| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3022729 | 130 (2.300) | 7 (0.130) | 6/140 | 4.6 | 6.4% | intergenic (‑45/+529) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase |
| ? | REL606 | = 3023284 | 83 (1.570) | coding (439/465 nt) | ECB_02822 | bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3022651‑3022729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttattGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGCAA < REL606/3023284‑3023210 CTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTT < 2:1677146/76‑1CTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTT > 1:1520043/1‑76 TATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTA < 1:1159876/76‑1 TATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTA > 2:1487168/1‑76 TATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTA > 2:1108291/1‑76 ATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTAT > 1:1811687/1‑76 ATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTAT < 1:365019/76‑1 ATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTAT > 1:945553/1‑76 TATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATT > 1:1732074/1‑76 TATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATT > 2:413464/1‑76 ATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGCTGATT > 2:608995/1‑76 GTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAA > 2:1704834/1‑76 TTATTGTCATATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTAT > 2:1208196/1‑76 ATTGTCATATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATAC > 2:378651/1‑76 ATTGTCATATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATAC > 2:378639/1‑76 TATTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTT > 2:436336/1‑76 TTAACATCTATTTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAA > 2:1274639/1‑76 TTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGG > 2:625388/1‑76 TTATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGG > 1:1399024/1‑76 TATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGCGGG > 1:327439/1‑76 ATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGC > 1:1370928/1‑76 ATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGC > 2:1190722/1‑76 ATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGC > 1:820665/1‑76 ATTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGC > 1:820659/1‑76 TTGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGCA < 2:116283/76‑1 TGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGCAA > 2:1460330/1‑76 TGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGCAA > 1:1702822/1‑76 CTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3022651‑3022729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttattGTTGATATCCGTAAAGATGGAAGATGATTTGTAATTGATAGAGAATTATACGGGTGTTAATTAACCGGTGGGCAA < REL606/3023284‑3023210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |