Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 3,612,965 | Δ4 bp | intergenic (‑26/+154) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylate transport protein/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 3612964 | 2 (0.040) | 69 (1.390) | 47/150 | 0.1 | 97.2% | intergenic (‑25/+158) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylate transport protein/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 3612969 = | 2 (0.040) | intergenic (‑30/+153) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylate transport protein/predicted diguanylate cyclase |
ATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3612890‑3612964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT > REL606/3612969‑3613043 ATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGT < 1:768596/76‑1 CGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGT < 2:873125/76‑1 CGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGT < 2:1474409/76‑1 CTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAA > 1:1557052/1‑76 GTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGG > 1:153550/1‑76 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGT > 2:449398/1‑76 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGCGTAAGGT > 2:449409/1‑76 CAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTT > 2:1531622/1‑76 GGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTAT < 2:23866/76‑1 GAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTA > 1:471272/1‑76 AGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCT > 1:851762/1‑76 GTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTG < 2:634742/76‑1 TAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGC > 2:306100/1‑76 AAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG > 1:52676/1‑76 AAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG > 2:781286/1‑76 AAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGATACCTGCGG < 2:712360/76‑1 GCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCT < 2:1238266/76‑1 CTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTT < 2:1266956/76‑1 CTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTT < 2:444510/76‑1 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTA > 2:801329/1‑76 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTA > 1:387601/1‑76 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTA > 2:122543/1‑76 TTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA > 1:1310899/1‑76 TAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA > 1:1499980/1‑76 AAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAT < 1:1548258/76‑1 AAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAT > 1:1374537/1‑76 AACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATA < 2:893783/76‑1 AACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATA > 1:707215/1‑76 AACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATA < 2:731611/76‑1 ACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAA > 2:717597/1‑76 CAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAC < 1:615223/76‑1 TTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGAC < 1:787350/76‑1 TTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACA < 2:580400/76‑1 TTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACA < 1:1371101/76‑1 TTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACA < 1:681351/76‑1 TCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAC > 1:1245133/1‑76 TCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAC > 1:130771/1‑76 CATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACA > 1:31731/1‑76 CATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACA > 2:1033918/1‑76 CATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACA < 1:1429022/76‑1 TAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATC < 1:1297403/76‑1 TAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATC > 1:1454898/1‑76 AGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCA < 2:20941/76‑1 GGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAC < 1:934095/76‑1 GGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAC > 2:1235922/1‑76 GGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAC > 1:1547060/1‑76 nGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGA > 1:865120/2‑76 TCCTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAA < 1:405113/76‑1 CTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATG > 2:1207044/1‑76 CTTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATG < 2:1312921/76‑1 TTTAGTAAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGT > 1:1372045/1‑76 AAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGG < 1:748852/76‑1 AAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGG < 1:1402140/76‑1 AAAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGG < 1:840732/76‑1 AAACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGA < 1:1142224/76‑1 AACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 1:1453783/76‑1 AACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 2:603821/76‑1 ACCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATC < 1:1580206/76‑1 CCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTTCCTGGATCA < 2:983621/76‑1 CCACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCA < 1:1185236/76‑1 CACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCAT < 1:787462/76‑1 CACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCAT < 2:841903/76‑1 ACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATA < 2:1567177/76‑1 ACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATA < 1:931924/76‑1 ACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATA < 1:806260/76‑1 ACAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATA < 1:64732/76‑1 CAGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAA < 1:1026112/76‑1 GTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT < 2:303415/76‑1 GTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT < 1:1228890/76‑1 ATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3612890‑3612964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT > REL606/3612969‑3613043 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |