New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 568939 = | 1 (0.020) | 76 (1.640) | 50/150 | 0.0 | 98.7% | coding (998/1137 nt) | yhhI | predicted transposase |
? | REL606 | = 619884 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
GCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/569013‑568939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < REL606/619884‑619810 GCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTG < 2:603558/76‑1 CTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGG < 2:1410253/76‑1 GCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTG > 1:1277446/1‑76 GCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTG < 2:1321517/76‑1 CACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGA > 2:981939/1‑76 CACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATCGGTGA > 2:1492726/1‑76 CTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATG > 2:863349/1‑76 CTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATG > 1:16823/1‑76 TGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGC > 2:1367023/1‑76 CGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGC < 2:122679/76‑1 CTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAA > 1:24502/1‑76 CTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAA < 2:1104343/76‑1 TGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAAC < 1:1112685/76‑1 TGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAAC > 2:1425381/1‑76 TGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAAC > 1:1194108/1‑76 GACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTT < 1:772127/76‑1 GTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACT > 2:1558/1‑76 GTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:46526/76‑1 TGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 2:768060/76‑1 TGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:1127500/76‑1 GGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:629009/76‑1 AATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:1483674/76‑1 AATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 2:1378711/76‑1 TGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:762903/1‑76 AATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 2:120716/1‑76 GAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:1367023/76‑1 GAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:1358787/1‑76 AAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 2:1226138/76‑1 AGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 2:539030/76‑1 GACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:73596/1‑76 ACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1155426/76‑1 GACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:641697/1‑76 ACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 2:262106/76‑1 ACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 2:1161893/76‑1 CTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 2:137314/76‑1 TGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:1422089/76‑1 AAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:232510/76‑1 tATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:89498/2‑76 ATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 2:1480983/1‑76 ATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:1329318/76‑1 TAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:523779/1‑76 AGAGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 2:1126958/76‑1 AGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 2:223699/1‑76 AGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:1167244/1‑76 AGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:40578/1‑76 AGGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTAGAGGTGCTCCA > 1:1315340/1‑76 GGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 1:214195/76‑1 GGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 1:350841/76‑1 GGAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 2:1258924/76‑1 GAAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 2:397667/1‑76 AAATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 2:756263/76‑1 AATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:493680/1‑76 AATGCAGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:1047690/1‑76 AGCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 2:905113/76‑1 GCAGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 1:276734/1‑76 CAGAATTATTGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGAGGCTTCTGT > 2:1116054/1‑76 AGAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 2:404096/76‑1 GAATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 2:1070417/76‑1 ATTATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:1458086/76‑1 TTATTGGTGATGCTGCCAGCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:963471/76‑1 TATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1092192/76‑1 TATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCAAGTGGATTCTGATTCTAT > 1:680366/1‑76 ATTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:1317869/1‑76 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 1:1361802/1‑76 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 2:948047/76‑1 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 2:1320577/1‑76 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 2:471931/76‑1 TGGTGATGCTGCTATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:641697/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:1219119/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:521639/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:529282/1‑76 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:461954/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:328760/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:642826/1‑76 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:86018/76‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:229797/76‑1 GCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAATGCAGCAGAATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/569013‑568939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < REL606/619884‑619810 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |