| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 4,097,038 | (AGCAAGGGAGC)1→2 | coding (535/846 nt) | glpF ← | glycerol facilitator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4097027 = | 7 (0.130) | 46 (0.890) | 35/148 | 0.5 | 89.4% | coding (546/846 nt) | glpF | glycerol facilitator |
| ? | REL606 | = 4097037 | 4 (0.080) | coding (536/846 nt) | glpF | glycerol facilitator | |||||
TGATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/4097097‑4097027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCATGAACC < REL606/4097037‑4096963 TGATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCC > 2:216514/1‑76TGATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCCTGCTGCTCCC > 2:898035/1‑76 GATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCT > 1:914552/1‑76 ATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTT < 1:1227006/76‑1 TGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTG > 1:1347123/1‑76 GGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACGACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGC > 2:353942/1‑76 GGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCT > 2:259669/1‑76 GCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTTCCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGA < 2:198165/76‑1 TGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGCTT > 1:995764/1‑76 TGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATT < 2:1045311/76‑1 TGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATT < 1:392311/76‑1 GATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTG < 1:1005402/76‑1 GATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTG > 2:1645228/1‑76 CCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTC < 2:1545469/76‑1 CTGGCGTTAGCGGACGATGGCAGCGGTGTCCCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCT < 1:71075/76‑1 CTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCT < 1:1363480/76‑1 TGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTA > 1:395730/1‑76 TGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTA > 1:413378/1‑76 TTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGAT > 2:534045/1‑76 ACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTC < 1:1373558/76‑1 ACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTC < 1:258246/76‑1 ACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTC < 2:780864/76‑1 CGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCA > 1:216609/1‑76 GATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCAT < 1:1574801/76‑1 GTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCT < 1:703301/76‑1 TGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTA < 2:1017050/76‑1 TGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTA > 2:801185/1‑76 TGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTA > 2:1562385/1‑76 GTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTAT < 1:866656/76‑1 TACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATG < 1:366184/76‑1 ACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGG < 2:1403681/76‑1 CACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGC > 2:454301/1‑76 cCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCA < 2:1467059/75‑1 GCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCA < 1:604536/76‑1 CGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCAT > 1:1235206/1‑76 GCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTG < 1:1316749/76‑1 GCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTG < 1:667081/76‑1 GCCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTG < 1:306751/76‑1 CCCTTTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGA < 2:691557/76‑1 TTGGCTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGG > 2:492853/1‑76 CTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTT > 2:296632/1‑76 CTCCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTT < 2:297304/76‑1 CCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGC > 1:809763/1‑76 CCCTTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGC > 1:396283/1‑76 TTGCTGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCAT > 1:165968/1‑76 TGCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCATGAAC > 1:153974/1‑76 GCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCATGAACC > 1:372135/1‑76 GCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGCCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCATGAACC > 2:834470/1‑76 TGATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/4097097‑4097027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCTCCCTTGCTGATTGGTCTACTGATTGCGGTCATTGGCGCATCTATGGGCCCATTGACGGGTTTTGCCATGAACC < REL606/4097037‑4096963 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |