New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 2038833 | 30 (0.550) | 7 (0.140) | 6/134 | 5.3 | 21.6% | coding (116/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB |
? | REL606 | = 2039157 | 24 (0.490) | coding (538/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCTGGCTTTAAAGTA > REL606/2038759‑2038907 | cAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAAt < 1:1671545/76‑1 (MQ=255) aaaaaGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATc < 1:832520/76‑1 (MQ=255) aaaaGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATca < 1:976243/76‑1 (MQ=255) gagaATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCacaac < 2:496085/76‑1 (MQ=255) aTTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCa > 1:1335624/1‑76 (MQ=255) cccGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATCGGAAATCACAACACCATCTAGt > 2:1105220/1‑76 (MQ=255) atatGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTg < 1:1111585/76‑1 (MQ=255) gAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTaa < 2:1583524/76‑1 (MQ=255) aTTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATtatata > 1:74368/1‑76 (MQ=255) aTTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATtatata > 1:74377/1‑76 (MQ=255) ttGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATaa < 1:106465/76‑1 (MQ=255) tGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAAt > 1:1291395/1‑76 (MQ=255) tGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAAt > 1:1478939/1‑76 (MQ=255) tGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaa > 1:147757/1‑76 (MQ=255) tGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaa > 1:993219/1‑76 (MQ=255) tGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaa > 1:993217/1‑76 (MQ=255) ttCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaatt > 1:162009/1‑76 (MQ=255) ttCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaatt > 1:851960/1‑76 (MQ=255) tCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTattaatta > 1:1076733/1‑76 (MQ=255) ctactaTATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTAt > 1:867569/1‑76 (MQ=255) ctactaTATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTAt > 1:902923/1‑76 (MQ=255) tactaTATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATg > 1:1565828/1‑76 (MQ=255) actaTATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGa > 1:1725203/1‑76 (MQ=255) tataTGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAAt > 1:207295/1‑76 (MQ=255) atatGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAAtt > 1:822238/1‑76 (MQ=255) atGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCt > 1:471871/1‑76 (MQ=255) ttGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCTGGCTTTa > 1:1501927/1‑76 (MQ=255) ttGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCTGGCTTTa > 1:1501938/1‑76 (MQ=255) ggAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTTTGGCTTTaaa > 2:478911/1‑76 (MQ=255) aaTCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCTGGCTTTAAAGta < 1:751394/76‑1 (MQ=255) | CAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTCATTGTAATCTGTTCTACTATATGATTATTGGAAATCACAACACCATCTAGTTCATAATCTGGTAAATAATTATATAATTTATTAATTATGAATTCTGGCTTTAAAGTA > REL606/2038759‑2038907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |