| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2114544 | 74 (1.410) | 3 (0.070) | 3/132 | 6.3 | 4.1% | coding (130/1968 nt) | ECB_02001 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 2115058 | 75 (1.630) | intergenic (‑20/+116) | ECB_02002/ECB_02003 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTTTCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCAAA > REL606/2114986‑2115133 | tttttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTAtttt < 1:1070896/76‑1 (MQ=255)tttttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTAtttt < 1:719316/76‑1 (MQ=255)tttttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGACGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTAtttt < 1:311306/76‑1 (MQ=255) ttttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTtta < 2:1128793/76‑1 (MQ=255) ttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTttctt > 2:1071999/1‑76 (MQ=255) ttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTttatt < 2:265273/76‑1 (MQ=255) ttCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTttatt < 2:582088/76‑1 (MQ=255) ccccGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTaa < 2:613410/76‑1 (MQ=255) cccGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAat < 1:918659/76‑1 (MQ=255) cGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAatat < 1:1580843/76‑1 (MQ=255) aaaCTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCt < 2:441098/76‑1 (MQ=255) aaaCTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCt < 2:855695/76‑1 (MQ=255) cTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGTTTTTTTATCACGGGGGCAGGGGGGTTTGTCTTTTCTTAATATCTAAt > 2:636321/1‑76 (MQ=255) tGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATg < 1:1664368/76‑1 (MQ=255) tGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATg < 1:171339/76‑1 (MQ=255) gTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGa < 2:93717/76‑1 (MQ=255) gTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGa < 2:749763/76‑1 (MQ=255) gTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGa > 1:1290639/1‑76 (MQ=255) tAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGac > 2:715563/1‑76 (MQ=255) tAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGac > 2:715580/1‑76 (MQ=255) cacaATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACt < 2:1180352/76‑1 (MQ=255) acaATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTc > 1:167129/1‑76 (MQ=255) atcaatTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtt < 1:1603535/76‑1 (MQ=255) tcaatTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCttt > 1:270780/1‑76 (MQ=255) tcaatTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCttt < 1:226242/76‑1 (MQ=255) caatTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttt < 2:1271504/76‑1 (MQ=255) caatTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttt < 1:1134699/76‑1 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt < 2:771453/76‑1 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt > 2:1665510/1‑76 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt > 2:1556773/1‑76 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt > 2:1246488/1‑76 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt < 1:1093856/76‑1 (MQ=255) atTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCtttttt < 1:466578/76‑1 (MQ=255) tttttGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTa > 1:812025/1‑76 (MQ=255) tttttGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTa > 1:812017/1‑76 (MQ=255) tttGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACt > 1:216379/1‑76 (MQ=255) ttGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTa > 2:61133/1‑76 (MQ=255) ttGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTa > 2:1011064/1‑76 (MQ=255) ttGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATga < 2:1136205/75‑1 (MQ=255) aTGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATga > 2:850010/1‑76 (MQ=255) ggATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATgaga < 2:659246/76‑1 (MQ=255) aTTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGata > 2:20229/1‑76 (MQ=255) aTTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGata < 1:1148407/76‑1 (MQ=255) ttttttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGataa < 1:1653572/76‑1 (MQ=255) ttttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGataata < 1:385213/76‑1 (MQ=255) ttttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGataata > 2:191155/1‑76 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat < 1:638185/76‑1 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat < 1:638168/76‑1 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat < 2:528712/76‑1 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat > 1:310292/1‑76 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat > 2:176198/1‑76 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat > 2:176216/1‑76 (MQ=255) tttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatat < 2:41282/76‑1 (MQ=255) ttATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatata > 2:1168906/1‑76 (MQ=255) tCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagat < 1:1227328/76‑1 (MQ=255) tCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagat < 1:1579089/76‑1 (MQ=255) tCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagat < 1:746080/76‑1 (MQ=255) cacaGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagata < 2:487754/76‑1 (MQ=255) cacaGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagata > 1:1105391/1‑76 (MQ=255) caGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagatata < 2:809231/76‑1 (MQ=255) caGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagatata < 2:809241/76‑1 (MQ=255) aGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagatatag > 1:1171291/1‑76 (MQ=255) aGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAatatagatatag < 2:744660/76‑1 (MQ=255) tACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCaa > 1:859665/1‑76 (MQ=255) aCATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAAt < 2:654723/76‑1 (MQ=255) cATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGGTAATATAGATATAGCAATg < 2:607182/76‑1 (MQ=255) cATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATg > 2:1043898/1‑76 (MQ=255) cATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATg < 2:607172/76‑1 (MQ=255) cATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATg < 1:988341/76‑1 (MQ=255) cATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATg > 2:1043907/1‑76 (MQ=255) aTAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATgg < 1:1404848/76‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCaa < 2:836714/76‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCaa < 1:621913/76‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCaa < 1:86475/76‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCaa < 1:682819/76‑1 (MQ=255) tttGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCAt < 1:897317/76‑1 (MQ=255) ttGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATa > 2:485889/1‑76 (MQ=255) tGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAg < 2:1087877/76‑1 (MQ=255) gTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGc < 2:1022114/76‑1 (MQ=255) tATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCa > 2:129081/1‑76 (MQ=255) tATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCa > 1:294282/1‑76 (MQ=255) ttttATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCaaa < 1:745518/76‑1 (MQ=255) ttttATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCaaa > 2:1615427/1‑76 (MQ=255) ttttATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCaaa > 1:318777/1‑76 (MQ=255) | TTTTTCCCCGAAACTGTAAGAGCACAATCAATTTTTGATGGATTTTTTATCACAGATACATAAAAATTTGTATTTTATTAATATCTAATGACAACACTCCTTTTTTACTATGAGATAATATAGATATAGCAATGGCAAGCATAGCAAA > REL606/2114986‑2115133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |