| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3022729 | 130 (2.300) | 7 (0.130) | 6/140 | 4.6 | 6.4% | intergenic (‑45/+529) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase |
| ? | REL606 | = 3023284 | 83 (1.570) | coding (439/465 nt) | ECB_02822 | bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATCTTTAACAATTATAA > REL606/3022654‑3022804 | tatatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtatttatt > 2:413464/1‑76 (MQ=255)tatatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtatttatt > 1:1732074/1‑76 (MQ=255) tatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTAtttattta > 2:1518191/1‑76 (MQ=255) atatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATttatttat < 1:350312/76‑1 (MQ=255) atatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATttatttat < 2:509114/76‑1 (MQ=255) atatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATttatttat < 1:350333/76‑1 (MQ=255) tatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATg > 2:1106021/1‑76 (MQ=255) tatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATg > 2:534882/1‑76 (MQ=255) 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2:28045/76‑1 (MQ=255) attGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTaa < 2:417033/76‑1 (MQ=255) attGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTaa < 2:889675/76‑1 (MQ=255) ttGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAat < 1:117270/76‑1 (MQ=255) atGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAat > 1:1021477/2‑76 (MQ=255) cATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATAtttt > 2:518092/1‑76 (MQ=255) aTAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTta > 1:810442/1‑76 (MQ=255) aTAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTta > 1:311134/1‑76 (MQ=255) aTGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATaa < 2:1112616/76‑1 (MQ=255) aTGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATaa < 1:17943/76‑1 (MQ=255) aTGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATaa < 1:919678/76‑1 (MQ=255) tGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATaaa < 1:1774752/76‑1 (MQ=255) tGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATaaa > 1:792591/1‑76 (MQ=255) tATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATg < 1:101966/76‑1 (MQ=255) tGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGtt < 1:1256038/76‑1 (MQ=255) gCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGtta > 1:1063829/1‑76 (MQ=255) gCCCCTTGTACTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGtta < 2:1283520/76‑1 (MQ=255) ccccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttat < 1:1697680/76‑1 (MQ=255) ccccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttat > 2:796144/1‑76 (MQ=255) ccccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttat > 2:229124/1‑76 (MQ=255) ccccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttat > 2:503288/1‑76 (MQ=255) cccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttatt < 2:1738481/76‑1 (MQ=255) ccTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGttatta < 1:65568/76‑1 (MQ=255) cTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTaa < 1:1330411/76‑1 (MQ=255) cTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTaa > 1:1222714/1‑76 (MQ=255) cTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTaa < 2:182961/76‑1 (MQ=255) cTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTaa > 1:1222694/1‑76 (MQ=255) cTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTaa < 2:1581877/76‑1 (MQ=255) ttGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAAc < 2:1348468/76‑1 (MQ=255) 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2:589789/1‑76 (MQ=255) ttattGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGAcc > 1:1208196/1‑76 (MQ=255) tattGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACca > 1:592902/1‑76 (MQ=255) attGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcag > 1:378639/1‑76 (MQ=255) attGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcag > 1:378671/1‑76 (MQ=255) ttGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcagc < 1:1483530/76‑1 (MQ=255) tGTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcagca > 1:790772/1‑76 (MQ=255) gTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcagcag > 1:206941/1‑76 (MQ=255) gTCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACcagcag < 1:218909/76‑1 (MQ=255) tCATATTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAGTATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAgg > 2:1369268/1‑76 (MQ=255) 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1:436337/1‑76 (MQ=255) tatTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGttt > 1:436336/1‑76 (MQ=255) atTAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTa > 1:1006712/1‑76 (MQ=255) ttAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTAt > 1:1274639/1‑76 (MQ=255) ttAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTAt > 2:1498507/1‑76 (MQ=255) tAACATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATc > 1:183695/1‑76 (MQ=255) aaCATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATCt > 2:186176/1‑76 (MQ=255) cATCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATCttt < 2:1616735/76‑1 (MQ=255) aTCTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATCTTTa < 1:293722/76‑1 (MQ=255) cTATTTATTTATGATATCTCACAGGGTTTAATATTTTATAAATGTTATTAACAAGACCAGCAGGTTTATCTTTAAc > 1:292769/1‑76 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |