New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3022200 = | 45 (0.910) | 10 (0.210) | 5/142 | 5.2 | 14.8% | coding (485/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
? | REL606 | 3022657 = | 73 (1.560) | coding (28/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAATTTTCTTCCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTG > REL606/3022125‑3022275 | taatTTTCTTCCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTaaaaa < 1:1312380/76‑1 (MQ=255) aatTTTCTTCCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAat < 1:74781/76‑1 (MQ=255) gtcCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTa < 2:797857/75‑1 (MQ=255) tcCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATCGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTAc > 1:315144/1‑76 (MQ=255) tcCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTAc > 1:1106555/1‑76 (MQ=255) tcCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTAc > 1:315160/1‑76 (MQ=255) aaCTCCCCCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATa < 1:884645/76‑1 (MQ=255) aaCTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATa < 1:873043/76‑1 (MQ=255) aaCTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATa < 1:796418/76‑1 (MQ=255) aaCTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATa > 1:521471/1‑76 (MQ=255) aCTCCACCCTCCCCTGAAGGGGCCTAGACAAGACTATGCGAATTTGCTTCGAATTTGAACATATTGCTCCCGATaa > 2:163583/1‑76 (MQ=255) aCTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATaa > 2:163592/1‑76 (MQ=255) ccACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTTGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAg < 1:167317/76‑1 (MQ=255) cTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGACAAAAGTATCg > 2:963771/1‑76 (MQ=255) cccATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCgat < 2:191150/76‑3 (MQ=255) cccATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGcc > 2:484251/1‑76 (MQ=255) cATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTa > 1:1016787/1‑76 (MQ=255) cATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTa < 2:211714/76‑1 (MQ=255) tAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAAttt > 2:1365048/1‑76 (MQ=255) aGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAAtttt > 1:417542/1‑76 (MQ=255) aGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAAtttt < 2:913941/76‑1 (MQ=255) cTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCAttgt < 1:1526397/76‑1 (MQ=255) gCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGat < 1:1341426/76‑1 (MQ=255) aaTTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATc > 2:565401/1‑76 (MQ=255) aaTTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATc > 2:1118267/1‑76 (MQ=255) ttGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTa < 2:604103/76‑1 (MQ=255) tGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCCTTGTTGATATTGTAc > 2:887958/1‑76 (MQ=255) tGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTAc < 2:698930/76‑1 (MQ=255) gATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACt < 2:785828/76‑1 (MQ=255) aTTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTg < 1:1292010/76‑1 (MQ=255) cGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGt < 1:1200919/76‑1 (MQ=255) cGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGt > 2:1005532/1‑76 (MQ=255) cGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGt < 2:1039424/76‑1 (MQ=255) cGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGt > 2:76923/1‑76 (MQ=255) gTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTg < 1:328977/76‑1 (MQ=255) aTTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGaa < 1:642440/76‑1 (MQ=255) aTTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGaa > 2:205688/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGaa > 1:17820/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGaa > 1:17835/1‑76 (MQ=255) ttAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAata > 2:1573173/1‑76 (MQ=255) tAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAatat > 2:1264102/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAAtata < 2:417542/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAAtata < 1:1224982/76‑1 (MQ=255) aaaaTATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATAc > 1:245406/1‑76 (MQ=255) aaaaTATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATAc > 1:245395/1‑76 (MQ=255) atatTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTg < 2:324124/76‑1 (MQ=255) atatTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTg < 1:1243149/76‑1 (MQ=255) atatTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTg < 1:949711/76‑1 (MQ=255) atatTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTg < 1:949710/76‑1 (MQ=255) atatTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTg < 1:89679/76‑1 (MQ=255) | TAATTTTCTTCCGGAACTCCACCCTCCCATGTAGGGGCATAGACAAGACTATGCGAATTTGATTCGTATTTAAAAATATTGCTACCGATAAAAGTATCGCCTAATTTTAGCACTTTCCCATTGTTGATATCGTACTGAGTGAATATACCTG > REL606/3022125‑3022275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |