (MQ=255) attaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACa < 1:1027157/76‑1 (MQ=255) ttaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAt > 1:175134/1‑76 (MQ=255) ttaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAt < 2:23253/76‑1 (MQ=255) ttaCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAt > 1:1565023/1‑76 (MQ=255) taCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAtt < 2:460222/76‑1 (MQ=255) taCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACAtt < 2:1807859/76‑1 (MQ=255) aCTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTa < 1:1867983/76‑1 (MQ=255) cTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAg > 1:337769/1‑76 (MQ=255) cTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAg < 2:1344318/76‑1 (MQ=255) tAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGa < 1:1114255/76‑1 (MQ=255) tAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGa > 2:1469300/1‑76 (MQ=255) aaCATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGat > 2:1177629/1‑76 (MQ=255) aCATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGata < 2:893437/76‑1 (MQ=255) cATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGatat < 1:1305221/76‑1 (MQ=255) aTTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATg > 2:1392791/1‑76 (MQ=255) ttGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGa < 1:662052/76‑1 (MQ=255) tGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGat > 2:180536/1‑71 (MQ=255) tGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGat < 1:180536/71‑1 (MQ=255) tGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaa > 2:1801987/1‑76 (MQ=255) tGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaa < 2:1865591/76‑1 (MQ=255) aaaCTATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaa > 2:531504/1‑76 (MQ=255) aaaCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaa < 1:1329388/76‑1 (MQ=255) aaaCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaa > 2:1528279/1‑76 (MQ=255) aaCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaaa < 2:779345/76‑1 (MQ=255) aaCGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGaaaaa > 1:49873/1‑76 (MQ=255) gATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAAc < 2:807344/76‑1 (MQ=255) gATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAAc < 1:1043342/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACa > 2:957212/1‑76 (MQ=255) aTAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACa < 1:158056/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACa < 1:410237/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACa > 2:957195/1‑76 (MQ=255) aaGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACaaa < 1:522327/76‑1 (MQ=255) aGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACaaaa < 1:536783/76‑1 (MQ=255) aGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACaaaa < 1:536752/76‑1 (MQ=255) gTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAg < 1:994775/76‑1 (MQ=255) ttCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGt > 2:1759930/1‑76 (MQ=255) acaACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGaa < 1:1435698/76‑1 (MQ=255) caACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAAt < 2:676349/76‑1 (MQ=255) aaCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATg > 1:1601534/1‑76 (MQ=255) aaCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATg < 2:1730220/76‑1 (MQ=255) aaCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATg > 1:936250/1‑76 (MQ=255) aaCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATg < 1:1433302/76‑1 (MQ=255) aCTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGt < 1:1452697/76‑1 (MQ=255) cTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTc > 1:1808115/1‑76 (MQ=255) aCGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGGGCTGAATGTCGaa < 1:278012/76‑1 (MQ=255) cAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCa > 2:761753/1‑76 (MQ=255) aaCAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCAt > 1:983937/1‑76 (MQ=255) aaCAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACA‑TAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAAAGTCGAATCAtt > 1:80194/1‑76 (MQ=255) aCAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCAtt > 1:249287/1‑76 (MQ=255) cAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTg > 2:575688/1‑76 (MQ=255) aGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTATATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGt > 1:186160/1‑76 (MQ=255) gACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGtt > 2:1508238/1‑76 (MQ=255) gACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGtt > 2:1508264/1‑76 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc > 1:1258825/1‑76 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc > 1:915596/1‑76 (MQ=255) acaATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATc < 2:1542858/76‑1 (MQ=255) aatcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGc > 1:207027/1‑76 (MQ=255) atcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCt < 2:1087762/76‑1 (MQ=255) tcaatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTa < 2:1807420/76‑1 (MQ=255) caatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTaa > 1:396790/1‑76 (MQ=255) caatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTaa > 2:1219352/1‑76 (MQ=255) aatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAAt > 1:157214/1‑76 (MQ=255) aatACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAAt > 1:157212/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:1151221/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:1225034/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:958511/1‑76 (MQ=255) atACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATc > 1:160217/1‑76 (MQ=255) tACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATcc > 2:780255/1‑76 (MQ=255) aCTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCt < 2:1858544/76‑1 (MQ=255) aCTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCt > 2:846900/1‑76 (MQ=255) aCTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCt < 1:1339608/76‑1 (MQ=255) aCTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAATGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCt > 1:976095/1‑76 (MQ=255) cTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTa < 1:337734/76‑1 (MQ=255) ttAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTaa > 2:235979/1‑76 (MQ=255) tAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTaaa > 1:178605/1‑76 (MQ=255) aaTCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAAc > 2:369593/1‑76 (MQ=255) aTCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAAcc > 2:188930/1‑76 (MQ=255) aTCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAAcc > 1:196627/1‑76 (MQ=255) tCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAAccc > 1:401433/1‑76 (MQ=255) cAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCg > 1:142794/1‑76 (MQ=255) cAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCg < 2:1605080/76‑1 (MQ=255) gATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGAc > 1:405108/1‑76 (MQ=255) gATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGAc > 2:1112327/1‑76 (MQ=255) gATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGAc < 2:1225034/76‑1 (MQ=255) aTTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACa > 1:1357259/1‑76 (MQ=255) aTTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACa > 2:317939/1‑76 (MQ=255) taataaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAg > 2:1093045/1‑76 (MQ=255) ataaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGc > 2:533745/1‑76 (MQ=255) ataaCATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGc < 1:939835/76‑1 (MQ=255) | TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAACATTAGATATGAAAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGC > REL606/3582261‑3582408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |