| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2038236 = | 54 (0.870) | 7 (0.120) | 5/136 | 6.4 | 8.8% | coding (713/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB |
| ? | REL606 | 2038515 = | 97 (1.730) | coding (434/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTAACA > REL606/2038162‑2038311 | agtGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAAt < 1:841820/74‑1 (MQ=255)aTTGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATGCCACTTTCACCAAt < 1:368632/76‑1 (MQ=255) ttGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATc > 1:398208/1‑76 (MQ=255) ttGCTCGTTT‑AAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAAttt > 1:398207/1‑74 (MQ=255) tGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCt > 1:281763/1‑76 (MQ=255) gCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCtt < 1:594744/76‑1 (MQ=255) cTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTc > 1:99131/1‑76 (MQ=255) tttAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTg < 2:1613214/76‑1 (MQ=255) tttAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTg < 2:1431726/76‑1 (MQ=255) tAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGat > 2:675453/1‑76 (MQ=255) gctaaaTTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGata > 2:40793/4‑76 (MQ=255) aaaTTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGa < 1:948666/76‑1 (MQ=255) aaaTTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGa < 1:948659/76‑1 (MQ=255) aTTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGaaa < 1:823724/76‑1 (MQ=255) aTTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGaaa < 1:823713/76‑1 (MQ=255) cacCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTcc < 1:155221/76‑1 (MQ=255) cacCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTcc < 1:526982/76‑1 (MQ=255) ttcctttccATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGaa < 1:107837/76‑1 (MQ=255) ttcctttccATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGaa < 1:107824/76‑1 (MQ=255) tttccATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGaca < 1:580365/76‑1 (MQ=255) ccATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑At > 1:1133099/1‑76 (MQ=255) ccATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑At > 2:1318181/1‑76 (MQ=255) cATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑Att < 1:1865913/76‑1 (MQ=255) aTGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTg < 2:852627/76‑1 (MQ=255) aTGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTg < 1:1770180/76‑1 (MQ=255) aaaaTAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTaa < 2:1041150/76‑1 (MQ=255) aaaaTAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATGGAGCTTTaa < 2:1053414/76‑1 (MQ=255) aaTAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAata < 1:143018/76‑1 (MQ=255) aGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTa > 1:456479/1‑76 (MQ=255) gAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTaa < 2:1769398/76‑1 (MQ=255) gAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTaa > 1:691433/1‑76 (MQ=255) aaaCAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAAt < 1:1804898/76‑1 (MQ=255) aacaacAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAAtt < 2:510542/76‑1 (MQ=255) caacaaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCg > 2:1125007/1‑76 (MQ=255) caacaaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCg < 1:745940/76‑1 (MQ=255) atcaaTTCCACTTTCACCATTCGTCCCTGATATGAAT‑TGTTCCATGAAGTCAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCgt < 1:965669/74‑1 (MQ=255) acaaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCCGCTATTAAATTTTTCCATAAAG‑CACAATTTAGTTTTACTTTTAATTctt > 1:1468401/1‑74 (MQ=255) aaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTACTTCgttgt > 1:1389030/1‑76 (MQ=255) aaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCgttgt > 1:1389037/1‑76 (MQ=255) aaTTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCgttgt > 1:1913771/1‑76 (MQ=255) tCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTa < 1:967837/76‑1 (MQ=255) ccACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTAt < 1:1040238/76‑1 (MQ=255) ccACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTAt < 1:1437620/76‑1 (MQ=255) ccACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTAt < 1:741759/76‑1 (MQ=255) cTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCAt < 1:1529423/76‑1 (MQ=255) cTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCAt < 1:663575/76‑1 (MQ=255) tCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTAt > 2:95439/1‑76 (MQ=255) tCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTAt < 1:417686/76‑1 (MQ=255) cACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATg > 2:53618/1‑76 (MQ=255) cACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATg > 2:550376/1‑76 (MQ=255) cACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATg > 1:220552/1‑76 (MQ=255) ccAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTa > 1:193323/1‑76 (MQ=255) cAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTaa < 2:1841591/76‑1 (MQ=255) cAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTaa < 1:292600/76‑1 (MQ=255) aTCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTAACa < 1:1581273/76‑1 (MQ=255) aTCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTAACa < 1:527310/76‑1 (MQ=255) aTCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTAACa < 1:527290/76‑1 (MQ=255) | ATTGCTCGTTTAAAAAATTTAACACCTTTCCTTTCCATGTGGGAAAAATAGAAACAACAATTCCACTTTCACCAATCTTCCCTGATATGAAA‑TGTTCCATGAAGACAC‑ATTGAGCTTTAATATTAATTCGTTGTTTATCATTATGTAACA > REL606/2038162‑2038311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |