| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1884735 = | 38 (0.700) | 122 (2.280) | 74/148 | 0.0 | 74.7% | coding (469/567 nt) | yebN | conserved inner membrane protein |
| ? | REL606 | = 1889406 | 45 (0.840) | coding (554/1374 nt) | yebQ | predicted transporter | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GGATCTGGACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1884810‑1884735‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTGCA < REL606/1889406‑1889332 gacTCTGGAGGCGGATGCCGACCCGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAA < 2:1457861/73‑1GGATCTGGACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAA > 1:823418/1‑76GGATCTGGACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCGTTTTTTCCATTACTTGAGCCGATAAA > 1:1711946/1‑76 nGACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGG > 1:678624/2‑76 GACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGG < 1:1697402/76‑1 ggGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGC < 1:180039/74‑1 CGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATA > 1:834442/1‑76 CGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATA < 1:1757312/76‑1 CGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATA < 1:1339627/76‑1 GATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAA < 1:295594/76‑1 agcCCGACCACCCCCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAAT < 2:110761/73‑1 ATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAAT < 2:951925/76‑1 ATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAAT < 1:893080/76‑1 ATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAAT < 1:164757/76‑1 TGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATA < 1:201527/76‑1 GCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATAC < 2:922096/76‑1 CCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACC < 1:203371/76‑1 ctATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCT > 2:1540183/3‑76 CGATCAGCCCCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCT < 2:746292/76‑1 CGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCTGTTACAAGCAGGGGGATCATACat > 2:450471/1‑74 CGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCT < 1:343955/76‑1 TCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAAC < 2:1474070/76‑1 TCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAAC < 2:1051006/76‑1 CAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACG < 1:1591180/76‑1 AGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGG > 2:1574812/1‑76 gccCCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGT < 1:383716/73‑1 GCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGT < 1:1405746/76‑1 ACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTAC > 2:1704695/1‑76 ACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTAC > 2:601085/1‑76 AGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTT < 2:1409990/76‑1 CCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGAT < 1:1637680/76‑1 CGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATT > 1:1472583/1‑76 CCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAA > 1:47809/1‑76 CGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAA < 1:1757050/76‑1 CGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAA < 1:145030/76‑1 GAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAA < 2:1524151/76‑1 GAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAA > 2:219676/1‑76 GAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAA > 1:44014/1‑76 AGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGGTAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAA < 1:1357874/76‑1 AGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAA > 2:421280/1‑76 GAATTGCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAAT < 1:1242750/76‑1 ATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAA < 1:1003800/76‑1 ATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAA > 2:1095020/1‑76 TTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAGAAATAAC < 1:1102699/76‑1 TTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAAC > 1:140244/1‑76 TTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAAC > 2:1729487/1‑76 TTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAAC < 1:817279/76‑1 TCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCA > 2:241501/1‑76 CCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATCATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCAT > 1:847445/1‑76 CCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCAT > 1:847436/1‑76 GCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTT < 2:503530/76‑1 CTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTC < 1:1270890/76‑1 CTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTC > 2:710362/1‑76 CTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTC > 1:1066383/1‑76 CTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTC < 2:1006177/76‑1 TTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAATCATTTCC < 1:622152/76‑1 TTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCC < 2:364210/76‑1 TTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCC < 1:555453/76‑1 TTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCA > 1:637337/1‑76 TTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAG > 1:177338/1‑76 TTCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGA > 1:383941/1‑76 TCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGAT < 1:1293747/76‑1 TCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGAT > 1:1658516/1‑76 TCCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGAT > 2:736528/1‑76 CCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATG > 1:895960/1‑76 CCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATG < 2:381825/76‑1 CCCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATG > 1:798336/1‑76 CCAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGC > 1:1199166/1‑76 CAATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCG > 2:682060/1‑76 AATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGA > 1:354111/1‑76 ATAATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGAT < 1:226803/76‑1 AATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTNCAGGATGCGATGG < 1:1186602/76‑1 AATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGG < 1:1580445/76‑1 AATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGG > 1:1148697/1‑76 AATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGG < 2:1336466/76‑1 ATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACTGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGA > 2:1571333/1‑76 ATTGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGA > 2:344980/1‑76 TGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGA < 1:823570/76‑1 TGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGA > 1:1748789/1‑76 TGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGA < 2:202933/76‑1 TGAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGA > 1:670166/1‑76 GAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAn < 1:1296377/76‑2 GAGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAG > 1:56439/1‑76 AGCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGG > 1:1391752/1‑76 GCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGA > 1:1689988/1‑76 GCCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGA < 1:1540183/76‑1 CCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGAT < 1:112125/76‑1 CCGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGAT < 2:937304/76‑1 CGATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATT < 2:1665638/76‑1 GATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTG > 2:586671/1‑76 GATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTG > 1:709057/1‑76 ATAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGC > 2:1226153/1‑76 TAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCT > 2:299824/1‑76 TAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCT < 1:319985/76‑1 TAAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGAACGTTGATTAACAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCT > 2:779702/1‑76 AAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTG > 1:848505/1‑76 AAAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATGAAAAATAACAATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTG > 2:1592959/1‑76 AAAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTGC > 1:288030/1‑76 AAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTGCA > 2:345353/1‑76 AAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTGCA < 1:439239/76‑1 GGATCTGGACGCCGATGCCGATCAGCACCAGCCCGCCGAGAATTTCCGCTTTTTTCCCAATAATTGAGCCGATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1884810‑1884735‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAGCAGGGCGATAATACCTAACGGTACGTTGATTAAAAATAACCATTTCCAGGATGCGATGGAGAGGATTGCTGCA < REL606/1889406‑1889332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |