| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3303564 = | 53 (1.030) | 3 (0.060) | 3/144 | 5.3 | 6.2% | coding (798/1368 nt) | dcuD | predicted transporter |
| ? | REL606 | 3335535 = | 40 (0.810) | coding (38/1452 nt) | panF | sodium/panthothenate symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCT > REL606/3335460‑3335610 | gAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCt < 1:400080/76‑1 (MQ=255) aTTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCtggt > 1:1188772/1‑76 (MQ=255) aTTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCtggt > 1:741566/1‑76 (MQ=255) tatcGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGgtggtggtg > 1:744312/1‑76 (MQ=255) tcGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGtt < 1:429413/76‑1 (MQ=255) gcgATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCg < 1:711310/76‑1 (MQ=255) gATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGt < 2:215498/76‑1 (MQ=255) atatCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTa < 1:754714/76‑1 (MQ=255) atCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTAtc > 1:1426512/1‑76 (MQ=255) atCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTAtc > 1:871131/1‑76 (MQ=255) cccACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTAtctc > 2:554377/1‑76 (MQ=255) cccACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTAtctc > 2:1236366/1‑76 (MQ=255) cACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCgg < 1:345757/76‑1 (MQ=255) cTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGtt < 2:427493/76‑1 (MQ=255) tGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGttt > 2:941499/1‑76 (MQ=255) gaggaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTat < 1:1204017/76‑1 (MQ=255) aggaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTatg < 2:269897/76‑1 (MQ=255) aCGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTatgcgatgc < 1:1626667/76‑1 (MQ=255) cGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTatgcgatgcg > 1:471503/1‑76 (MQ=255) cAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAAc < 1:874302/76‑1 (MQ=255) cAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAAc > 2:1100356/1‑76 (MQ=255) cAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAAc < 1:1306347/76‑1 (MQ=255) cTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGa < 2:1162731/76‑1 (MQ=255) cTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGa > 2:562830/1‑76 (MQ=255) ttGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAg > 1:202367/1‑76 (MQ=255) tGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGc < 1:870995/76‑1 (MQ=255) aaTTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGc < 1:941499/76‑1 (MQ=255) ttCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCAc > 1:512559/1‑76 (MQ=255) cTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCAcct > 2:729065/1‑76 (MQ=255) tACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCAcctt < 2:807548/76‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCAccttcct < 1:1160255/76‑1 (MQ=255) gCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCAccttcctt > 1:1486000/1‑76 (MQ=255) ggTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAAt < 1:562830/76‑1 (MQ=255) ggTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAAt > 2:1302984/1‑76 (MQ=255) gTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATg < 2:677695/76‑1 (MQ=255) tCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGa < 2:729347/76‑1 (MQ=255) ccTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTa < 1:1446814/76‑1 (MQ=255) ccTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTa > 2:312911/1‑76 (MQ=255) tATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTaat < 2:146373/76‑3 (MQ=255) tATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCGTCCTTAATGAGTAtt < 2:633994/76‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTc < 2:769221/76‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTcc < 1:1537615/76‑1 (MQ=255) tggtggtggTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCt < 1:613751/76‑1 (MQ=255) | GAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCT > REL606/3335460‑3335610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |